PDB-5kan: Crystal structure of multidonor HV1-18-class broadly neutralizing...

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 5kan

タイトル

Crystal structure of multidonor HV1-18-class broadly neutralizing Influenza A antibody 16.g.07 in complex with A/Hong Kong/1-4-MA21-1/1968 (H3N2) Hemagglutinin

要素

(Hemagglutinin ...) x 2
16.g.07 Heavy chain
16.g.07 Light chain

キーワード

IMMUNE SYSTEM / Influenza / multidonor / H5 / universal influenza vaccine

機能・相同性

機能・相同性情報

viral budding from plasma membrane / clathrin-dependent endocytosis of virus by host cell / host cell surface receptor binding / fusion of virus membrane with host plasma membrane / fusion of virus membrane with host endosome membrane / viral envelope / virion attachment to host cell / host cell plasma membrane / virion membrane / membrane
類似検索 - 分子機能

生物種

Influenza A virus (A型インフルエンザウイルス)

Homo sapiens (ヒト)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 2.785 Å

データ登録者

Joyce, M.G. / Thomas, P.V. / Wheatley, A.K. / McDermott, A.B. / Mascola, J.R. / Kwong, P.D.

引用

ジャーナル: Cell(Cambridge,Mass.) / 年: 2016
タイトル: Vaccine-Induced Antibodies that Neutralize Group 1 and Group 2 Influenza A Viruses.
著者: Joyce, M.G. / Wheatley, A.K. / Thomas, P.V. / Chuang, G.Y. / Soto, C. / Bailer, R.T. / Druz, A. / Georgiev, I.S. / Gillespie, R.A. / Kanekiyo, M. / Kong, W.P. / Leung, K. / Narpala, S.N. / ...

履歴

登録	2016年6月1日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.0	2016年11月30日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2020年7月29日	Group: Advisory / Data collection ...Advisory / Data collection / Database references / Derived calculations / Structure summary カテゴリ: chem_comp / citation ...chem_comp / citation / entity / pdbx_chem_comp_identifier / pdbx_entity_nonpoly / pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms / struct_conn / struct_site / struct_site_gen Item: _chem_comp.name / _chem_comp.type ..._chem_comp.name / _chem_comp.type / _citation.journal_id_CSD / _entity.pdbx_description / _pdbx_entity_nonpoly.name / _struct_conn.pdbx_role 解説: Carbohydrate remediation / Provider: repository / タイプ: Remediation
改定 1.2	2023年9月27日	Group: Advisory / Data collection ...Advisory / Data collection / Database references / Refinement description / Structure summary カテゴリ: chem_comp / chem_comp_atom ...chem_comp / chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms / struct_ncs_dom_lim Item: _chem_comp.pdbx_synonyms / _database_2.pdbx_DOI ..._chem_comp.pdbx_synonyms / _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_seq_id / _struct_ncs_dom_lim.end_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_seq_id
改定 1.3	2024年11月20日	Group: Structure summary カテゴリ: pdbx_entry_details / pdbx_modification_feature

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

-
ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	5kan.cif.gz	1.1 MB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb5kan.ent.gz	936.3 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	5kan.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

-
検証レポート

文書・要旨	5kan_validation.pdf.gz	551.7 KB	表示	wwPDB検証レポート
文書・詳細版	5kan_full_validation.pdf.gz	578.7 KB	表示
XML形式データ	5kan_validation.xml.gz	94.9 KB	表示
CIF形式データ	5kan_validation.cif.gz	128.7 KB	表示
アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ka/5kan ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ka/5kan	HTTPS FTP

-
関連構造データ

関連構造データ	5k9jC 5k9kC 5k9oC 5k9qSC 5kaqC 4lssS C: 同じ文献を引用 (文献) S: 精密化の開始モデル
類似構造データ	5k9q-1 5kaq-d 5k9q-2 4ubd-1 4ubd-2 2753 4fqv-d 5gjt-1 Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

-
リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI
「今月の分子」の関連する項目	#170 - 2014年2月広域中和抗体 (Broadly Neutralizing Antibodies) 類似性 (6) #21 - 2001年9月抗体 (Antibodies) 類似性 (1) #256 - 2021年4月 SARSコロナウイルス2型のスパイクと抗体 (SARS-CoV-2 Spike and Antibodies) 類似性 (1) #76 - 2006年4月赤血球凝集素 (Hemagglutinin) 類似性 (5) #259 - 2021年7月人工設計タンパク質と市民科学 (Designed Proteins and Citizen Science) 類似性 (5) #62 - 2005年2月主要組織適合性複合体 (Major Histocompatibility Complex) 類似性 (5) #63 - 2005年3月 T細胞受容体 (T-Cell Receptor) 類似性 (5) #200 - 2016年8月正二十面体型ウイルスの準対称性 (Quasisymmetry in Icosahedral Viruses) 類似性 (1)

PDBのページ

PDBj /

wwPDB /

NCBI

「今月の分子」の関連する項目

#170 - 2014年2月
広域中和抗体 (Broadly Neutralizing Antibodies)
類似性 (6)
#21 - 2001年9月
抗体 (Antibodies)
類似性 (1)
#256 - 2021年4月
SARSコロナウイルス2型のスパイクと抗体 (SARS-CoV-2 Spike and Antibodies)
類似性 (1)
#76 - 2006年4月
赤血球凝集素 (Hemagglutinin)
類似性 (5)
#259 - 2021年7月
人工設計タンパク質と市民科学 (Designed Proteins and Citizen Science)
類似性 (5)
#62 - 2005年2月
主要組織適合性複合体 (Major Histocompatibility Complex)
類似性 (5)
#63 - 2005年3月
T細胞受容体 (T-Cell Receptor)
類似性 (5)
#200 - 2016年8月
正二十面体型ウイルスの準対称性 (Quasisymmetry in Icosahedral Viruses)
類似性 (1)

登録構造単位

A: Hemagglutinin HA1

B: Hemagglutinin HA2

C: Hemagglutinin HA1

D: Hemagglutinin HA2

E: Hemagglutinin HA1

F: Hemagglutinin HA2

G: 16.g.07 Heavy chain

H: 16.g.07 Heavy chain

I: 16.g.07 Light chain

J: 16.g.07 Heavy chain

K: 16.g.07 Light chain

L: 16.g.07 Light chain

ヘテロ分子

314 kDa, 12 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

1

登録構造と同一
登録者・ソフトウェアが定義した集合体

単位格子

Length a, b, c (Å)	128.847, 147.562, 209.786
Angle α, β, γ (deg.)	90.000, 90.000, 90.000
Int Tables number	19
Space group name H-M	P2₁2₁2₁

非結晶学的対称性 (NCS)

NCSドメイン:

ID	Ens-ID	詳細
1	1	chain A
2	1	chain C
3	1	chain E
1	2	chain B
2	2	chain D
3	2	chain F
1	3	chain G
2	3	chain H
3	3	chain J
1	4	chain I
2	4	chain K
3	4	chain L

NCSドメイン領域:

