登録情報 | データベース: PDB / ID: 5kxu |
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タイトル | Structure Proteinase K determined by SACLA |
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要素 | Proteinase K |
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キーワード | HYDROLASE / Serine Protease / hydrolysis / aminolysis / catalytic triad |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
peptidase K / serine-type endopeptidase activity / proteolysis / extracellular space / metal ion binding類似検索 - 分子機能 Proteinase K-like catalytic domain / Peptidase S8/S53 domain / Peptidase S8 propeptide/proteinase inhibitor I9 / Peptidase inhibitor I9 / Peptidase S8 propeptide/proteinase inhibitor I9 superfamily / Peptidase S8, subtilisin, His-active site / Serine proteases, subtilase family, histidine active site. / Serine proteases, subtilase family, aspartic acid active site. / Peptidase S8, subtilisin, Asp-active site / Serine proteases, subtilase family, serine active site. ...Proteinase K-like catalytic domain / Peptidase S8/S53 domain / Peptidase S8 propeptide/proteinase inhibitor I9 / Peptidase inhibitor I9 / Peptidase S8 propeptide/proteinase inhibitor I9 superfamily / Peptidase S8, subtilisin, His-active site / Serine proteases, subtilase family, histidine active site. / Serine proteases, subtilase family, aspartic acid active site. / Peptidase S8, subtilisin, Asp-active site / Serine proteases, subtilase family, serine active site. / Peptidase S8, subtilisin, Ser-active site / Serine proteases, subtilase domain profile. / Peptidase S8, subtilisin-related / Peptidase S8/S53 domain superfamily / Subtilase family / Peptidase S8/S53 domain / Rossmann fold / 3-Layer(aba) Sandwich / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 |
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生物種 | Engyodontium album (菌類) |
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手法 | X線回折 / 自由電子レーザー / 分子置換 / 解像度: 1.2 Å |
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データ登録者 | Masuda, T. / Suzuki, M. / Inoue, S. / Numata, K. / Sugahara, M. |
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資金援助 | 日本, 1件 組織 | 認可番号 | 国 |
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Japan Science and Technology | 25650026 | 日本 |
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引用 | ジャーナル: Sci Rep / 年: 2017 タイトル: Atomic resolution structure of serine protease proteinase K at ambient temperature. 著者: Masuda, T. / Suzuki, M. / Inoue, S. / Song, C. / Nakane, T. / Nango, E. / Tanaka, R. / Tono, K. / Joti, Y. / Kameshima, T. / Hatsui, T. / Yabashi, M. / Mikami, B. / Nureki, O. / Numata, K. / ...著者: Masuda, T. / Suzuki, M. / Inoue, S. / Song, C. / Nakane, T. / Nango, E. / Tanaka, R. / Tono, K. / Joti, Y. / Kameshima, T. / Hatsui, T. / Yabashi, M. / Mikami, B. / Nureki, O. / Numata, K. / Iwata, S. / Sugahara, M. |
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履歴 | 登録 | 2016年7月20日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: PDBJ |
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改定 1.0 | 2017年6月7日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2018年1月24日 | Group: Data collection / カテゴリ: diffrn_source / Item: _diffrn_source.pdbx_synchrotron_site |
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改定 1.2 | 2021年10月27日 | Group: Author supporting evidence / Data collection ...Author supporting evidence / Data collection / Database references / Derived calculations / Structure summary カテゴリ: database_2 / diffrn_radiation ...database_2 / diffrn_radiation / entity / pdbx_audit_support / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _diffrn_radiation.pdbx_scattering_type / _entity.pdbx_mutation / _pdbx_audit_support.funding_organization / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id |
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改定 1.3 | 2023年9月6日 | Group: Data collection / Database references / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / pdbx_related_exp_data_set / software |
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改定 1.4 | 2023年11月8日 | Group: Refinement description / カテゴリ: pdbx_initial_refinement_model |
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