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Open data
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Basic information
| Entry | Database: PDB / ID: 5mkc | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Title | Crystal structure of the RrgA Jo.In complex | |||||||||
Components | Cell wall surface anchor family protein (Jo),Cell wall surface anchor family protein (In) | |||||||||
Keywords | CELL ADHESION / Bacteria / peptidoglycan / pilus adhesin / cross-links / folding / post-translational / isopeptide bond / biotechnology | |||||||||
| Function / homology | Function and homology informationmembrane => GO:0016020 / extracellular region / metal ion binding / membrane Similarity search - Function | |||||||||
| Biological species | ![]() | |||||||||
| Method | X-RAY DIFFRACTION / SYNCHROTRON / MOLECULAR REPLACEMENT / Resolution: 2.04 Å | |||||||||
Authors | Bonnet, J. / Cartannaz, J. / Tourcier, G. / Contreras-Martel, C. / Kleman, J.P. / Fenel, D. / Schoehn, G. / Morlot, C. / Vernet, T. / Di Guilmi, A.M. | |||||||||
| Funding support | France, 2items
| |||||||||
Citation | Journal: Sci Rep / Year: 2017Title: Autocatalytic association of proteins by covalent bond formation: a Bio Molecular Welding toolbox derived from a bacterial adhesin. Authors: Bonnet, J. / Cartannaz, J. / Tourcier, G. / Contreras-Martel, C. / Kleman, J.P. / Morlot, C. / Vernet, T. / Di Guilmi, A.M. #1: Journal: Structure / Year: 2010Title: Structural basis of host cell recognition by the pilus adhesin from Streptococcus pneumoniae. Authors: Izore, T. / Contreras-Martel, C. / El Mortaji, L. / Manzano, C. / Terrasse, R. / Vernet, T. / Di Guilmi, A.M. / Dessen, A. | |||||||||
| History |
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Structure visualization
| Structure viewer | Molecule: Molmil Jmol/JSmol |
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Downloads & links
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Download
| PDBx/mmCIF format | 5mkc.cif.gz | 532.9 KB | Display | PDBx/mmCIF format |
|---|---|---|---|---|
| PDB format | pdb5mkc.ent.gz | 438.1 KB | Display | PDB format |
| PDBx/mmJSON format | 5mkc.json.gz | Tree view | PDBx/mmJSON format | |
| Others | Other downloads |
-Validation report
| Summary document | 5mkc_validation.pdf.gz | 487.8 KB | Display | wwPDB validaton report |
|---|---|---|---|---|
| Full document | 5mkc_full_validation.pdf.gz | 498.3 KB | Display | |
| Data in XML | 5mkc_validation.xml.gz | 55.7 KB | Display | |
| Data in CIF | 5mkc_validation.cif.gz | 79.8 KB | Display | |
| Arichive directory | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/mk/5mkc ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/mk/5mkc | HTTPS FTP |
-Related structure data
| Related structure data | ![]() 2ww8S S: Starting model for refinement |
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| Similar structure data |
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Links
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Assembly
| Deposited unit | ![]()
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| Unit cell |
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| Noncrystallographic symmetry (NCS) | NCS domain:
NCS domain segments: Component-ID: _ / Refine code: _
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X-RAY DIFFRACTION
France, 2items
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