Component-ID: 1

Dom-ID	Ens-ID	Beg auth comp-ID	Beg label comp-ID	End auth comp-ID	End label comp-ID	Selection details	Auth asym-ID	Label asym-ID	Auth seq-ID	Label seq-ID
1	1	ASN	ASN	LYS	LYS	chain A	A	A	8 - 326	1 - 319
2	1	ASN	ASN	LYS	LYS	chain C	C	C	8 - 326	1 - 319
3	1	ASN	ASN	LYS	LYS	chain E	E	E	8 - 326	1 - 319
1	2	GLY	GLY	VAL	VAL	chain B	B	B	4 - 176	1 - 173
2	2	GLY	GLY	LYS	LYS	chain D	D	D	4 - 174	1 - 171
3	2	GLY	GLY	ILE	ILE	chain F	F	F	4 - 173	1 - 170
1	3	GLN	GLN	CYS	CYS	chain G	G	G	1 - 231	1 - 231
2	3	GLN	GLN	CYS	CYS	chain H	H	H	1 - 231	1 - 231
3	3	GLN	GLN	CYS	CYS	chain J	J	J	1 - 231	1 - 231
1	4	ASP	ASP	CYS	CYS	chain I	I	I	1 - 214	1 - 214
2	4	ASP	ASP	CYS	CYS	chain K	K	K	1 - 214	1 - 214
3	4	ASP	ASP	CYS	CYS	chain L	L	L	1 - 214	1 - 214

NCSアンサンブル:

ID
1
2
3
4

-
Hemagglutinin ... , 2種, 6分子 ACEBDF

#1: タンパク質	Hemagglutinin HA1 分子量: 35154.539 Da / 分子数: 3 / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) Influenza A virus (strain A/Hong Kong/1/1968 H3N2) (A型インフルエンザウイルス) 株: A/Hong Kong/1/1968 H3N2 / 遺伝子: HA / 発現宿主: Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q91MA7
#2: タンパク質	Hemagglutinin HA2 分子量: 19980.070 Da / 分子数: 3 / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) Influenza A virus (strain A/Hong Kong/1/1968 H3N2) (A型インフルエンザウイルス) 株: A/Hong Kong/1/1968 H3N2 / 遺伝子: HA / 発現宿主: Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q91MA7

-
抗体 , 2種, 6分子 GHJIKL

#3: 抗体	16.g.07 Heavy chain 分子量: 24957.084 Da / 分子数: 3 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 発現宿主: Homo sapiens (ヒト)
#4: 抗体	16.g.07 Light chain 分子量: 23335.080 Da / 分子数: 3 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 発現宿主: Homo sapiens (ヒト)

-
糖 / 非ポリマー , 2種, 165分子

#5: 糖

ChemComp-NAG / 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose / N-acetyl-beta-D-glucosamine / 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose / 2-acetamido-2-deoxy-D-glucose / 2-acetamido-2-deoxy-glucose / N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE / N-アセチル-β-D-グルコサミン

タイプ: D-saccharide, beta linking / 分子量: 221.208 Da / 分子数: 17 / 由来タイプ: 組換発現 / 式: C₈H₁₅NO₆

識別子	タイプ	プログラム
DGlcpNAcb	CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL	GMML 1.0
N-acetyl-b-D-glucopyranosamine	COMMON NAME	GMML 1.0
b-D-GlcpNAc	IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL	PDB-CARE 1.0
GlcNAc	SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL	GMML 1.0

#6: 水

ChemComp-HOH / water

分子量: 18.015 Da / 分子数: 148 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

-
詳細

Has protein modification	Y

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 3.21 Å³/Da / 溶媒含有率: 61.73 %
結晶化	温度: 293 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 6 詳細: 0.010M Tris(2-carboxyethyl)phosphine HCl (TCEP) , 0.09 M 2-(N-morpholino)ethanesulfonic acid (MES), pH 6.0, 12% (w/v) PEG-6000

-
データ収集

回折	平均測定温度: 100 K
放射光源	由来: シンクロトロン / サイト: APS / ビームライン: 22-ID / 波長: 1 Å
検出器	タイプ: MARMOSAIC 300 mm CCD / 検出器: CCD / 日付: 2015年4月9日
放射	プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 1 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 2.78→50 Å / Num. obs: 83716 / % possible obs: 83.2 % / 冗長度: 4.1 % / Net I/σ(I): 14.05

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
PHENIX	1.9_1692	精密化
PDB_EXTRACT	3.2	データ抽出
HKL-2000		データ削減
HKL-2000		データスケーリング
PHASER		位相決定

精密化

構造決定の手法:

分子置換
開始モデル: 4lss, 5k9q

4lss

5k9q

解像度: 2.785→40.673 Å / SU ML: 0.29 / 交差検証法: FREE R-VALUE / σ(F): 1.34 / 位相誤差: 26.46

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.2427	4106	4.91 %
R_work	0.2176	-	-
obs	0.2189	83699	83.25 %

溶媒の処理

減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å

原子変位パラメータ

B_iso max: 241 Å² / B_iso mean: 71.5849 Å² / B_iso min: 16.15 Å²

精密化ステップ

サイクル: final / 解像度: 2.785→40.673 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	21758	0	238	148	22144
B_iso mean	-	-	94.69	45.34	-
残基数	-	-	-	-	2806

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	数
X-RAY DIFFRACTION	f_bond_d	0.004	22517
X-RAY DIFFRACTION	f_angle_d	0.973	30567
X-RAY DIFFRACTION	f_chiral_restr	0.039	3446
X-RAY DIFFRACTION	f_plane_restr	0.003	3947
X-RAY DIFFRACTION	f_dihedral_angle_d	13.795	8169

Refine LS restraints NCS

Ens-ID	Dom-ID	Auth asym-ID	数	Refine-ID	Rms	タイプ
1	1	A	4495	X-RAY DIFFRACTION	8.279	TORSIONAL
1	2	C	4495	X-RAY DIFFRACTION	8.279	TORSIONAL
1	3	E	4495	X-RAY DIFFRACTION	8.279	TORSIONAL
2	1	B	2501	X-RAY DIFFRACTION	8.279	TORSIONAL
2	2	D	2501	X-RAY DIFFRACTION	8.279	TORSIONAL
2	3	F	2501	X-RAY DIFFRACTION	8.279	TORSIONAL
3	1	G	3182	X-RAY DIFFRACTION	8.279	TORSIONAL
3	2	H	3182	X-RAY DIFFRACTION	8.279	TORSIONAL
3	3	J	3182	X-RAY DIFFRACTION	8.279	TORSIONAL
4	1	I	2948	X-RAY DIFFRACTION	8.279	TORSIONAL
4	2	K	2948	X-RAY DIFFRACTION	8.279	TORSIONAL
4	3	L	2948	X-RAY DIFFRACTION	8.279	TORSIONAL

LS精密化シェル

Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION / Total num. of bins used: 29

