登録情報 データベース : PDB / ID : 5l6l 構造の表示 ダウンロードとリンクタイトル Structure of Caulobacter crescentus VapBC1 bound to operator DNA 要素(DNA (27-MER)) x 2 Ribonuclease VapC VapB family protein 詳細キーワード HYDROLASE / PIN domain / toxin-antitoxin / ribonuclease / DNA-binding機能・相同性 機能・相同性情報分子機能 ドメイン・相同性 構成要素
RNA nuclease activity / toxin activity / 加水分解酵素; エステル加水分解酵素 / magnesium ion binding 類似検索 - 分子機能 Antidote-toxin recognition MazE, bacterial antitoxin / PIN domain / SpoVT-AbrB domain superfamily / VapC family / 5'-nuclease / PIN domain / PIN-like domain superfamily / Rossmann fold / 3-Layer(aba) Sandwich / Alpha Beta 類似検索 - ドメイン・相同性 DNA / DNA (> 10) / VapB family protein / Ribonuclease VapC 類似検索 - 構成要素生物種 Caulobacter crescentus (バクテリア)Caulobacter crescentus CB15 (バクテリア)手法 X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度 : 2.7 Å 詳細データ登録者 Bendtsen, K.L. / Xu, K. / Luckmann, M. / Brodersen, D.E. 資金援助 デンマーク, 2件 詳細 詳細を隠す組織 認可番号 国 The Lundbeck Foundation R173-2014-1182 デンマーク The Danish National Research Foundation DNRF120 デンマーク
引用ジャーナル : Nucleic Acids Res. / 年 : 2017タイトル : Toxin inhibition in C. crescentus VapBC1 is mediated by a flexible pseudo-palindromic protein motif and modulated by DNA binding.著者 : Bendtsen, K.L. / Xu, K. / Luckmann, M. / Winther, K.S. / Shah, S.A. / Pedersen, C.N.S. / Brodersen, D.E. 履歴 登録 2016年5月30日 登録サイト : PDBE / 処理サイト : PDBE改定 1.0 2016年12月28日 Provider : repository / タイプ : Initial release改定 1.1 2017年1月11日 Group : Database references改定 1.2 2017年5月3日 Group : Database references改定 1.3 2018年1月17日 Group : Data collection / カテゴリ : diffrn_source / Item : _diffrn_source.pdbx_synchrotron_site改定 2.0 2024年1月10日 Group : Atomic model / Data collection ... Atomic model / Data collection / Database references / Refinement description カテゴリ : atom_site / chem_comp_atom ... atom_site / chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model Item : _atom_site.occupancy / _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession
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