PDB-5jhc: Crystal structure of the self-assembled propeptides from Ape1

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 5jhc

タイトル

Crystal structure of the self-assembled propeptides from Ape1

要素

Vacuolar aminopeptidase 1

キーワード

HYDROLASE / Trimeric coiled-coil

機能・相同性

機能・相同性情報

aminopeptidase I / Cvt complex / cytoplasm to vacuole targeting by the Cvt pathway / fungal-type vacuole / metalloaminopeptidase activity / proteolysis / zinc ion binding / identical protein binding / cytoplasm
類似検索 - 分子機能

生物種

Saccharomyces cerevisiae (パン酵母)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

単一同系置換・異常分散 / 解像度: 3.4 Å

データ登録者

Yamasaki, A. / Noda, N.N.

引用

ジャーナル: Cell Rep / 年: 2016
タイトル: Structural Basis for Receptor-Mediated Selective Autophagy of Aminopeptidase I Aggregates
著者: Yamasaki, A. / Watanabe, Y. / Adachi, W. / Suzuki, K. / Matoba, K. / Kirisako, H. / Kumeta, H. / Nakatogawa, H. / Ohsumi, Y. / Inagaki, F. / Noda, N.N.

履歴

登録	2016年4月20日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: PDBJ
改定 1.0	2016年6月29日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2016年7月13日	Group: Database references
改定 1.2	2020年2月19日	Group: Data collection / Derived calculations / カテゴリ: diffrn_source / pdbx_struct_oper_list Item: _diffrn_source.pdbx_synchrotron_site / _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation
改定 1.3	2024年3月20日	Group: Data collection / Database references / カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	5jhc.cif.gz	345.3 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb5jhc.ent.gz	291.9 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	5jhc.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

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検証レポート

文書・要旨	5jhc_validation.pdf.gz	558.2 KB	表示	wwPDB検証レポート
文書・詳細版	5jhc_full_validation.pdf.gz	561.6 KB	表示
XML形式データ	5jhc_validation.xml.gz	27.6 KB	表示
CIF形式データ	5jhc_validation.cif.gz	40.8 KB	表示
アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/jh/5jhc ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/jh/5jhc	HTTPS FTP

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関連構造データ

関連構造データ	5jgeC 5jgfC 5jh9C C: 同じ文献を引用 (文献)
類似構造データ	2lr2-d 2wj7-2 2wj7-4 4oyc-1 2y22-6 1x4k-d 6so0-d 6a5i-d Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

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リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI
「今月の分子」の関連する項目	#203 - 2016年11月アミノペプチダーゼ1とオートファジー (Aminopeptidase 1 and Autophagy) 類似性 (5)

登録構造単位

A: Vacuolar aminopeptidase 1

C: Vacuolar aminopeptidase 1

E: Vacuolar aminopeptidase 1

G: Vacuolar aminopeptidase 1

I: Vacuolar aminopeptidase 1

K: Vacuolar aminopeptidase 1

M: Vacuolar aminopeptidase 1

O: Vacuolar aminopeptidase 1

Q: Vacuolar aminopeptidase 1

S: Vacuolar aminopeptidase 1

U: Vacuolar aminopeptidase 1

W: Vacuolar aminopeptidase 1

Y: Vacuolar aminopeptidase 1

B: Vacuolar aminopeptidase 1

a: Vacuolar aminopeptidase 1

b: Vacuolar aminopeptidase 1

D: Vacuolar aminopeptidase 1

F: Vacuolar aminopeptidase 1

c: Vacuolar aminopeptidase 1

H: Vacuolar aminopeptidase 1

d: Vacuolar aminopeptidase 1

J: Vacuolar aminopeptidase 1

e: Vacuolar aminopeptidase 1

L: Vacuolar aminopeptidase 1

f: Vacuolar aminopeptidase 1

N: Vacuolar aminopeptidase 1

g: Vacuolar aminopeptidase 1

P: Vacuolar aminopeptidase 1

h: Vacuolar aminopeptidase 1

R: Vacuolar aminopeptidase 1

i: Vacuolar aminopeptidase 1

T: Vacuolar aminopeptidase 1

j: Vacuolar aminopeptidase 1

V: Vacuolar aminopeptidase 1

k: Vacuolar aminopeptidase 1

X: Vacuolar aminopeptidase 1

l: Vacuolar aminopeptidase 1

Z: Vacuolar aminopeptidase 1

m: Vacuolar aminopeptidase 1

112 kDa, 39 ポリマー
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1

A: Vacuolar aminopeptidase 1

B: Vacuolar aminopeptidase 1

a: Vacuolar aminopeptidase 1

登録者が定義した集合体
8.58 kDa, 3 ポリマー
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2