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	R_factor R_work	Num. reflection R_work	Num. reflection all	% reflection obs (%)
2.7846-2.8173	0.2971	23	0.3557	534	557	16
2.8173-2.8517	0.405	49	0.3659	871	920	27
2.8517-2.8877	0.3669	45	0.3257	1070	1115	33
2.8877-2.9257	0.3395	58	0.3209	1367	1425	41
2.9257-2.9658	0.3821	79	0.3255	1595	1674	49
2.9658-3.0082	0.377	108	0.3009	1927	2035	59
3.0082-3.053	0.3278	102	0.3098	2233	2335	68
3.053-3.1007	0.3075	120	0.3026	2389	2509	74
3.1007-3.1516	0.3028	124	0.2906	2637	2761	80
3.1516-3.2059	0.317	142	0.2847	2781	2923	85
3.2059-3.2641	0.3092	155	0.2878	2970	3125	91
3.2641-3.3269	0.3029	169	0.2826	3077	3246	94
3.3269-3.3948	0.3007	158	0.2586	3168	3326	97
3.3948-3.4686	0.2795	208	0.2619	3180	3388	98
3.4686-3.5492	0.2781	140	0.2444	3255	3395	99
3.5492-3.6379	0.2549	186	0.2368	3234	3420	99
3.6379-3.7362	0.2402	210	0.237	3254	3464	100
3.7362-3.8461	0.2373	151	0.2288	3292	3443	100
3.8461-3.9701	0.2575	167	0.2272	3294	3461	100
3.9701-4.1119	0.2211	190	0.202	3277	3467	100
4.1119-4.2763	0.2054	149	0.1884	3326	3475	100
4.2763-4.4707	0.1941	158	0.1699	3317	3475	100
4.4707-4.7061	0.2049	166	0.1654	3285	3451	100
4.7061-5.0005	0.197	178	0.1664	3320	3498	100
5.0005-5.3857	0.1944	182	0.1734	3321	3503	100
5.3857-5.9262	0.2271	171	0.1929	3349	3520	100
5.9262-6.7804	0.1923	165	0.2059	3376	3541	100
6.7804-8.5296	0.2092	157	0.21	3405	3562	100
8.5296-40.6771	0.2461	196	0.191	3489	3685	99

