登録情報 データベース : PDB / ID : 5kxe 構造の表示 ダウンロードとリンクタイトル Wisteria floribunda lectin in complex with GalNAc(beta1-4)GlcNAc (LacdiNAc) at pH 4.2 要素Wisteria floribunda agglutinin 詳細 キーワード sugar binding protein/inhibitor / Carbohydrate-binding protein / lectin / sugar binding protein-inhibitor complex機能・相同性 機能・相同性情報分子機能 ドメイン・相同性 構成要素
Legume lectin / Legume lectin, alpha chain, conserved site / Legume lectins alpha-chain signature. / Legume lectins beta-chain signature. / Legume lectin domain / Legume lectin, beta chain, Mn/Ca-binding site / Legume lectin domain / Jelly Rolls - #200 / Concanavalin A-like lectin/glucanase domain superfamily / Jelly Rolls ... Legume lectin / Legume lectin, alpha chain, conserved site / Legume lectins alpha-chain signature. / Legume lectins beta-chain signature. / Legume lectin domain / Legume lectin, beta chain, Mn/Ca-binding site / Legume lectin domain / Jelly Rolls - #200 / Concanavalin A-like lectin/glucanase domain superfamily / Jelly Rolls / Sandwich / Mainly Beta 類似検索 - ドメイン・相同性 Chem-6Y2 / : / PHOSPHATE ION / Wisteria floribunda agglutinin 類似検索 - 構成要素生物種 Wisteria floribunda (ノダフジ)手法 X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度 : 2.09 Å 詳細データ登録者 Evans, S.V. / Haji-Ghassemi, O. 資金援助 カナダ, 1件 詳細 詳細を隠す組織 認可番号 国 Natural Sciences and Engineering Research Council (NSERC, Canada) Discovery Grant, 171356-2013 カナダ
引用ジャーナル : J.Biol.Chem. / 年 : 2016タイトル : Molecular Basis for Recognition of the Cancer Glycobiomarker, LacdiNAc (GalNAc[ beta 14]GlcNAc), by Wisteria floribunda Agglutinin.著者 : Haji-Ghassemi, O. / Gilbert, M. / Spence, J. / Schur, M.J. / Parker, M.J. / Jenkins, M.L. / Burke, J.E. / van Faassen, H. / Young, N.M. / Evans, S.V. 履歴 登録 2016年7月20日 登録サイト : RCSB / 処理サイト : RCSB改定 1.0 2016年9月14日 Provider : repository / タイプ : Initial release改定 1.1 2016年9月21日 Group : Database references改定 1.2 2016年11月23日 Group : Database references改定 1.3 2017年9月20日 Group : Author supporting evidence / Database references / カテゴリ : citation / pdbx_audit_supportItem : _citation.journal_id_CSD / _pdbx_audit_support.funding_organization改定 1.4 2020年1月8日 Group : Author supporting evidence / Data collection / カテゴリ : chem_comp / pdbx_audit_supportItem : _chem_comp.type / _pdbx_audit_support.funding_organization改定 2.0 2020年7月29日 Group : Advisory / Atomic model ... Advisory / Atomic model / Data collection / Derived calculations / Structure summary カテゴリ : atom_site / chem_comp ... atom_site / chem_comp / entity / pdbx_branch_scheme / pdbx_chem_comp_identifier / pdbx_entity_branch / pdbx_entity_branch_descriptor / pdbx_entity_branch_link / pdbx_entity_branch_list / pdbx_entity_nonpoly / pdbx_nonpoly_scheme / pdbx_struct_assembly_gen / pdbx_struct_conn_angle / pdbx_validate_close_contact / struct_asym / struct_conn / struct_site / struct_site_gen Item : _atom_site.B_iso_or_equiv / _atom_site.Cartn_x ... _atom_site.B_iso_or_equiv / _atom_site.Cartn_x / _atom_site.Cartn_y / _atom_site.Cartn_z / _atom_site.auth_asym_id / _atom_site.auth_atom_id / _atom_site.auth_comp_id / _atom_site.auth_seq_id / _atom_site.label_asym_id / _atom_site.label_atom_id / _atom_site.label_comp_id / _atom_site.label_entity_id / _atom_site.type_symbol / _chem_comp.name / _chem_comp.type / _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_2 / _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_2 / _struct_conn.conn_type_id / _struct_conn.id / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_conn.pdbx_role / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id 解説 : Carbohydrate remediation / Provider : repository / タイプ : Remediation改定 2.1 2023年10月4日 Group : Data collection / Database references ... Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description / Structure summary カテゴリ : chem_comp / chem_comp_atom ... chem_comp / chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / struct_conn / struct_ncs_dom_lim Item : _chem_comp.pdbx_synonyms / _database_2.pdbx_DOI ... _chem_comp.pdbx_synonyms / _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_seq_id / _struct_ncs_dom_lim.end_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_seq_id
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