PDB-5pzx: Human liver fructose-1,6-bisphosphatase 1 (fructose 1,6-bisphosph...

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 5pzx

タイトル

Human liver fructose-1,6-bisphosphatase 1 (fructose 1,6-bisphosphate 1-phosphatase, E.C.3.1.3.11) complexed with the allosteric inhibitor 1-(5-bromo-1,3-thiazol-2-yl)-3-[4-methoxy-3-(2-methylpropyl)phenyl]sulfonylurea

要素

Fructose-1,6-bisphosphatase 1

キーワード

HYDROLASE/HYDROLASE INHIBITOR / D3R docking / HYDROLASE-HYDROLASE INHIBITOR complex

機能・相同性

機能・相同性情報

cellular response to raffinose / sucrose biosynthetic process / cellular hypotonic salinity response / cellular response to phorbol 13-acetate 12-myristate / fructose-bisphosphatase / fructose 1,6-bisphosphate 1-phosphatase activity / cellular response to magnesium ion / Gluconeogenesis / negative regulation of Ras protein signal transduction / fructose 6-phosphate metabolic process ...
類似検索 - 分子機能

生物種

Homo sapiens (ヒト)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 2.75 Å

Model details

For D3R project

データ登録者

Ruf, A. / Joseph, C. / Alker, A. / Banner, D. / Tetaz, T. / Benz, J. / Kuhn, B. / Rudolph, M.G. / Yang, H. / Shao, C. / Burley, S.K.

引用

ジャーナル: To be published
タイトル: Human liver fructose-1,6-bisphosphatase 1 (fructose 1,6-bisphosphate 1-phosphatase, E.C.3.1.3.11) complexed with the allosteric inhibitor 1-(5-bromo-1,3-thiazol-2-yl)-3-[4-methoxy-3-(2- ...
著者: Ruf, A. / Joseph, C. / Alker, A. / Banner, D. / Tetaz, T. / Benz, J. / Kuhn, B. / Rudolph, M.G.

履歴

登録	2017年4月18日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.0	2019年1月9日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2019年1月16日	Group: Data collection / カテゴリ: diffrn_radiation / Item: _diffrn_radiation.pdbx_diffrn_protocol
改定 1.2	2019年2月6日	Group: Data collection / Database references / Structure summary カテゴリ: audit_author / citation_author / Item: _audit_author.name / _citation_author.name
改定 1.3	2021年2月10日	Group: Structure summary / カテゴリ: audit_author / Item: _audit_author.identifier_ORCID
改定 1.4	2024年3月6日	Group: Data collection / Database references / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / struct_ncs_dom_lim Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_seq_id / _struct_ncs_dom_lim.end_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_seq_id

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	5pzx.cif.gz	961.1 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb5pzx.ent.gz	806.4 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	5pzx.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

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検証レポート

文書・要旨	5pzx_validation.pdf.gz	2.4 MB	表示	wwPDB検証レポート
文書・詳細版	5pzx_full_validation.pdf.gz	2.5 MB	表示
XML形式データ	5pzx_validation.xml.gz	88 KB	表示
CIF形式データ	5pzx_validation.cif.gz	117.9 KB	表示
アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/pz/5pzx ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/pz/5pzx	HTTPS FTP

-
グループ登録

ID	G_1002030 (23エントリ) 5pzq 5pzr 5pzs 5pzt 5pzu 5pzv 5pzw 5pzx 5pzy 5pzz
タイトル	Human liver fructose-1,6-bisphosphatase 1 (fructose 1,6-bisphosphate 1-phosphatase, E.C.3.1.3.11) complexed with allosteric inhibitors
タイプ	undefined
解説	Fructose-1,6-bisphosphatase 1 with inhibitors

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関連構造データ

類似構造データ	2wbd-2 2fix-d 5pzy-1 5q06-d 4fbp-d 5q05-1 6lw2-d 2fie-d 5q0a-d 5q07-1 5pzz-1 2wbb-2 5q01-1 5q0b-d 2vt5-1 5q08-1 5q07-2 5pzu-d 4mjo-2 5pzr-d Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