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	6.7759	1.8276	-1.3995	2.5557	-0.5935	1.1	-0.0193	2.1508	-0.154	-0.426	0.0463	-0.292	-0.1715	0.2321	0.0637	0.3899	-0.0131	0.0259	0.6217	0.0213	0.3437	40.6684	1.862	-81.6655
2	6.0872	2.7675	-0.2497	2.3926	-0.5323	0.3958	-0.2472	1.1456	-0.575	-0.4754	0.2882	0.3507	-0.1746	-0.1478	0.0328	0.6301	-0.0155	-0.1219	0.7174	-0.1925	0.8309	0.2308	-19.0835	-84.5247
3	5.6095	0.7741	-1.1305	1.9127	0.3925	0.7667	0.0762	0.2888	-1.4043	-0.0682	0.1775	0.3509	0.1177	-0.1369	-0.1571	0.6524	-0.0931	-0.2484	0.6318	-0.1723	1.6651	-26.143	-35.4354	-79.6517
4	4.6073	0.0864	-0.6874	3.9181	-0.257	3.1605	-0.0101	0.0944	-0.575	0.2795	0.2815	0.3998	-0.9946	-0.3635	-0.2886	0.5634	-0.0341	-0.0682	0.7101	0.0401	1.4967	-37.8816	-28.5759	-76.0521
5	5.2808	2.5748	-1.0314	2.4658	-0.8726	1.2968	0.1399	-0.3265	-1.0895	0.1366	0.0784	0.285	0.2527	-0.1061	-0.3454	0.5749	-0.1261	-0.1943	0.6534	0.0754	1.6764	-25.6051	-34.8079	-71.0253
6	4.6864	0.7668	0.2669	1.2936	-0.7422	1.013	-0.1709	0.6937	-1.0795	-0.2899	0.0042	0.2025	0.3183	0.0171	0.0902	0.5112	-0.0891	-0.0435	0.6946	-0.2804	0.7948	1.7269	-18.989	-82.8227
7	4.654	-0.2285	-2.7061	0.4725	-0.0566	1.6177	0.2462	0.2146	1.4783	-0.086	-0.0252	0.2704	-0.154	0.0688	-0.0469	0.4197	-0.068	0.003	0.5427	-0.0044	0.5376	22.0639	-0.6848	-80.461
8	6.4559	1.7904	4.6195	6.6339	2.0755	4.2555	-0.5105	1.3668	1.3359	-1.2188	0.7144	-0.4895	-0.5314	0.8346	0.0026	0.5765	-0.0562	0.071	0.7013	0.0525	0.578	40.7049	1.4592	-82.3214
9	10.0485	1.815	-4.5158	1.5689	-1.5975	3.4537	-0.1318	0.422	-0.7173	-0.0403	0.0956	-0.3513	-0.3326	0.0032	-0.1543	0.4231	0.0209	-0.0092	0.4306	-0.0309	0.3215	39.5757	-7.7471	-77.3661
10	3.2078	1.8224	-2.5087	3.1807	-0.1119	2.2257	0.3373	-0.7253	-0.3297	0.563	-0.2835	0.0655	0.2698	-0.1121	0.3725	0.6327	0.0118	-0.002	0.5757	-0.0685	1.1687	4.6383	-21.1542	-71.7265
11	4.771	-2.0492	-4.0135	5.5183	0.5251	3.7504	0.7712	0.2913	-0.1743	-1.0517	-0.6122	-0.1146	0.276	-1.8411	-0.0441	0.5468	0.0194	-0.0589	0.9772	-0.213	0.877	-15.4538	-12.0019	-77.6284
12	2.5467	0.1748	-1.3449	0.3303	-0.1211	0.5534	0.338	-0.1668	0.2591	-0.0372	-0.1821	0.0743	-0.0521	0.0853	-0.0082	0.3523	-0.0182	-0.0143	0.4696	-0.0512	0.4302	17.3234	-4.0959	-69.6415
13	5.5665	-0.2165	1.7615	4.7447	1.8211	7.64	-0.2154	-0.0259	-0.1061	-0.0235	0.2687	-0.2533	-0.1124	0.3012	-0.0393	0.2849	-0.054	0.0378	0.4532	-0.0482	0.4911	58.3842	0.6522	-71.4172
14	4.9148	1.2242	-2.5724	1.1337	-2.5593	6.0557	0.1381	0.1203	0.2878	-0.8641	-0.0877	-0.4108	-0.5697	0.6254	0.2863	1.1254	0.2718	-0.0763	0.8956	0.0437	1.7725	67.6699	15.4783	-67.1948
15	3.8764	0.5291	0.2351	0.6145	-0.1253	0.2073	0.0711	-0.4624	-0.6644	0.1515	-0.0503	-0.1103	0.0132	0.1011	-0.0145	0.5064	0.0276	0.016	0.5051	-0.0129	0.4903	9.65	-18.3457	-45.3207
16	9.8256	4.1796	5.3358	5.9774	0.6017	1.9211	0.4807	-0.8396	-0.1463	0.3582	-0.1623	0.8215	-0.0167	-0.2138	-0.0866	0.5134	0.0248	0.0581	0.4812	0.0618	0.5751	-21.6949	-24.3486	-42.5544
17	5.155	0.7444	1.1037	3.8437	0.0129	2.5942	0.0201	-0.8271	-0.3568	0.3496	0.0658	0.8147	-0.1723	-0.2268	-0.1217	0.4286	0.1066	0.0742	0.5618	0.2028	0.6845	-38.2956	-19.8167	-43.3752
18	2.8146	-1.1047	1.3702	6.8266	0.5894	1.9947	0.1094	0.1287	-0.199	-0.7507	0.1014	-0.2683	-0.2005	0.0911	-0.1858	0.591	-0.0544	-0.0573	0.5308	0.2357	0.898	-39.6513	-23.4732	-54.295
19	4.7832	-1.6648	1.2445	2.7915	-0.5279	2.5721	-0.1016	-0.5651	-0.0213	-0.0289	0.2291	0.4714	-0.4347	0.0122	-0.1003	0.4686	0.0484	0.0127	0.4695	0.0977	0.5383	-33.5984	-12.8171	-46.6126
20	6.7742	1.8868	-3.1337	5.1458	-2.2997	1.5292	0.0652	-0.2355	-0.0828	0.1901	0.1491	-0.0665	-0.2571	0.1035	-0.1445	0.4403	-0.0303	-0.0089	0.5362	-0.0594	0.3556	-0.3537	-18.8274	-44.657
21	5.8552	0.6447	0.8602	3.0574	1.1046	1.925	0.6965	1.3645	-0.8043	0.6621	-0.1553	-0.4787	0.6897	0.5922	-0.0382	0.4764	0.092	-0.09	0.5714	0.0071	0.4527	25.4634	-16.5351	-53.8972
22	7.4769	1.8719	0.4572	2.0114	-0.0538	0.6262	0.2879	-0.085	-0.5555	0.0579	-0.2089	-0.4198	0.2324	0.2726	-0.088	0.515	0.0675	-0.0301	0.632	-0.0122	0.4469	38.9854	-7.0406	-45.6402
23	4.0726	3.4408	2.048	2.9925	1.8164	0.9632	0.1464	0.5456	1.1367	0.5459	0.3671	0.7345	-0.4977	-0.5883	0.0093	0.7556	-0.049	0.0046	1.1897	-0.054	0.9099	-0.6462	-7.7007	-47.5903
24	6.4956	1.6543	1.0439	5.0779	0.8191	3.6923	0.2409	0.7244	-1.0766	0.0906	-0.3341	1.1579	0.7412	-0.7145	-0.0361	1.0646	-0.0334	-0.1311	0.8416	0.0259	1.0532	-13.1558	-23.2927	-58.683
25	8.7705	2.1256	3.5167	1.1198	0.8908	1.7395	0.0305	0.2155	0.1782	0.1611	0.0137	0.0541	0.1451	0.1654	0.0275	0.3972	0.0018	-0.0171	0.4468	-0.0477	0.4374	17.7801	-7.6426	-58.3197
26	7.4577	1.8728	-0.4436	5.5956	-1.3893	1.1476	-0.0709	-0.3803	0.1371	-0.0603	-0.084	-0.5841	-0.436	0.3274	0.1347	0.5102	-0.0131	-0.1277	0.6965	-0.1326	0.5895	57.1916	4.7194	-48.7596
27	5.616	5.6601	-2.5185	4.7718	-2.4452	0.7894	0.4062	-1.7386	0.9655	0.0433	-0.2294	-0.0965	-0.0463	0.1036	-0.0799	0.4368	-0.0817	0.0311	0.5801	-0.2701	0.7032	33.3416	21.719	-54.1655
28	7.0546	1.1753	1.3135	0.1623	0.2962	0.7477	-0.2281	0.2265	0.8874	0.0841	0.0774	0.1666	-0.1344	-0.0395	0.1554	0.4758	0.0071	-0.0076	0.4759	0.0062	0.6344	-17.4491	11.5872	-64.8248
29	5.5697	1.7256	0.5879	3.1208	-0.7149	1.8616	-0.051	0.6519	-0.0045	-0.0974	0.0439	0.1134	-0.0722	-0.0566	-0.0088	0.3853	0.0364	-0.0306	0.5203	-0.0046	0.497	-42.2459	0.1087	-76.8416
