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基本情報
登録情報
データベース: PDB / ID: 5i5t
タイトル
X-RAY CRYSTAL STRUCTURE AT 2.31A RESOLUTION OF HUMAN MITOCHONDRIAL BRANCHED CHAIN AMINOTRANSFERASE (BCATM) COMPLEXED WITH A TETRAHYDROQUINOLINE COMPOUND AND AN INTERNAL ALDIMINE LINKED PLP COFACTOR.
プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長
波長: 1.5418 Å / 相対比: 1
反射
解像度: 2.308→107.798 Å / Num. obs: 35306 / % possible obs: 99.5 % / 冗長度: 5.4 % / Biso Wilson estimate: 36.4 Å2 / Rmerge(I) obs: 0.093 / Net I/av σ(I): 7.724 / Net I/σ(I): 14.8
反射 シェル
解像度 (Å)
冗長度 (%)
Rmerge(I) obs
Mean I/σ(I) obs
Diffraction-ID
% possible all
2.31-2.43
5.4
0.497
1.5
1
99.8
2.43-2.58
5.5
0.402
1.9
1
99.8
2.58-2.76
5.5
0.281
2.7
1
99.8
2.76-2.98
5.5
0.187
4.1
1
99.9
2.98-3.26
5.5
0.116
6.3
1
99.9
3.26-3.65
5.5
0.067
11
1
99.8
3.65-4.21
5.5
0.044
15.7
1
99.4
4.21-5.16
5.4
0.033
20.1
1
99.2
5.16-7.3
5.3
0.043
14.1
1
98.1
7.3-107.798
4.8
0.029
18.1
1
95.4
-
解析
ソフトウェア
名称
バージョン
分類
SCALA
3.3.16
データスケーリング
REFMAC
5.7.0032
精密化
PDB_EXTRACT
3.2
データ抽出
XDS
データ削減
REFMAC
位相決定
精密化
構造決定の手法: フーリエ合成 開始モデル: In-house structure 解像度: 2.31→20 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.957 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.92 / SU B: 7.088 / SU ML: 0.169 / SU R Cruickshank DPI: 0.3629 / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 0 / ESU R: 0.363 / ESU R Free: 0.243 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS U VALUES : REFINED INDIVIDUALLY