登録情報 データベース : PDB / ID : 5nri 構造の表示 ダウンロードとリンクタイトル Crystal structure of Burkholderia pseudomallei D-alanine-D-alanine ligase in complex with AMP and D-Ala-D-Ala 要素D-alanine--D-alanine ligase 詳細 キーワード LIGASE / complex機能・相同性 機能・相同性情報分子機能 ドメイン・相同性 構成要素
D-alanine-D-alanine ligase / D-alanine-D-alanine ligase activity / peptidoglycan biosynthetic process / cell wall organization / regulation of cell shape / ATP binding / metal ion binding / cytosol 類似検索 - 分子機能 D-alanine--D-alanine ligase/VANA/B/C, conserved site / D-alanine--D-alanine ligase / D-alanine--D-alanine ligase, N-terminal domain / D-ala D-ala ligase N-terminus / D-alanine--D-alanine ligase signature 1. / D-alanine--D-alanine ligase signature 2. / D-alanine--D-alanine ligase, C-terminal / D-ala D-ala ligase C-terminus / Rossmann fold - #20 / ATP-grasp fold, A domain ... D-alanine--D-alanine ligase/VANA/B/C, conserved site / D-alanine--D-alanine ligase / D-alanine--D-alanine ligase, N-terminal domain / D-ala D-ala ligase N-terminus / D-alanine--D-alanine ligase signature 1. / D-alanine--D-alanine ligase signature 2. / D-alanine--D-alanine ligase, C-terminal / D-ala D-ala ligase C-terminus / Rossmann fold - #20 / ATP-grasp fold, A domain / ATP-grasp fold, subdomain 1 / Pre-ATP-grasp domain superfamily / ATP-grasp fold / ATP-grasp fold profile. / Dna Ligase; domain 1 / Rossmann fold / 2-Layer Sandwich / 3-Layer(aba) Sandwich / Alpha Beta 類似検索 - ドメイン・相同性 ADENOSINE MONOPHOSPHATE / D-ALANINE / TRIETHYLENE GLYCOL / D-alanine--D-alanine ligase 類似検索 - 構成要素生物種 Burkholderia pseudomallei (類鼻疽菌)手法 X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度 : 1.5 Å 詳細データ登録者 Diaz-Saez, L. / Hunter, W.N. 引用ジャーナル : Febs J. / 年 : 2019タイトル : Burkholderia pseudomallei d-alanine-d-alanine ligase; detailed characterisation and assessment of a potential antibiotic drug target.著者 : Diaz-Saez, L. / Torrie, L.S. / McElroy, S.P. / Gray, D. / Hunter, W.N. 履歴 登録 2017年4月23日 登録サイト : PDBE / 処理サイト : PDBE改定 1.0 2018年5月30日 Provider : repository / タイプ : Initial release改定 1.1 2019年8月28日 Group : Data collection / Database references / カテゴリ : citation / citation_authorItem : _citation.country / _citation.journal_abbrev ... _citation.country / _citation.journal_abbrev / _citation.journal_id_CSD / _citation.journal_id_ISSN / _citation.pdbx_database_id_DOI / _citation.pdbx_database_id_PubMed / _citation.title / _citation.year 改定 1.2 2019年10月16日 Group : Data collection / カテゴリ : reflns_shell改定 1.3 2024年5月1日 Group : Advisory / Data collection ... Advisory / Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ : chem_comp_atom / chem_comp_bond ... chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / pdbx_struct_conn_angle / pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms / struct_conn Item : _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ... _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
すべて表示 表示を減らす