30	9.9245	-1.4449	-1.9854	6.6592	0.912	3.1691	-0.1155	-0.3404	-0.9235	0.3412	0.378	0.0711	0.7392	0.7178	-0.2413	0.4508	0.0284	-0.063	0.4907	0.024	0.6245	-43.0667	-8.8193	-69.5146
31	5.2066	0.5206	0.675	2.9408	0.0376	1.8577	-0.0606	0.8064	-0.5212	-0.1552	-0.0862	-0.2951	-0.0278	0.4486	0.0594	0.383	0.0445	-0.0047	0.6564	-0.1149	0.5371	-34.2236	-3.0604	-79.5509
32	3.0258	0.0971	-0.6482	1.6453	-0.036	2.0638	0.053	0.2306	0.7329	-0.1694	-0.02	0.1473	-0.1372	-0.0547	0.0444	0.4059	-0.0035	-0.0412	0.5083	-0.0128	0.5839	-8.8286	12.5585	-64.2001
33	7.0774	6.6005	-0.6484	7.7506	0.5496	1.0573	0.8782	-0.4735	-0.0286	0.9921	-0.3827	-0.3412	-0.1811	0.4121	-0.1231	0.4998	-0.0559	-0.03	0.5459	-0.0354	0.4611	16.2764	13.391	-53.6543
34	7.7864	2.353	0.5101	3.1927	0.0956	0.7214	-0.0991	-0.4748	1.1251	0.2855	0.1857	-0.1648	-0.0673	0.069	-0.039	0.437	-0.0062	-0.0672	0.4748	-0.143	0.7108	31.0784	21.7532	-60.9175
35	2.608	-0.1507	1.5117	3.0751	2.391	2.4147	0.0556	1.1392	-0.0058	0.317	-0.1383	0.5135	-0.4975	-0.3033	0.3399	0.6358	0.0149	-0.0179	0.5689	0.0834	0.7622	-11.1737	1.9974	-65.6039
36	9.4411	4.9198	0.5076	3.6817	0.5159	0.4885	-0.1065	-0.1191	-0.561	-0.0252	0.117	-0.376	-0.0088	0.0241	-0.063	0.3829	-0.0354	-0.0212	0.4227	-0.0169	0.3974	14.5877	3.385	-60.9112
37	7.1645	-0.0484	-2.3715	2.8975	-1.0808	3.9554	-0.0441	-0.1371	0.9985	-0.1463	0.0249	-0.3873	-0.096	0.5197	0.1116	0.4825	-0.1032	-0.0016	0.4882	-0.1583	0.7891	52.4869	21.6725	-62.7686
38	3.3579	-0.3911	0.4736	8.8338	4.1528	3.3685	0.1766	-0.6022	-0.1814	0.9212	0.2521	-0.9943	0.3135	0.6377	-0.0621	0.6504	0.0288	-0.0442	0.8898	-0.0076	0.5633	28.8251	3.0508	-18.5288
39	4.3443	1.8389	-0.2756	2.8332	2.8839	5.661	0.1748	-0.2265	0.4165	0.2065	-0.0765	-0.1809	-0.4337	0.4396	-0.1944	0.5182	-0.0392	0.0008	0.5662	0.0345	0.4662	25.7132	10.0441	-25.0185
40	-0.1969	-0.8888	-1.2793	4.3128	4.8064	9.6684	-0.0464	-0.0533	-0.0001	0.5999	-0.0177	-0.0147	-0.1204	-0.0695	-0.0175	0.6092	0.0002	-0.0065	0.6494	0.0441	0.5243	15.0881	9.1498	-14.2371
41	5.9009	2.1053	0.3579	4.4684	0.9845	5.2113	0.0283	-0.1798	-0.0146	0.6162	0.1145	-0.121	-0.4067	0.3922	-0.1541	0.9614	0.0229	-0.0817	0.6526	0.0586	0.4965	7.6587	17.8671	8.1341
42	3.5728	-1.5476	1.3597	6.2005	-1.3967	0.6966	0.4364	0.9293	0.103	-0.8494	-0.4152	-0.6064	0.1096	1.2079	-0.0959	0.6913	0.0277	0.1701	0.6149	-0.1585	0.5562	45.2182	-41.1825	-82.6568
43	3.346	-2.646	2.1599	7.2741	-2.7032	3.1288	0.3009	0.2874	-0.7394	-0.6871	-0.0825	-0.4144	-0.3599	0.2848	0.128	0.5467	-0.0058	0.1308	0.4582	-0.0365	0.6567	40.3867	-28.0072	-85.5318
44	6.0621	3.0904	-1.4317	2.1296	-0.1993	1.5406	-0.3891	-0.0773	-1.1629	0.4941	0.449	-0.2707	0.1731	0.0313	0.1318	0.5453	-0.0427	0.024	0.4486	0.0499	0.5723	36.095	-40.0071	-74.5716
45	6.5544	3.1057	-0.4951	2.344	0.8616	2.9517	0.0371	-0.7901	-0.1839	0.6939	-0.1573	-0.3244	0.1765	0.3573	-0.0868	0.5337	0.0593	0.0222	0.4856	0.0245	0.4456	39.0456	-28.8852	-71.3686
46	6.7761	-0.0274	-0.7305	8.0842	0.8906	3.6675	0.0933	-0.0377	0.0667	0.4307	0.0042	-0.6476	-1.1335	0.046	-0.1047	0.4899	0.0071	-0.0073	0.5202	0.0279	0.7356	46.8385	-30.7853	-77.1096
47	3.6265	-1.6528	-0.3454	8.1111	1.174	0.7092	0.0302	-0.4455	-0.5874	0.7682	0.0081	-0.9417	0.1725	0.1063	0.04	0.4037	-0.0149	-0.092	0.4884	0.0831	0.7122	41.5274	-40.3581	-73.9771
48	2.2617	-0.6431	-0.1484	8.5144	-0.0919	0.767	0.1437	0.283	-0.1489	-0.6089	-0.4023	0.0188	-0.0904	0.2912	0.154	0.4477	-0.0339	0.0481	0.4334	-0.0348	0.3508	29.0177	-25.5772	-80.3746
49	1.1264	-2.8458	0.233	8.5612	2.3585	6.6042	0.5321	0.2251	-0.2342	-0.2414	-0.5536	-0.2932	0.9706	-0.2405	-0.1865	0.6967	-0.0582	0.1732	0.7845	0.0149	0.5476	39.6491	-64.1556	-88.3433
50	3.9212	1.068	-0.4591	4.7064	0.5737	3.1972	-0.192	0.7884	0.1321	-0.7792	0.1501	-0.3844	0.24	-0.0652	-0.0691	0.7169	-0.0436	0.2199	0.6866	0.0148	0.6426	35.2445	-62.0808	-91.8593
51	8.7023	1.6256	0.275	4.1407	3.5143	7.8213	-0.0562	0.8003	-0.5481	-0.9178	-0.4032	-0.5282	0.5488	0.3073	-0.0144	1.1562	-0.0359	0.3888	1.0652	-0.0207	0.9722	42.2009	-64.2457	-97.6702
52	7.49	1.8678	-0.9277	2.1569	1.0883	2.4315	0.1616	0.2004	0.1187	-0.0468	0.0475	0.2985	-0.7241	-0.7046	-0.0058	0.6245	0.1792	0.0873	0.5121	0.0608	0.5246	-0.7483	7.1859	-27.3443
53	5.9152	0.1794	1.6392	2.1232	1.6353	5.7881	0.154	1.1851	-0.5062	0.1635	0.0529	0.2702	-0.4437	-0.1919	-0.4855	0.4257	0.1238	0.0544	0.5633	-0.0509	0.458	8.9131	2.8605	-34.2312
54	8.6895	-0.5012	-2.7673	4.2923	3.9101	3.7314	-0.2291	-0.4299	-0.9942	0.7719	0.3209	0.2545	0.4272	-0.5717	-0.1054	0.611	0.0806	0.0016	0.561	0.1465	0.4367	7.703	-4.7911	-24.0558
55	7.9232	4.9907	-5.1594	5.7786	-4.2994	9.2509	-0.5925	0.5532	-0.2509	-0.4151	0.67	-0.0197	0.0986	-0.1738	-0.1496	0.4205	0.091	0.0626	0.598	-0.0004	0.5168	0.3314	0.2113	-33.4434
56	7.3553	3.4881	-2.7897	3.1816	-0.3293	2.4343	-0.266	-1.5567	-0.7694	0.0244	-0.3307	-0.1767	0.8153	0.8403	0.082	0.5597	0.1702	0.0115	0.6417	0.206	0.5172	2.6153	0.6696	-21.3998
57	2.1747	-0.8699	-0.3495	0.7581	1.6936	2.1599	0.191	0.7152	0.1183	0.0954	-0.0438	-0.1258	-0.074	-1.1819	-0.2015	0.5683	0.0886	0.0448	0.7107	0.0993	0.5121	3.5996	8.9207	-22.835
58	7.2599	2.6975	0.889	8.9209	0.0516	2.3604	0.2949	0.0796	0.469	1.1453	-0.1918	-0.8073	-1.2872	0.2462	-0.0436	1.7814	0.1885	-0.2395	0.8739	-0.0441	0.6083	3.059	29.7476	8.2516
59	3.2023	2.5988	1.8203	2.4823	1.2622	1.2589	-0.0952	0.375	0.4324	-0.2946	-0.2712	0.1167	-1.0292	0.1644	-0.0767	1.2899	0.0206	-0.1029	0.8534	0.1204	0.5666	-3.8843	24.1718	-4.2962
