- PDB-5js4: Crystal structure of phiAB6 tailspike -
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基本情報
登録情報
データベース: PDB / ID: 5js4
タイトル
Crystal structure of phiAB6 tailspike
要素
phiAB6 tailspike
キーワード
VIRAL PROTEIN / viral tailspike / beta-helix / superhelical trimer
機能・相同性
機能・相同性情報
symbiont entry into host cell via disruption of host cell glycocalyx / symbiont entry into host cell via disruption of host cell envelope / virus tail / virion attachment to host cell 類似検索 - 分子機能
AUTHORS STATE THAT THE DNA AND PROTEIN SEQUENCES HAVE BEEN DEPOSITED IN GENBACK WITH A ACCESSION ...AUTHORS STATE THAT THE DNA AND PROTEIN SEQUENCES HAVE BEEN DEPOSITED IN GENBACK WITH A ACCESSION NUMBER OF KT339321.
プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長
波長: 1 Å / 相対比: 1
反射
解像度: 1.48→20 Å / Num. obs: 406268 / % possible obs: 96.6 % / Observed criterion σ(I): 2 / 冗長度: 7 % / Rmerge(I) obs: 0.054 / Net I/σ(I): 34.3
反射 シェル
解像度: 1.48→1.53 Å / 冗長度: 7.6 % / Rmerge(I) obs: 0.606 / Mean I/σ(I) obs: 3.3 / % possible all: 95.3
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解析
ソフトウェア
名称
バージョン
分類
REFMAC
5.7.0032
精密化
HKL-2000
データ削減
HKL-2000
データスケーリング
PHENIX
位相決定
精密化
構造決定の手法: 単波長異常分散 / 解像度: 1.48→19.98 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.977 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.968 / SU B: 1.63 / SU ML: 0.028 / 交差検証法: THROUGHOUT / ESU R: 0.053 / ESU R Free: 0.049 / 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS