温度: 277 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / pH: 8.5 詳細: 16 mg/ml protein in 20mM Tris/HCl pH 8.4, 5 mM benzamidine, 0.1 M NaCl, 50 mM CaCl2 mixed 1+1 with 32-35% AMMONIUM SULPHATE, 2% PEG 4000, 0.1 M Bicine-NaOH pH 8.5, 15% glycerol
-
データ収集
回折
平均測定温度: 100 K
放射光源
由来: 回転陽極 / タイプ: BRUKER AXS MICROSTAR / 波長: 1.54178 Å
検出器
タイプ: MAR scanner 345 mm plate / 検出器: IMAGE PLATE / 日付: 2007年2月2日
放射
プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長
波長: 1.54178 Å / 相対比: 1
反射
解像度: 1.98→50 Å / Num. obs: 37699 / % possible obs: 98.7 % / 冗長度: 11.4 % / Rmerge(I) obs: 0.1 / Χ2: 1.006 / Net I/av σ(I): 23.194 / Net I/σ(I): 9.6 / Num. measured all: 428795
反射 シェル
Diffraction-ID: 1 / Rejects: _
解像度 (Å)
冗長度 (%)
Rmerge(I) obs
Num. unique all
Χ2
% possible all
1.98-2.05
7.9
0.603
3250
1.072
86.9
2.05-2.13
11.4
0.435
3745
0.956
100
2.13-2.23
11.5
0.357
3757
0.977
100
2.23-2.35
11.6
0.277
3771
1.012
100
2.35-2.49
11.8
0.23
3763
1.023
100
2.49-2.69
11.8
0.174
3795
1.015
100
2.69-2.96
11.9
0.127
3801
1.014
100
2.96-3.39
11.9
0.083
3841
1.013
100
3.39-4.26
11.9
0.06
3886
1.016
100
4.26-50
11.4
0.044
4090
0.985
99.7
-
解析
ソフトウェア
名称
バージョン
分類
NB
SCALEPACK
データスケーリング
REFMAC
5.2.0019
精密化
PDB_EXTRACT
3.22
データ抽出
XDS
データ削減
PHASER
位相決定
精密化
構造決定の手法: 分子置換 開始モデル: inhouse model 解像度: 1.98→49.57 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.956 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.939 / SU B: 2.476 / SU ML: 0.072 / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 0 / ESU R: 0.122 / ESU R Free: 0.115 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD 詳細: the numbering follows that of the unprocessed precursor since insertion codes are not accepted by most programs and distinction between light and heavy chains seems cumbersome. the R- ...詳細: the numbering follows that of the unprocessed precursor since insertion codes are not accepted by most programs and distinction between light and heavy chains seems cumbersome. the R-enantiomer is bound exclusively ARG A 204 ILE A 213 gap ALA A 375 SER A 380 gap. HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS
Rfactor
反射数
%反射
Selection details
Rfree
0.1931
1795
5 %
RANDOM
Rwork
0.1675
-
-
-
obs
0.1688
34095
94.73 %
-
溶媒の処理
イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å / 溶媒モデル: BABINET MODEL WITH MASK