60	1.605	0.4898	0.0659	5.4152	3.5843	2.7826	0.2679	0.4534	0.9786	-0.7808	0.2289	0.6933	-1.6523	-1.5951	-0.0562	1.593	0.1694	0.1621	1.0712	0.3664	0.8677	0.0489	32.475	-6.2993
61	3.2484	2.6309	0.8169	7.2097	4.2238	3.8274	-0.031	-0.1716	0.3769	0.3722	0.0149	0.0242	-1.1843	-0.1249	-0.0181	1.3224	0.1406	-0.002	0.8412	0.2269	0.499	-1.0377	26.521	-1.0877
62	5.9374	4.6888	3.6281	5.0722	5.9731	8.8051	-0.271	-0.4393	1.1477	0.4055	-1.0373	1.7877	-1.1072	-0.7269	0.5315	1.2753	0.1585	-0.1012	1.1499	0.1037	0.905	-10.9464	29.4174	1.2262
63	4.2888	-0.6656	-0.4903	4.4215	-2.8819	3.479	0.1825	0.368	1.0577	-0.195	0.2122	-0.2938	-2.0832	0.5641	-0.3442	1.0769	-0.2182	-0.07	1.028	0.2328	0.977	20.3577	40.5375	-90.8471
64	3.7162	-0.3197	-1.6867	5.6113	1.2334	7.5481	0.3866	0.441	0.4947	0.7134	0.3331	-0.2601	-1.2159	0.3716	-0.2965	0.5808	-0.0667	0.0167	0.523	0.115	1.086	21.147	35.7473	-78.5255
65	5.3566	-0.3876	0.5072	6.8419	-0.5368	7.8295	-0.4194	1.3506	0.8074	-0.9168	0.0693	0.1046	-0.6083	-0.5977	0.0159	0.6477	-0.1401	-0.2322	0.9436	0.2277	0.6581	15.7525	29.3966	-92.3629
66	6.0889	0.1051	1.5648	5.8023	-0.7684	9.6378	0.3261	1.2279	-0.3508	-0.5402	0.3806	-0.8896	0.6462	1.1077	-0.4255	0.5257	-0.0178	-0.013	0.6309	0.0403	0.6724	23.5069	23.9331	-85.0752
67	4.4513	0.041	-0.0534	6.8318	-0.8279	6.9488	-0.3582	0.6043	0.7162	-0.4643	0.1561	0.1561	-0.7927	1.115	0.1411	0.5989	-0.2201	-0.043	0.9208	0.2051	1.0058	28.1502	32.566	-85.9238
68	1.2642	1.2309	-2.0074	1.9843	-3.3281	6.5582	-0.2132	0.8525	-0.0275	-1.0819	0.9585	0.9607	0.4482	0.207	-0.1565	0.7564	-0.3057	-0.0131	1.0817	0.1806	0.9244	19.7231	31.8779	-94.9613
69	2.251	-2.268	3.0295	2.9744	-2.8386	7.6657	0.0064	-0.066	0.2088	0.291	0.8562	0.2993	-0.5676	-0.3664	-0.4378	0.4515	-0.0652	-0.0639	0.5273	0.1194	0.7952	13.3238	25.5727	-76.0897
70	2.8022	-1.916	0.9739	5.3574	-2.2389	4.3274	-0.2762	1.5857	1.4302	-1.4379	-0.2401	0.2439	-1.6237	0.6855	0.4602	1.6262	-0.5443	-0.1799	1.4969	0.4929	1.2534	20.6279	43.1063	-104.5677
71	2.19	-2.7729	2.7522	2.5904	-2.2322	5.2738	-0.8494	0.7605	0.3695	0.8325	-0.2281	0.7178	-0.6399	0.3645	-0.8596	1.5704	-0.1912	-0.4495	1.9312	0.8346	2.1978	0.9708	50.1329	-111.8542
72	2.0873	0.688	2.391	3.4902	-1.6519	4.3917	0.3558	0.4468	0.7318	-1.1733	-0.0525	0.8854	-0.812	0.2849	-0.1234	1.3733	-0.1071	-0.2401	1.66	0.7145	1.8287	5.0807	43.2599	-108.3233
73	1.6713	1.8591	-1.9231	2.7754	-1.6403	2.7887	0.7384	0.0455	0.7375	-0.2898	-0.6361	-0.6088	-1.6552	0.2913	0.0855	1.9496	-0.2481	-0.3261	2.0684	1.1283	2.8218	-4.3324	54.2284	-109.1297
74	3.1692	0.7328	1.286	2.7845	-2.8091	4.3902	-0.2899	0.7059	0.3851	-0.8347	0.5173	-0.4105	-0.1572	-0.7836	0.0402	1.9831	-0.2033	-0.5075	1.7691	0.6044	2.4581	5.0333	57.3367	-111.1966
75	2.4052	1.4549	0.7698	2.3314	-0.6043	4.5531	0.1451	0.7237	0.3011	-0.4899	0.3829	0.5363	0.4233	-1.0425	-0.2085	0.719	-0.2173	-0.2263	0.982	0.3264	0.8435	1.9446	20.2208	-87.675
76	0.2402	-0.4474	1.034	1.9579	-0.3147	2.4449	-0.4657	0.9064	0.7125	-1.4526	0.9656	0.7208	0.4641	-0.3689	3.532	1.6982	-0.4636	-0.498	2.2	0.7766	1.3355	-2.1061	38.3685	-119.6584
77	4.5592	0.1856	-1.0426	6.8184	2.6118	3.5766	0.298	-1.0697	-0.0717	0.6496	-0.4204	0.5614	0.3255	-0.1506	0.0222	0.7228	-0.0161	0.087	0.6093	0.0196	0.5704	21.8901	-41.2037	-65.1075
78	8.2538	1.3221	5.2415	5.7755	4.2578	5.3821	-0.4684	-0.7098	-0.3362	0.4884	-0.684	1.5563	0.5367	-1.3922	0.2347	0.6537	-0.0695	0.3171	0.5307	-0.0302	0.8381	11.6156	-44.1742	-71.9325
79	4.3246	0.5579	0.1248	2.5997	-0.9882	1.5732	-0.0136	-0.1879	-0.1697	0.6686	0.2289	0.462	-0.248	0.5229	-0.1212	0.4569	0.0064	0.0257	0.4535	-0.0446	0.4118	21.3882	-31.3139	-70.7881
80	3.7791	0.8158	-0.0303	5.1649	-3.3815	2.3293	-0.1953	0.3963	-0.8295	-0.4633	-0.0327	0.9592	0.459	-0.5116	0.0032	0.5918	-0.0621	-0.0427	0.5028	-0.1399	0.5648	19.6019	-36.7993	-82.1147
81	0.8219	1.3066	2.0737	8.651	6.5503	7.5744	-0.0017	-0.3481	0.1493	0.7586	-0.3548	0.6368	0.4456	-0.6371	-0.0575	0.4219	0.0216	0.16	0.5616	-0.1141	0.9668	13.0689	-34.7587	-71.3349
82	1.6993	0.6179	-1.1667	4.3255	-1.8842	1.0974	-0.322	-0.1934	-0.4613	-0.7096	-0.3426	0.6687	0.2829	-0.3743	0.1719	0.4959	-0.0335	0.0788	0.5399	-0.1325	0.5827	18.6299	-43.6112	-77.8843
83	-0.0821	2.6276	1.1152	5.7923	-0.1058	0.1986	-0.121	0.0299	-0.005	-0.3447	0.0636	-0.4065	0.192	0.0218	0.0745	0.5487	-0.0195	0.1508	0.5907	-0.1452	0.5298	29.0847	-57.7337	-80.8709
84	7.9342	-5.658	-0.1713	6.8274	0.7342	1.1455	-0.0865	0.5173	-0.6688	0.4794	-0.0276	0.2322	-0.1949	0.2248	-0.0843	0.6006	-0.066	0.0031	0.5484	-0.1147	0.3486	26.9852	-71.8798	-81.1762
85	2.2023	-0.3069	0.896	7.3735	0.1006	2.3081	0.0306	0.2259	-0.5187	1.1405	-0.0746	-0.8496	0.5068	-0.4935	-0.2568	0.7033	-0.1817	0.1002	0.6926	-0.0983	0.5997	33.7509	-76.8952	-77.0076
86	4.6467	-3.0666	1.1627	6.9408	1.13	2.6386	-0.2572	0.017	-0.0607	-0.023	0.3317	-0.3666	0.2549	-0.0861	-0.0443	0.5169	-0.1416	0.114	0.5483	0.0169	0.5715	30.2417	-67.535	-83.3763
87	7.7445	-5.0654	-0.4784	6.6296	1.6183	1.744	-0.0847	0.0931	-1.2409	-0.5437	0.177	-0.3099	-0.0428	0.5395	-0.0743	0.8848	0.0127	0.0699	0.4984	-0.1514	0.7665	33.3055	-83.569	-83.4855
88	4.3331	-4.5546	-2.1591	5.3498	0.6438	3.2598	-0.0091	1.1446	-0.9655	0.2096	-0.2306	0.5523	0.4667	0.1891	-0.1021	0.8002	-0.0004	0.1098	0.7204	-0.2229	0.6757	24.5296	-80.7245	-86.2288

