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基本情報
登録情報
データベース: PDB / ID: 5i5w
タイトル
X-RAY CRYSTAL STRUCTURE AT 2.40A RESOLUTION OF HUMAN MITOCHONDRIAL BRANCHED CHAIN AMINOTRANSFERASE (BCATM) COMPLEXED WITH A BIARYL AMIDE COMPOUND AND AN INTERNAL ALDIMINE LINKED PLP COFACTOR.
モノクロメーター: Ni filter / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長
波長: 1.5418 Å / 相対比: 1
反射
解像度: 2.4→75.404 Å / Num. obs: 30622 / % possible obs: 97.8 % / 冗長度: 4.9 % / Biso Wilson estimate: 41.3 Å2 / Rmerge(I) obs: 0.112 / Net I/av σ(I): 6.046 / Net I/σ(I): 11
反射 シェル
解像度 (Å)
冗長度 (%)
Rmerge(I) obs
Mean I/σ(I) obs
Diffraction-ID
% possible all
2.4-2.53
4.6
0.537
1.4
1
96.1
2.53-2.68
4.8
0.393
1.9
1
97.1
2.68-2.87
5
0.28
2.7
1
97.4
2.87-3.1
5.1
0.192
3.9
1
98.5
3.1-3.39
5.2
0.13
5.7
1
98.5
3.39-3.79
5.1
0.088
8.3
1
98.5
3.79-4.38
5
0.073
9.6
1
98.5
4.38-5.37
4.9
0.06
10.5
1
98.8
5.37-7.59
4.8
0.064
9
1
99.2
7.59-105.7
4.3
0.044
11.8
1
97.8
-
解析
ソフトウェア
名称
バージョン
分類
SCALA
3.3.16
データスケーリング
REFMAC
5.7.0032
精密化
PDB_EXTRACT
3.2
データ抽出
XDS
データ削減
REFMAC
位相決定
精密化
構造決定の手法: フーリエ合成 開始モデル: In-house structure 解像度: 2.4→20 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.948 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.903 / SU B: 8.833 / SU ML: 0.205 / SU R Cruickshank DPI: 0.5845 / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 0 / ESU R: 0.584 / ESU R Free: 0.289 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS U VALUES : REFINED INDIVIDUALLY