C: Vacuolar aminopeptidase 1

b: Vacuolar aminopeptidase 1

D: Vacuolar aminopeptidase 1

登録者が定義した集合体
8.58 kDa, 3 ポリマー
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3

E: Vacuolar aminopeptidase 1

F: Vacuolar aminopeptidase 1

c: Vacuolar aminopeptidase 1

登録者が定義した集合体
8.58 kDa, 3 ポリマー
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4

G: Vacuolar aminopeptidase 1

H: Vacuolar aminopeptidase 1

d: Vacuolar aminopeptidase 1

登録者が定義した集合体
8.58 kDa, 3 ポリマー
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5

I: Vacuolar aminopeptidase 1

J: Vacuolar aminopeptidase 1

e: Vacuolar aminopeptidase 1

登録者が定義した集合体
8.58 kDa, 3 ポリマー
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6

K: Vacuolar aminopeptidase 1

L: Vacuolar aminopeptidase 1

f: Vacuolar aminopeptidase 1

登録者が定義した集合体
8.58 kDa, 3 ポリマー
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7

M: Vacuolar aminopeptidase 1

N: Vacuolar aminopeptidase 1

g: Vacuolar aminopeptidase 1

登録者が定義した集合体
8.58 kDa, 3 ポリマー
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8

O: Vacuolar aminopeptidase 1

P: Vacuolar aminopeptidase 1

h: Vacuolar aminopeptidase 1

登録者が定義した集合体
8.58 kDa, 3 ポリマー
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9

Q: Vacuolar aminopeptidase 1

R: Vacuolar aminopeptidase 1

i: Vacuolar aminopeptidase 1

登録者が定義した集合体
8.58 kDa, 3 ポリマー
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10

S: Vacuolar aminopeptidase 1

T: Vacuolar aminopeptidase 1

j: Vacuolar aminopeptidase 1

登録者が定義した集合体
8.58 kDa, 3 ポリマー
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11

U: Vacuolar aminopeptidase 1

V: Vacuolar aminopeptidase 1

k: Vacuolar aminopeptidase 1

登録者が定義した集合体
8.58 kDa, 3 ポリマー
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12

W: Vacuolar aminopeptidase 1

X: Vacuolar aminopeptidase 1

l: Vacuolar aminopeptidase 1

登録者が定義した集合体
8.58 kDa, 3 ポリマー
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13

Y: Vacuolar aminopeptidase 1

Z: Vacuolar aminopeptidase 1

m: Vacuolar aminopeptidase 1

登録者が定義した集合体
8.58 kDa, 3 ポリマー
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単位格子

Length a, b, c (Å)	248.758, 248.758, 164.403
Angle α, β, γ (deg.)	90.00, 90.00, 120.00
Int Tables number	155
Space group name H-M	H32

#1: タンパク質・ペプチド	... Vacuolar aminopeptidase 1 / Aminopeptidase yscI / Leucine aminopeptidase IV / LAPIV / Lysosomal aminopeptidase III / ...Aminopeptidase yscI / Leucine aminopeptidase IV / LAPIV / Lysosomal aminopeptidase III / Polypeptidase / Vacuolar aminopeptidase I 分子量: 2860.367 Da / 分子数: 39 / 断片: UNP residues 1-22 / 変異: P22L / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) Saccharomyces cerevisiae (パン酵母) 株: ATCC 204508 / S288c / 遺伝子: APE1, API, LAP4, YSC1, YKL103C, YKL455 / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: P14904, aminopeptidase I

#1: タンパク質・ペプチド

...
Vacuolar aminopeptidase 1 / Aminopeptidase yscI / Leucine aminopeptidase IV / LAPIV / Lysosomal aminopeptidase III / ...