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Selection details	Auth asym-ID	Auth seq-ID
1	X-RAY DIFFRACTION	1	chain 'A' and (resid 8 through 26 )	A	8 - 26
2	X-RAY DIFFRACTION	2	chain 'A' and (resid 27 through 79 )	A	27 - 79
3	X-RAY DIFFRACTION	3	chain 'A' and (resid 80 through 175 )	A	80 - 175
4	X-RAY DIFFRACTION	4	chain 'A' and (resid 176 through 228 )	A	176 - 228
5	X-RAY DIFFRACTION	5	chain 'A' and (resid 229 through 265 )	A	229 - 265
6	X-RAY DIFFRACTION	6	chain 'A' and (resid 266 through 308 )	A	266 - 308
7	X-RAY DIFFRACTION	7	chain 'A' and (resid 309 through 326 )	A	309 - 326
8	X-RAY DIFFRACTION	8	chain 'B' and (resid 4 through 21 )	B	4 - 21
9	X-RAY DIFFRACTION	9	chain 'B' and (resid 22 through 55 )	B	22 - 55
10	X-RAY DIFFRACTION	10	chain 'B' and (resid 56 through 65 )	B	56 - 65
11	X-RAY DIFFRACTION	11	chain 'B' and (resid 66 through 75 )	B	66 - 75
12	X-RAY DIFFRACTION	12	chain 'B' and (resid 76 through 126 )	B	76 - 126
13	X-RAY DIFFRACTION	13	chain 'B' and (resid 127 through 170 )	B	127 - 170
14	X-RAY DIFFRACTION	14	chain 'B' and (resid 171 through 176 )	B	171 - 176
15	X-RAY DIFFRACTION	15	chain 'C' and (resid 8 through 79 )	C	8 - 79
16	X-RAY DIFFRACTION	16	chain 'C' and (resid 80 through 104 )	C	80 - 104
17	X-RAY DIFFRACTION	17	chain 'C' and (resid 105 through 195 )	C	105 - 195
18	X-RAY DIFFRACTION	18	chain 'C' and (resid 196 through 228 )	C	196 - 228
19	X-RAY DIFFRACTION	19	chain 'C' and (resid 229 through 265 )	C	229 - 265
20	X-RAY DIFFRACTION	20	chain 'C' and (resid 266 through 308 )	C	266 - 308
21	X-RAY DIFFRACTION	21	chain 'C' and (resid 309 through 326 )	C	309 - 326
22	X-RAY DIFFRACTION	22	chain 'D' and (resid 4 through 55 )	D	4 - 55
23	X-RAY DIFFRACTION	23	chain 'D' and (resid 56 through 65 )	D	56 - 65
24	X-RAY DIFFRACTION	24	chain 'D' and (resid 66 through 75 )	D	66 - 75
25	X-RAY DIFFRACTION	25	chain 'D' and (resid 76 through 126 )	D	76 - 126
26	X-RAY DIFFRACTION	26	chain 'D' and (resid 127 through 174 )	D	127 - 174
27	X-RAY DIFFRACTION	27	chain 'E' and (resid 8 through 26 )	E	8 - 26
28	X-RAY DIFFRACTION	28	chain 'E' and (resid 27 through 104 )	E	27 - 104
29	X-RAY DIFFRACTION	29	chain 'E' and (resid 105 through 195 )	E	105 - 195
30	X-RAY DIFFRACTION	30	chain 'E' and (resid 196 through 228 )	E	196 - 228
31	X-RAY DIFFRACTION	31	chain 'E' and (resid 229 through 265 )	E	229 - 265
32	X-RAY DIFFRACTION	32	chain 'E' and (resid 266 through 308 )	E	266 - 308
33	X-RAY DIFFRACTION	33	chain 'E' and (resid 309 through 326 )	E	309 - 326
34	X-RAY DIFFRACTION	34	chain 'F' and (resid 4 through 55 )	F	4 - 55
35	X-RAY DIFFRACTION	35	chain 'F' and (resid 56 through 75 )	F	56 - 75
36	X-RAY DIFFRACTION	36	chain 'F' and (resid 76 through 126 )	F	76 - 126
37	X-RAY DIFFRACTION	37	chain 'F' and (resid 127 through 173 )	F	127 - 173
38	X-RAY DIFFRACTION	38	chain 'G' and (resid 1 through 32 )	G	1 - 32
39	X-RAY DIFFRACTION	39	chain 'G' and (resid 33 through 98 )	G	33 - 98
40	X-RAY DIFFRACTION	40	chain 'G' and (resid 99 through 149 )	G	99 - 149
41	X-RAY DIFFRACTION	41	chain 'G' and (resid 150 through 231 )	G	150 - 231
42	X-RAY DIFFRACTION	42	chain 'H' and (resid 1 through 17 )	H	1 - 17
43	X-RAY DIFFRACTION	43	chain 'H' and (resid 18 through 32 )	H	18 - 32
44	X-RAY DIFFRACTION	44	chain 'H' and (resid 33 through 44 )	H	33 - 44
45	X-RAY DIFFRACTION	45	chain 'H' and (resid 45 through 64 )	H	45 - 64
46	X-RAY DIFFRACTION	46	chain 'H' and (resid 65 through 83 )	H	65 - 83
47	X-RAY DIFFRACTION	47	chain 'H' and (resid 84 through 99 )	H	84 - 99
48	X-RAY DIFFRACTION	48	chain 'H' and (resid 100 through 121 )	H	100 - 121
49	X-RAY DIFFRACTION	49	chain 'H' and (resid 122 through 149 )	H	122 - 149
50	X-RAY DIFFRACTION	50	chain 'H' and (resid 150 through 215 )	H	150 - 215
51	X-RAY DIFFRACTION	51	chain 'H' and (resid 216 through 231 )	H	216 - 231
52	X-RAY DIFFRACTION	52	chain 'I' and (resid 1 through 25 )	I	1 - 25
53	X-RAY DIFFRACTION	53	chain 'I' and (resid 26 through 38 )	I	26 - 38
54	X-RAY DIFFRACTION	54	chain 'I' and (resid 39 through 61 )	I	39 - 61
55	X-RAY DIFFRACTION	55	chain 'I' and (resid 62 through 75 )	I	62 - 75
56	X-RAY DIFFRACTION	56	chain 'I' and (resid 76 through 90 )	I	76 - 90
57	X-RAY DIFFRACTION	57	chain 'I' and (resid 91 through 113 )	I	91 - 113
58	X-RAY DIFFRACTION	58	chain 'I' and (resid 114 through 128 )	I	114 - 128
59	X-RAY DIFFRACTION	59	chain 'I' and (resid 129 through 150 )	I	129 - 150
60	X-RAY DIFFRACTION	60	chain 'I' and (resid 151 through 163 )	I	151 - 163
61	X-RAY DIFFRACTION	61	chain 'I' and (resid 164 through 197 )	I	164 - 197
62	X-RAY DIFFRACTION	62	chain 'I' and (resid 198 through 214 )	I	198 - 214
63	X-RAY DIFFRACTION	63	chain 'J' and (resid 1 through 16 )	J	1 - 16
64	X-RAY DIFFRACTION	64	chain 'J' and (resid 17 through 32 )	J	17 - 32
65	X-RAY DIFFRACTION	65	chain 'J' and (resid 33 through 44 )	J	33 - 44
66	X-RAY DIFFRACTION	66	chain 'J' and (resid 45 through 64 )	J	45 - 64
67	X-RAY DIFFRACTION	67	chain 'J' and (resid 65 through 84 )	J	65 - 84
68	X-RAY DIFFRACTION	68	chain 'J' and (resid 85 through 98 )	J	85 - 98
69	X-RAY DIFFRACTION	69	chain 'J' and (resid 99 through 121 )	J	99 - 121
70	X-RAY DIFFRACTION	70	chain 'J' and (resid 122 through 134 )	J	122 - 134
71	X-RAY DIFFRACTION	71	chain 'J' and (resid 135 through 172 )	J	135 - 172
72	X-RAY DIFFRACTION	72	chain 'J' and (resid 173 through 192 )	J	173 - 192
73	X-RAY DIFFRACTION	73	chain 'J' and (resid 193 through 215 )	J	193 - 215
74	X-RAY DIFFRACTION	74	chain 'J' and (resid 216 through 231 )	J	216 - 231
75	X-RAY DIFFRACTION	75	chain 'K' and (resid 1 through 102 )	K	1 - 102
76	X-RAY DIFFRACTION	76	chain 'K' and (resid 103 through 214 )	K	103 - 214
77	X-RAY DIFFRACTION	77	chain 'L' and (resid 1 through 12 )	L	1 - 12
78	X-RAY DIFFRACTION	78	chain 'L' and (resid 13 through 25 )	L	13 - 25
79	X-RAY DIFFRACTION	79	chain 'L' and (resid 26 through 38 )	L	26 - 38
80	X-RAY DIFFRACTION	80	chain 'L' and (resid 39 through 61 )	L	39 - 61
81	X-RAY DIFFRACTION	81	chain 'L' and (resid 62 through 75 )	L	62 - 75
82	X-RAY DIFFRACTION	82	chain 'L' and (resid 76 through 90 )	L	76 - 90
83	X-RAY DIFFRACTION	83	chain 'L' and (resid 91 through 128 )	L	91 - 128
84	X-RAY DIFFRACTION	84	chain 'L' and (resid 129 through 150 )	L	129 - 150
85	X-RAY DIFFRACTION	85	chain 'L' and (resid 151 through 163 )	L	151 - 163
86	X-RAY DIFFRACTION	86	chain 'L' and (resid 164 through 186 )	L	164 - 186
87	X-RAY DIFFRACTION	87	chain 'L' and (resid 187 through 197 )	L	187 - 197
88	X-RAY DIFFRACTION	88	chain 'L' and (resid 198 through 214 )	L	198 - 214