類似構造データ

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リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI
「今月の分子」の関連する項目	#50 - 2004年2月解糖系酵素 (Glycolytic Enzymes) 類似性 (1)

登録構造単位

A: Fructose-1,6-bisphosphatase 1

B: Fructose-1,6-bisphosphatase 1

C: Fructose-1,6-bisphosphatase 1

D: Fructose-1,6-bisphosphatase 1

E: Fructose-1,6-bisphosphatase 1

F: Fructose-1,6-bisphosphatase 1

G: Fructose-1,6-bisphosphatase 1

H: Fructose-1,6-bisphosphatase 1

ヘテロ分子

298 kDa, 8 ポリマー
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1

A: Fructose-1,6-bisphosphatase 1

B: Fructose-1,6-bisphosphatase 1

C: Fructose-1,6-bisphosphatase 1

D: Fructose-1,6-bisphosphatase 1

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
149 kDa, 4 ポリマー
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2

E: Fructose-1,6-bisphosphatase 1

F: Fructose-1,6-bisphosphatase 1

G: Fructose-1,6-bisphosphatase 1

H: Fructose-1,6-bisphosphatase 1

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
149 kDa, 4 ポリマー
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単位格子

Length a, b, c (Å)	66.363, 284.602, 83.312
Angle α, β, γ (deg.)	90.000, 97.710, 90.000
Int Tables number	4
Space group name H-M	P12₁1

非結晶学的対称性 (NCS)

NCSドメイン:

ID	Ens-ID	詳細
1	1	(chain A and (resid 9 through 61 or resid 72...
2	1	(chain B and (resid 9 through 139 or resid 141 through 176 or resid 178 through 335))
3	1	(chain C and (resid 9 through 139 or resid 141 through 176 or resid 178 through 335))
4	1	(chain D and (resid 9 through 139 or resid 141 through 176 or resid 178 through 335))
5	1	(chain E and (resid 9 through 61 or resid 72...
6	1	(chain F and (resid 9 through 139 or resid 141 through 176 or resid 178 through 335))
7	1	(chain G and (resid 9 through 139 or resid 141 through 176 or resid 178 through 335))
8	1	(chain H and (resid 9 through 139 or resid 141 through 176 or resid 178 through 335))

NCSドメイン領域:

