登録情報 データベース : PDB / ID : 5k8c 構造の表示 ダウンロードとリンクタイトル X-ray structure of KdnB, 3-deoxy-alpha-D-manno-octulosonate 8-oxidase, from Shewanella oneidensis 要素3-deoxy-alpha-D-manno-octulosonate 8-oxidase 詳細 キーワード TRANSFERASE / Group III alcohol dehydrogenase / 8-amino-3 / 8-dideoxy-d-manno-octulosonic acid / deoxy sugar機能・相同性 機能・相同性情報分子機能 ドメイン・相同性 構成要素
3-deoxy-alpha-D-manno-octulosonate 8-oxidase / alcohol dehydrogenase (NAD+) activity / lipopolysaccharide biosynthetic process / metal ion binding / cytosol 類似検索 - 分子機能 Iron-type alcohol dehydrogenase-like / Dehydroquinate synthase-like, alpha domain / Dehydroquinate synthase-like - alpha domain / Alcohol dehydrogenase, iron-type/glycerol dehydrogenase GldA / Iron-containing alcohol dehydrogenase / Rossmann fold - #1970 / Up-down Bundle / Rossmann fold / 3-Layer(aba) Sandwich / Mainly Alpha / Alpha Beta 類似検索 - ドメイン・相同性 NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE / PHOSPHATE ION / 3-deoxy-alpha-D-manno-octulosonate 8-oxidase 類似検索 - 構成要素生物種 Shewanella oneidensis (バクテリア)手法 X線回折 / 分子置換 / 解像度 : 1.85 Å 詳細データ登録者 Holden, H.M. / Thoden, J.B. / Zachman-Brockmeyer, T.R. 資金援助 米国, 1件 詳細 詳細を隠す組織 認可番号 国 National Institutes of Health/National Institute of General Medical Sciences (NIH/NIGMS) GM115921 米国
引用ジャーナル : Biochemistry / 年 : 2016タイトル : Structures of KdnB and KdnA from Shewanella oneidensis: Key Enzymes in the Formation of 8-Amino-3,8-Dideoxy-d-Manno-Octulosonic Acid.著者 : Zachman-Brockmeyer, T.R. / Thoden, J.B. / Holden, H.M. 履歴 登録 2016年5月28日 登録サイト : RCSB / 処理サイト : RCSB改定 1.0 2016年6月15日 Provider : repository / タイプ : Initial release改定 1.1 2016年6月22日 Group : Database references改定 1.2 2016年8月24日 Group : Database references改定 1.3 2017年9月20日 Group : Author supporting evidence / Database references / Derived calculationsカテゴリ : citation / pdbx_audit_support / pdbx_struct_oper_listItem : _citation.journal_id_CSD / _pdbx_audit_support.funding_organization / _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation改定 1.4 2019年12月25日 Group : Author supporting evidence / カテゴリ : pdbx_audit_support / Item : _pdbx_audit_support.funding_organization改定 1.5 2023年9月27日 Group : Data collection / Database references / Refinement descriptionカテゴリ : chem_comp_atom / chem_comp_bond ... chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model Item : _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession
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