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

すべてのお知らせ

-
万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

他の情報も見る

-
ムービー

-
構造ビューア

+
ビューアのログ

-
このページ

-
このウェブサイト

-
オプション

+
データを開く

-
基本情報

-
構造の表示

-
ダウンロードとリンク

-
ダウンロード

-
検証レポート

-
関連構造データ

-
リンク

-
集合体

-
要素

-
Hemagglutinin ... , 2種, 6分子 ACEBDF

-
抗体 , 2種, 6分子 GHJIKL

-
糖 / 非ポリマー , 2種, 165分子

-
詳細

-
実験情報

-
実験

-
試料調製

-
データ収集

-
解析

+
万見について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-
万見 (Yorodumi)

-ムービー

-構造ビューア

+ビューアのログ

-このページ

-このウェブサイト

-オプション

+データを開く

-基本情報

-構造の表示

-ダウンロードとリンク

-ダウンロード

-検証レポート

-関連構造データ

-リンク

-集合体

-要素

-Hemagglutinin ... , 2種, 6分子 ACEBDF

-抗体 , 2種, 6分子 GHJIKL

-糖 / 非ポリマー , 2種, 165分子

-詳細

-実験情報

-実験

-試料調製

-データ収集

-解析

+万見について

-お知らせ

-2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-2020年8月12日: 新型コロナ情報

+2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-万見 (Yorodumi)

-
ムービー

-
構造ビューア

+
ビューアのログ

-
このページ

-
このウェブサイト

-
オプション

+
データを開く

-
基本情報

-
構造の表示

-
ダウンロードとリンク

-
ダウンロード

-
検証レポート

-
関連構造データ

-
リンク

-
集合体

-
要素

-
Hemagglutinin ... , 2種, 6分子 ACEBDF

-
抗体 , 2種, 6分子 GHJIKL

-
糖 / 非ポリマー , 2種, 165分子

-
詳細

-
実験情報

-
実験

-
試料調製

-
データ収集

-
解析

+
万見について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-
万見 (Yorodumi)