Ens-ID: 1

Dom-ID	Component-ID	Beg auth comp-ID	Beg label comp-ID	End auth comp-ID	End label comp-ID	Selection details	Auth asym-ID	Label asym-ID	Auth seq-ID	Label seq-ID
1	1	ASP	ASP	GLY	GLY	(chain A and (resid 9 through 61 or resid 72...	A	A	9 - 61	10 - 62
1	2	LYS	LYS	TYR	TYR	(chain A and (resid 9 through 61 or resid 72...	A	A	72 - 139	73 - 140
1	3	LYS	LYS	ALA	ALA	(chain A and (resid 9 through 61 or resid 72...	A	A	141 - 176	142 - 177
1	4	ASP	ASP	SER	SER	(chain A and (resid 9 through 61 or resid 72...	A	A	178 - 335	179 - 336
2	1	ASP	ASP	TYR	TYR	(chain B and (resid 9 through 139 or resid 141 through 176 or resid 178 through 335))	B	B	9 - 139	10 - 140
2	2	LYS	LYS	ALA	ALA	(chain B and (resid 9 through 139 or resid 141 through 176 or resid 178 through 335))	B	B	141 - 176	142 - 177
2	3	ASP	ASP	SER	SER	(chain B and (resid 9 through 139 or resid 141 through 176 or resid 178 through 335))	B	B	178 - 335	179 - 336
3	1	ASP	ASP	TYR	TYR	(chain C and (resid 9 through 139 or resid 141 through 176 or resid 178 through 335))	C	C	9 - 139	10 - 140
3	2	LYS	LYS	ALA	ALA	(chain C and (resid 9 through 139 or resid 141 through 176 or resid 178 through 335))	C	C	141 - 176	142 - 177
3	3	ASP	ASP	SER	SER	(chain C and (resid 9 through 139 or resid 141 through 176 or resid 178 through 335))	C	C	178 - 335	179 - 336
4	1	ASP	ASP	TYR	TYR	(chain D and (resid 9 through 139 or resid 141 through 176 or resid 178 through 335))	D	D	9 - 139	10 - 140
4	2	LYS	LYS	ALA	ALA	(chain D and (resid 9 through 139 or resid 141 through 176 or resid 178 through 335))	D	D	141 - 176	142 - 177
4	3	ASP	ASP	SER	SER	(chain D and (resid 9 through 139 or resid 141 through 176 or resid 178 through 335))	D	D	178 - 335	179 - 336
5	1	ASP	ASP	GLY	GLY	(chain E and (resid 9 through 61 or resid 72...	E	E	9 - 61	10 - 62
5	2	LYS	LYS	TYR	TYR	(chain E and (resid 9 through 61 or resid 72...	E	E	72 - 139	73 - 140
5	3	LYS	LYS	ALA	ALA	(chain E and (resid 9 through 61 or resid 72...	E	E	141 - 176	142 - 177
5	4	ASP	ASP	SER	SER	(chain E and (resid 9 through 61 or resid 72...	E	E	178 - 335	179 - 336
6	1	ASP	ASP	TYR	TYR	(chain F and (resid 9 through 139 or resid 141 through 176 or resid 178 through 335))	F	F	9 - 139	10 - 140
6	2	LYS	LYS	ALA	ALA	(chain F and (resid 9 through 139 or resid 141 through 176 or resid 178 through 335))	F	F	141 - 176	142 - 177
6	3	ASP	ASP	SER	SER	(chain F and (resid 9 through 139 or resid 141 through 176 or resid 178 through 335))	F	F	178 - 335	179 - 336
7	1	ASP	ASP	TYR	TYR	(chain G and (resid 9 through 139 or resid 141 through 176 or resid 178 through 335))	G	G	9 - 139	10 - 140
7	2	LYS	LYS	ALA	ALA	(chain G and (resid 9 through 139 or resid 141 through 176 or resid 178 through 335))	G	G	141 - 176	142 - 177
7	3	ASP	ASP	SER	SER	(chain G and (resid 9 through 139 or resid 141 through 176 or resid 178 through 335))	G	G	178 - 335	179 - 336
8	1	ASP	ASP	TYR	TYR	(chain H and (resid 9 through 139 or resid 141 through 176 or resid 178 through 335))	H	H	9 - 139	10 - 140
8	2	LYS	LYS	ALA	ALA	(chain H and (resid 9 through 139 or resid 141 through 176 or resid 178 through 335))	H	H	141 - 176	142 - 177
8	3	ASP	ASP	SER	SER	(chain H and (resid 9 through 139 or resid 141 through 176 or resid 178 through 335))	H	H	178 - 335	179 - 336

#1: タンパク質	Fructose-1,6-bisphosphatase 1 / Growth-inhibiting protein 17 / cDNA FLJ75786 / highly similar to Homo sapiens fructose-1 / 6- ...Growth-inhibiting protein 17 / cDNA FLJ75786 / highly similar to Homo sapiens fructose-1 / 6-bisphosphatase 1 (FBP1) / mRNA 分子量: 36859.418 Da / 分子数: 8 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: FBP1, hCG_1640493 / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) 参照: UniProt: Q2TU34, UniProt: P09467*PLUS, fructose-bisphosphatase
#2: 化合物	ChemComp-94S / N-[(5-bromo-1,3-thiazol-2-yl)carbamoyl]-4-methoxy-3-(2-methylpropyl)benzene-1-sulfonamide 分子量: 448.355 Da / 分子数: 8 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₁₅H₁₈BrN₃O₄S₂
#3: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 229 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.73 Å³/Da / 溶媒含有率: 54.96 %
結晶化	温度: 300 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / pH: 7 詳細: 0.1M HEPES pH 7.0, 0.1M AMMONIUM ACETATE, 12%-25% PEG 3350