分子量: 2860.367 Da / 分子数: 39 / 断片: UNP residues 1-22 / 変異: P22L / 由来タイプ: 組換発現
由来: (組換発現)

Saccharomyces cerevisiae (パン酵母)
株: ATCC 204508 / S288c / 遺伝子: APE1, API, LAP4, YSC1, YKL103C, YKL455 / 発現宿主:

Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: P14904, aminopeptidase I

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実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

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試料調製

結晶	マシュー密度: 4.39 Å³/Da / 溶媒含有率: 71.97 %
結晶化	温度: 293 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / pH: 4.6 / 詳細: 500 mM magnesium sulfate, 100 mM sodium acetate

-
データ収集

回折	平均測定温度: 95 K
放射光源	由来: シンクロトロン / サイト: Photon Factory / ビームライン: AR-NE3A / 波長: 1 Å
検出器	タイプ: ADSC QUANTUM 270 / 検出器: CCD / 日付: 2015年5月16日
放射	プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 1 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 3.4→500 Å / Num. obs: 26941 / % possible obs: 99.9 % / 冗長度: 11.3 % / Net I/σ(I): 22.4
反射シェル	解像度: 3.4→3.46 Å / 冗長度: 11.4 % / Mean I/σ(I) obs: 4.1 / % possible all: 100

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
PHENIX	1.9_1692	精密化
HKL-2000		データ削減
HKL-2000		データスケーリング

精密化

構造決定の手法:

単一同系置換・異常分散 / 解像度: 3.4→39.519 Å / SU ML: 0.53 / 交差検証法: FREE R-VALUE / σ(F): 1.34 / 位相誤差: 39.39 / 立体化学のターゲット値: ML

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.3109	1326	4.93 %
R_work	0.2764	-	-
obs	0.2781	26875	99.6 %

溶媒の処理

減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 3.4→39.519 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	6607	0	0	0	6607

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	数
X-RAY DIFFRACTION	f_bond_d	0.01	6605
X-RAY DIFFRACTION	f_angle_d	1.292	8941
X-RAY DIFFRACTION	f_dihedral_angle_d	16.209	2469
X-RAY DIFFRACTION	f_chiral_restr	0.056	1195
X-RAY DIFFRACTION	f_plane_restr	0.006	1143

LS精密化シェル

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	R_factor R_work	Num. reflection R_work	Refine-ID	% reflection obs (%)
3.4-3.5314	0.4341	157	0.3729	2766	X-RAY DIFFRACTION	99
3.5314-3.692	0.4171	154	0.3821	2824	X-RAY DIFFRACTION	100
3.692-3.8865	0.3408	122	0.3505	2835	X-RAY DIFFRACTION	100
3.8865-4.1297	0.319	144	0.295	2840	X-RAY DIFFRACTION	100
4.1297-4.4482	0.3157	164	0.2935	2811	X-RAY DIFFRACTION	99
4.4482-4.8951	0.2803	187	0.251	2779	X-RAY DIFFRACTION	99
4.8951-5.6017	0.3334	111	0.2861	2874	X-RAY DIFFRACTION	100
5.6017-7.0511	0.4431	143	0.3802	2886	X-RAY DIFFRACTION	100
7.0511-39.5215	0.2244	144	0.1947	2934	X-RAY DIFFRACTION	99