-
データ収集

回折	平均測定温度: 100 K
放射光源	由来: シンクロトロン / サイト: SLS / ビームライン: X10SA / 波長: 0.987 Å
検出器	タイプ: MAR CCD 165 mm / 検出器: CCD / 日付: 2005年12月6日
放射	プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 0.987 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 2.75→29.898 Å / Num. obs: 78913 / % possible obs: 99.88 %

-
位相決定

位相決定	手法: 分子置換

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類	NB
PHENIX	1.11.1_2575	精密化
PDB_EXTRACT	3.23	データ抽出

精密化

構造決定の手法:

分子置換 / 解像度: 2.75→29.898 Å / SU ML: 0.42 / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 1.35 / 位相誤差: 26.25 / 立体化学のターゲット値: ML

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.2511	3964	5.02 %
R_work	0.1786	74949	-
obs	0.1823	78913	99.88 %

溶媒の処理

減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL

原子変位パラメータ

B_iso max: 166.56 Å² / B_iso mean: 57.4605 Å² / B_iso min: 11.86 Å²

精密化ステップ

サイクル: final / 解像度: 2.75→29.898 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	19440	0	200	229	19869
B_iso mean	-	-	67.73	41.4	-
残基数	-	-	-	-	2540

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	数
X-RAY DIFFRACTION	f_bond_d	0.008	20029
X-RAY DIFFRACTION	f_angle_d	1.097	27062
X-RAY DIFFRACTION	f_chiral_restr	0.064	3055
X-RAY DIFFRACTION	f_plane_restr	0.007	3450
X-RAY DIFFRACTION	f_dihedral_angle_d	11.697	12166

Refine LS restraints NCS

Ens-ID	Dom-ID	Auth asym-ID	数	Refine-ID	Rms	タイプ
1	1	A	12124	X-RAY DIFFRACTION	10.355	TORSIONAL
1	2	B	12124	X-RAY DIFFRACTION	10.355	TORSIONAL
1	3	C	12124	X-RAY DIFFRACTION	10.355	TORSIONAL
1	4	D	12124	X-RAY DIFFRACTION	10.355	TORSIONAL
1	5	E	12124	X-RAY DIFFRACTION	10.355	TORSIONAL
1	6	F	12124	X-RAY DIFFRACTION	10.355	TORSIONAL
1	7	G	12124	X-RAY DIFFRACTION	10.355	TORSIONAL
1	8	H	12124	X-RAY DIFFRACTION	10.355	TORSIONAL

LS精密化シェル

Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION / R_factor R_free error: 0 / Total num. of bins used: 28

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	R_factor R_work	Num. reflection R_work	Num. reflection all	% reflection obs (%)
2.75-2.7835	0.3619	136	0.2733	2623	2759	98
2.7835-2.8187	0.3612	129	0.2716	2632	2761	100
2.8187-2.8558	0.3677	164	0.2649	2663	2827	100
2.8558-2.8949	0.3561	162	0.2579	2705	2867	100
2.8949-2.9362	0.2953	149	0.2396	2634	2783	100
2.9362-2.98	0.3113	143	0.2254	2698	2841	100
2.98-3.0265	0.3262	141	0.23	2658	2799	100
3.0265-3.0761	0.314	132	0.2228	2696	2828	100
3.0761-3.1291	0.2914	111	0.2269	2678	2789	100
3.1291-3.1859	0.2993	155	0.2186	2689	2844	100
3.1859-3.2471	0.3157	120	0.2119	2661	2781	100
3.2471-3.3133	0.2824	129	0.2062	2741	2870	100
3.3133-3.3853	0.2898	147	0.2041	2603	2750	100
3.3853-3.4639	0.2857	153	0.1959	2707	2860	100
3.4639-3.5504	0.2653	115	0.1854	2706	2821	100
3.5504-3.6462	0.2406	143	0.1838	2679	2822	100
3.6462-3.7533	0.2648	162	0.1758	2633	2795	100
3.7533-3.8742	0.2578	148	0.1795	2682	2830	100
3.8742-4.0124	0.2429	149	0.1638	2650	2799	100
4.0124-4.1726	0.2227	140	0.1569	2738	2878	100
4.1726-4.362	0.2235	135	0.1546	2665	2800	100
4.362-4.5912	0.2142	166	0.1386	2635	2801	100
4.5912-4.8777	0.2107	124	0.1288	2704	2828	100
4.8777-5.2524	0.1959	141	0.1399	2692	2833	100
5.2524-5.7776	0.2096	126	0.1577	2681	2807	100
5.7776-6.6057	0.2498	154	0.1729	2718	2872	100
6.6057-8.293	0.2337	140	0.1583	2699	2839	100
8.293-29.9002	0.1921	150	0.1573	2679	2829	100

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	0.0989	-0.0397	-0.0499	0.0172	0.0167	0.015	-0.0218	0.0849	0.0391	0.017	-0.0364	-0.1047	-0.1045	-0.0046	0	0.3444	-0.0157	-0.0192	0.2964	0.0639	0.2998	36.8563	16.015	-5.6354
2	0.0677	-0.0848	-0.0185	0.1293	0.0077	0.0346	-0.0793	0.0992	0.0423	-0.3758	0.0378	0.1691	-0.0775	0.0149	0.0302	0.159	-0.0065	-0.1314	0.1232	0.0839	0.2787	19.2464	22.7951	-8.0757
3	0.0541	-0.0131	-0.0002	0.0107	0.0113	0.0087	-0.0275	-0.0397	0.1574	-0.0745	0.0414	0.114	-0.177	-0.0586	-0.0004	0.395	-0.0182	-0.1408	0.1478	0.0339	0.3723	17.4429	31.3171	-10.4198
4	0.127	-0.1122	-0.0021	0.0895	-0.0068	0.065	0.1077	-0.1352	-0.2055	-0.082	0.0397	0.1794	-0.0006	0.0059	0.1264	-0.2652	0.0972	0.0859	0.1949	0.0683	0.2871	11.5102	-1.4448	15.1002
5	0.0382	0.0541	-0.0097	0.0505	0.0001	0.1488	-0.0775	-0.0818	0.0225	0.1835	-0.0525	0.0986	-0.123	-0.0167	-0.0325	0.1388	0.0183	0.0435	0.2334	0.0058	0.3039	11.2866	9.4871	20.8668
6	0.007	-0.0051	-0.0066	0.0001	0.0018	0.0246	0.0595	0.0295	0.049	-0.0311	0.0561	0.0372	0.0026	0.0889	0.0065	0.1865	0.1294	-0.0358	0.2822	-0.0901	0.6249	2.4108	32.1405	9.647
7	0.0236	0.0107	-0.0411	0.0238	-0.0379	0.0395	0.0537	-0.1153	-0.0368	0.0988	0.057	0.0998	-0.0635	-0.044	0.0529	0.0895	0.1339	0.0136	0.3478	-0.0276	0.6268	0.2641	19.0654	17.5322
8	0.011	0.013	0.0223	0.1363	0.0497	0.044	-0.0363	-0.013	-0.0476	-0.2399	0.0139	0.0441	-0.0577	0.098	0.0001	0.331	0.048	0.0379	0.2815	0.065	0.1986	38.9648	-9.743	-12.4291
9	0.1324	-0.087	0.0596	0.1269	-0.1897	0.3677	0.0897	0.0705	0.0483	-0.235	-0.0723	-0.0347	0.4219	0.0307	0.0954	0.0069	0.0604	0.1183	0.2771	0.0772	0.2795	56.4456	-21.7219	-4.1514
10	0.1109	-0.1152	0.0685	0.1849	-0.0255	0.0545	-0.0999	0.0266	0.0827	0.1547	0.007	-0.0798	-0.0831	-0.0881	-0.009	0.1493	0.0462	0.0394	0.2707	-0.0129	0.21	37.0534	-7.4818	26.4789
11	0.0368	0.0433	-0.0418	0.0251	-0.0315	0.0371	-0.0218	-0.0274	0.0108	0.0685	0.0433	0.0102	0.1053	0.0926	-0	0.168	0.0691	-0.0073	0.223	0.0417	0.2365	41.9113	-26.8301	14.5266
12	0.0123	-0.028	-0.006	0.03	0.012	0.0091	-0.1239	-0.0403	0.0417	-0.1022	-0.0056	-0.0296	0.1844	0.0232	0	0.3198	0.0711	0.0212	0.3153	0.0258	0.3108	47.2614	-26.9698	24.8648
13	0.015	0.0454	0.0044	0.0595	0.021	0.0099	0.149	0.0096	-0.0917	0.0757	0.0599	-0.0962	-0.1581	0.0927	0.0051	0.46	0.0055	-0.0103	0.3499	0.0322	0.3001	-1.2352	51.0951	42.3287