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	0.6662	0.0407	0.0645	0.4755	0.2015	0.4862	-0.3351	0.213	0.1924	-0.3729	-0.3545	-0.0704	0.7225	0.062	-0.5383	1.0339	-0.2527	0.0329	0.6244	-0.0689	1.1489	43.8132	-6.8846	32.0661
2	0.1555	-0.0532	0.0543	0.1168	-0.081	0.0484	0.3147	-0.4492	-0.1076	0.5878	-0.1254	0.2977	-0.2086	0.0343	0.001	1.6647	-0.1272	-0.0309	0.7549	-0.0154	1.9632	64.1953	-12.1968	39.3382
3	0.8654	-0.7635	-0.5982	1.0097	0.2511	0.6383	-0.3079	0.5381	-0.8522	-0.8523	-0.3889	0.3077	0.6577	-0.2259	-0.1836	0.9358	-0.2009	-0.1026	0.6519	-0.1852	0.9089	54.8263	-10.0811	22.2367
4	0.0258	-0.0367	-0.0458	0.0406	0.008	-0.0069	0.0471	0.4946	0.2312	0.0207	0.0847	-0.2435	0.3887	0.6044	-0.1483	0.5882	-0.1975	0.1291	0.6646	-0.2406	1.1851	49.5938	11.3286	27.3722
5	0.1785	0.0971	0.3471	0.1316	0.1911	0.6765	-0.3178	-0.2549	0.2554	0.6138	-0.11	1.2537	0.0831	-0.3139	-0.3656	0.482	0.221	0.9904	0.8027	0.237	-0.1046	19.0956	54.0799	39.0738
6	0.2522	-0.0688	-0.1318	0.1238	-0.1267	0.2566	-0.4977	0.5558	-0.1138	0.4724	0.3377	-0.1672	0.2803	-0.0174	-0.0217	0.1434	0.0525	-0.0223	1.1877	0.4147	1.4392	35.032	38.6596	31.9764
7	0.0266	-0.0102	-0.0278	0.0452	0.0088	-0.0401	-0.5723	-0.4771	0.0893	0.1841	-0.1425	0.8043	0.0627	-0.1943	0.0009	0.672	0.0689	0.1149	1.3002	0.2618	1.3784	14.6223	41.8718	31.3315
8	0.4815	0.3208	-0.0107	0.3179	-0.0803	0.0893	-0.0841	0.9553	0.6423	-0.0783	-0.01	0.6022	0.3577	0.3438	0.0352	0.5796	0.1678	0.0888	0.892	0.276	1.334	19.0634	61.9353	20.7437
9	0.1077	0.1331	0.0325	0.2799	0.047	0.1207	-0.0874	0.0605	-0.1826	0.7226	-0.2674	-0.6627	0.0057	0.1734	-0.0231	0.8807	0.0148	0.1107	1.0678	-0.0784	1.1747	75.0704	7.2219	16.0543
10	-0.0152	0.0727	-0.0128	-0.0617	0.0405	0.0375	0.6484	0.2714	-0.5417	0.1227	0.801	0.2004	-0.3722	-0.1212	-0.0027	0.7022	-0.04	-0.0127	0.889	0.1359	0.8494	46.4587	64.7122	15.3414
11	0.174	-0.3359	0.2577	0.8568	-0.2911	0.8631	-0.3557	0.3242	0.0923	-0.5286	-0.6325	-0.4307	-0.0635	0.3388	-0.3859	0.2865	0.256	0.2907	0.5487	-1.0404	-1.5052	75.516	32.4563	1.3129
12	0.0999	0.1259	-0.0708	0.8026	0.4746	0.7429	-0.2797	0.4018	0.4115	-0.7411	0.1703	0.7584	-0.2592	-0.0043	-0.073	0.3987	0.1816	-0.4277	0.9302	0.3296	-1.6065	44.342	37.8099	4.3331
13	-0.0025	0.0289	-0.0205	0.07	-0.0967	0.1025	-0.0516	-0.11	0.1086	0.3445	0.4921	-0.2726	-0.2154	-0.4971	0.0494	1.0481	0.4904	-0.2084	0.0439	0.202	1.8231	59.6434	42.3827	22.2473
14	0.3097	-0.1518	0.6751	0.0813	-0.3296	2.1251	0.0526	0.1354	0.2476	-0.0273	0.0016	-0.1713	-0.6689	-0.2083	-0.131	0.9576	-0.0766	0.1193	0.4388	-0.0242	1.7213	41.4446	3.4583	38.8182
15	0.0427	-0.011	0.0639	0.0222	-0.1083	0.332	-0.1724	-0.388	-0.9343	-0.2837	-0.0765	0.0065	0.6937	0.0446	0.2383	1.4064	-0.3141	0.1394	0.9201	0.0619	0.7479	44.3161	-14.5001	43.1401
16	0.0986	0.0031	-0.0458	0.0403	-0.0263	0.1032	-0.0453	0.4956	-0.4403	-0.1314	-0.3582	-0.0309	0.4239	0.3672	-0.1034	1.3814	-0.4261	-0.1932	-0.1246	0.9083	0.0243	54.3001	-12.3495	46.2541
17	0.6399	0.2704	-0.1733	1.9065	-0.6196	1.3045	-0.6233	-0.3046	-0.6389	1.0134	-0.2966	-0.4815	-0.1366	0.2441	-0.4231	0.2218	-0.2914	0.1227	0.0077	0.4685	0.8342	57.9488	-3.9424	41.636
18	0.1868	-0.0421	-0.2023	0.3826	-0.1022	0.1931	-0.1515	-0.1164	-0.3219	0.4218	-0.2632	0.0428	-0.0649	0.0902	-0.4587	0.6712	-0.1264	0.222	0.4157	-0.1598	0.6629	67.0308	-8.7701	22.3861
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37	0.0207	-0.0019	0.0326	0.0412	-0.0101	0.1842	-0.0089	-0.2708	-0.4914	0.3167	-0.2535	0.2911	-0.386	-0.0294	0.0006	0.7305	-0.0365	-0.0969	1.1092	0.1264	0.7198	39.1019	40.9386	12.6532
38	0.0228	0.0199	0.0148	-0.0146	0.0113	-0.0069	0.0414	-0.0022	-0.1194	-0.0136	0.2311	0.4071	-0.2246	-0.1229	0.0004	0.6493	-0.406	-1.4617	2.0852	0.3011	0.4335	52.7491	32.7361	15.296
39	0.0386	0.0198	-0.0372	-0.0235	0.0187	0.0102	-0.1658	0.0821	0.0399	0.2771	0.2642	-0.2807	-0.1491	0.8354	0.0002	2.302	1.6016	-0.4974	-0.0598	-0.3832	2.2649	65.244	31.1432	22.2335