14	0.0884	-0.0247	-0.057	0.0512	0.0642	0.0912	-0.1362	0.043	-0.3213	0.034	-0.0394	0.0534	0.0652	0.1323	-0.029	0.5737	-0.0067	-0.0678	0.2688	0.1049	0.3867	-5.3256	41.5183	45.9919
15	-0.0003	-0.0011	-0.001	0.0206	0.0309	0.0622	0.0012	-0.0824	-0.2242	0.1192	0.0536	0.1295	-0.2219	-0.0244	0.0002	0.3821	-0.0511	0.0059	0.2506	-0.0021	0.4695	-24.787	43.6042	38.0628
16	-0.0025	0.0134	0.0001	0.0146	-0.0016	0.0163	-0.0132	0.0015	-0.0776	0.0196	-0.1033	-0.0573	0.0555	-0.0817	0	0.41	-0.0917	0.0204	0.3383	0.0405	0.5385	-21.5499	34.3609	45.4246
17	0.0275	-0.001	0.0035	0.0024	-0.0025	0.0127	0.0473	0.0529	0.0311	0.0099	-0.0027	-0.0482	-0.0393	-0.0226	-0.0001	0.4691	-0.1105	0.0321	0.5872	-0.0186	0.3464	-5.7035	65.2655	3.7006
18	0.062	0.0121	-0.0112	0.0391	0.013	0.0129	0.0735	0.0899	-0.0927	0.1438	0.0785	0.1054	-0.0829	-0.1153	-0.0001	0.4573	0.0564	-0.0136	0.4441	0.0242	0.3461	-22.3145	68.7308	19.2605
19	0.0489	0.0124	-0.0051	0.013	-0.0112	0.0168	-0.0032	0.1625	-0.2167	-0.1252	0.002	0.02	-0.1257	0.0361	-0.0001	0.4512	0.0256	-0.049	0.4982	-0.0758	0.362	-18.6999	57.1079	10.985
20	0.0083	-0.0058	0.0002	-0.0002	0.0061	0.0171	-0.0057	0.0424	-0.0089	0.1022	0.0606	0.0181	-0.0423	0.0107	-0	0.4333	-0.0815	-0.0147	0.4772	-0.1301	0.6166	-30.2134	40.2363	18.9964
21	0.0192	0.0126	0.0137	0.0038	0.0068	-0.0025	0.0495	0.1436	-0.1161	-0.0081	0.1395	0.0941	-0.0072	0.0825	-0	0.4011	0.0316	-0.0982	0.6091	-0.1421	0.5634	-31.4538	48.6378	8.8164
22	0.0885	0.0412	-0.0179	0.0497	0.0209	0.0013	0.0304	-0.1023	0.0065	0.0449	0.0418	0.1038	0.0064	-0.1004	-0	0.4131	-0.0698	0.0029	0.2588	0.0045	0.2219	-2.582	75.4023	49.1096
23	0.1214	-0.0369	0.0929	0.0446	-0.0478	0.0949	0.0628	-0.0721	0.0493	0.2128	-0.0236	0.0306	0.0372	0.0986	0	0.318	-0.0583	0.0032	0.2786	-0.0226	0.2193	15.9419	84.7819	49.0516
24	0.0701	0.0396	-0.0046	0.0185	0.0005	-0.0004	0.0761	0.1239	-0.1127	-0.1201	0.063	-0.0216	0.1406	-0.1763	-0.0001	0.463	-0.0293	-0.1006	0.3835	0.0009	0.2689	2.1429	70.7477	16.3805
25	0.0532	-0.0192	-0.0266	0.0546	-0.0272	0.0365	0.0393	-0.1407	-0.0284	-0.0787	0.0992	-0.0739	0.1236	0.0227	-0	0.5644	-0.04	0.0147	0.3814	-0.0319	0.2363	10.5547	77.2215	11.2841
26	0.0308	-0.0244	0.0057	0.0552	-0.0674	0.0604	0.11	0.0037	0.0375	-0.0537	0.0398	0.0086	0.0398	0.0755	-0	0.5061	-0.0878	0.0388	0.3954	0.0016	0.3673	13.1037	95.8313	27.5201
27	0.0195	0.0307	0.0183	0.0098	0.0107	0.0272	0.0012	0.1205	-0.0014	-0.1629	-0.0024	0.0358	0.093	0.0861	0	0.5264	-0.0569	0.0163	0.4303	0.022	0.3235	17.749	92.8575	17.0122

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Selection details	Auth asym-ID	Auth seq-ID
1	X-RAY DIFFRACTION	1	chain 'A' and (resid 9 through 122 )	A	9 - 122
2	X-RAY DIFFRACTION	2	chain 'A' and (resid 123 through 247 )	A	123 - 247
3	X-RAY DIFFRACTION	3	chain 'A' and (resid 248 through 335 )	A	248 - 335
4	X-RAY DIFFRACTION	4	chain 'B' and (resid 9 through 140 )	B	9 - 140
5	X-RAY DIFFRACTION	5	chain 'B' and (resid 141 through 212 )	B	141 - 212
6	X-RAY DIFFRACTION	6	chain 'B' and (resid 213 through 247 )	B	213 - 247
7	X-RAY DIFFRACTION	7	chain 'B' and (resid 248 through 335 )	B	248 - 335
8	X-RAY DIFFRACTION	8	chain 'C' and (resid 9 through 187 )	C	9 - 187
9	X-RAY DIFFRACTION	9	chain 'C' and (resid 188 through 335 )	C	188 - 335
10	X-RAY DIFFRACTION	10	chain 'D' and (resid 9 through 167 )	D	9 - 167
11	X-RAY DIFFRACTION	11	chain 'D' and (resid 168 through 247 )	D	168 - 247
12	X-RAY DIFFRACTION	12	chain 'D' and (resid 248 through 335 )	D	248 - 335
13	X-RAY DIFFRACTION	13	chain 'E' and (resid 9 through 106 )	E	9 - 106
14	X-RAY DIFFRACTION	14	chain 'E' and (resid 107 through 167 )	E	107 - 167
15	X-RAY DIFFRACTION	15	chain 'E' and (resid 168 through 274 )	E	168 - 274
16	X-RAY DIFFRACTION	16	chain 'E' and (resid 275 through 335 )	E	275 - 335
17	X-RAY DIFFRACTION	17	chain 'F' and (resid 9 through 28 )	F	9 - 28
18	X-RAY DIFFRACTION	18	chain 'F' and (resid 29 through 140 )	F	29 - 140
19	X-RAY DIFFRACTION	19	chain 'F' and (resid 141 through 212 )	F	141 - 212
20	X-RAY DIFFRACTION	20	chain 'F' and (resid 213 through 274 )	F	213 - 274
21	X-RAY DIFFRACTION	21	chain 'F' and (resid 275 through 335 )	F	275 - 335
22	X-RAY DIFFRACTION	22	chain 'G' and (resid 9 through 140 )	G	9 - 140
23	X-RAY DIFFRACTION	23	chain 'G' and (resid 141 through 335 )	G	141 - 335
24	X-RAY DIFFRACTION	24	chain 'H' and (resid 9 through 88 )	H	9 - 88
25	X-RAY DIFFRACTION	25	chain 'H' and (resid 89 through 187 )	H	89 - 187
26	X-RAY DIFFRACTION	26	chain 'H' and (resid 188 through 247 )	H	188 - 247
27	X-RAY DIFFRACTION	27	chain 'H' and (resid 248 through 335 )	H	248 - 335

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万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
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