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Selection details
1	X-RAY DIFFRACTION	1	chain 'A' and (resid -1 through 22 )
2	X-RAY DIFFRACTION	2	chain 'C' and (resid -1 through 22 )
3	X-RAY DIFFRACTION	3	chain 'E' and (resid -1 through 22 )
4	X-RAY DIFFRACTION	4	chain 'G' and (resid -1 through 22 )
5	X-RAY DIFFRACTION	5	chain 'I' and (resid -1 through 22 )
6	X-RAY DIFFRACTION	6	chain 'K' and (resid -1 through 22 )
7	X-RAY DIFFRACTION	7	chain 'M' and (resid -1 through 22 )
8	X-RAY DIFFRACTION	8	chain 'O' and (resid -1 through 22 )
9	X-RAY DIFFRACTION	9	chain 'Q' and (resid -1 through 22 )
10	X-RAY DIFFRACTION	10	chain 'S' and (resid -1 through 22 )
11	X-RAY DIFFRACTION	11	chain 'U' and (resid -1 through 22 )
12	X-RAY DIFFRACTION	12	chain 'W' and (resid -1 through 22 )
13	X-RAY DIFFRACTION	13	chain 'Y' and (resid -1 through 18 )
14	X-RAY DIFFRACTION	14	chain 'B' and (resid -1 through 22 )
15	X-RAY DIFFRACTION	15	chain 'a' and (resid 0 through 22 )
16	X-RAY DIFFRACTION	16	chain 'b' and (resid 1 through 22 )
17	X-RAY DIFFRACTION	17	chain 'D' and (resid 1 through 22 )
18	X-RAY DIFFRACTION	18	chain 'F' and (resid -1 through 22 )
19	X-RAY DIFFRACTION	19	chain 'c' and (resid -1 through 22 )
20	X-RAY DIFFRACTION	20	chain 'H' and (resid 0 through 22 )
21	X-RAY DIFFRACTION	21	chain 'd' and (resid -1 through 22 )
22	X-RAY DIFFRACTION	22	chain 'J' and (resid -1 through 22 )
23	X-RAY DIFFRACTION	23	chain 'e' and (resid -1 through 22 )
24	X-RAY DIFFRACTION	24	chain 'L' and (resid -1 through 22 )
25	X-RAY DIFFRACTION	25	chain 'f' and (resid -1 through 22 )
26	X-RAY DIFFRACTION	26	chain 'N' and (resid -1 through 22 )
27	X-RAY DIFFRACTION	27	chain 'g' and (resid -1 through 22 )
28	X-RAY DIFFRACTION	28	chain 'P' and (resid 0 through 22 )
29	X-RAY DIFFRACTION	29	chain 'h' and (resid -1 through 22 )
30	X-RAY DIFFRACTION	30	chain 'R' and (resid 0 through 22 )
31	X-RAY DIFFRACTION	31	chain 'i' and (resid -1 through 22 )
32	X-RAY DIFFRACTION	32	chain 'T' and (resid -1 through 22 )
33	X-RAY DIFFRACTION	33	chain 'j' and (resid -1 through 22 )
34	X-RAY DIFFRACTION	34	chain 'V' and (resid -1 through 22 )
35	X-RAY DIFFRACTION	35	chain 'k' and (resid -1 through 22 )
36	X-RAY DIFFRACTION	36	chain 'X' and (resid 0 through 22 )
37	X-RAY DIFFRACTION	37	chain 'l' and (resid -1 through 22 )
38	X-RAY DIFFRACTION	38	chain 'Z' and (resid -1 through 12 )
39	X-RAY DIFFRACTION	39	chain 'm' and (resid 1 through 22 )

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

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これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

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新型コロナ情報

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万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
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