PDB-5hzt: Crystal structure of Dronpa-Cu2+

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB / ID: 5hzt
• タイトル: Crystal structure of Dronpa-Cu2+
• 要素: Fluorescent protein Dronpa
• キーワード: LUMINESCENT PROTEIN / Fluorescent Protein

機能・相同性

分子機能:

bioluminescence / generation of precursor metabolites and energy / identical protein binding / metal ion binding

ドメイン・相同性:

Green Fluorescent Protein / Green fluorescent protein / Green fluorescent protein, GFP / Green fluorescent protein-related / Green fluorescent protein / Green fluorescent protein / Beta Barrel / Mainly Beta

構成要素:

COPPER (II) ION / Fluorescent protein Dronpa

• 生物種: Echinophyllia sp. SC22 (無脊椎動物)
• 手法: X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 2.84 Å
• データ登録者: Hwang, K.Y. / Nam, K.H.

資金援助

韓国, 2件

組織	認可番号	国
National Research Foundation of Korea (NRF) grant funded by the Korea government (MEST)	NRF-2014R1A1A2059440	韓国
National Research Foundation of Korea (NRF) grant funded by the Korea government (MEST)	NRF-2014R1212513	韓国

• 引用: ジャーナル: FEBS Lett. / 年: 2016; タイトル: Crystal structures of Dronpa complexed with quenchable metal ions provide insight into metal biosensor development; 著者: Kim, I.J. / Kim, S. / Park, J. / Eom, I. / Kim, S. / Kim, J.H. / Ha, S.C. / Kim, Y.G. / Hwang, K.Y. / Nam, K.H.

履歴

登録	2016年2月3日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: PDBJ
改定 1.0	2017年3月15日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2018年11月28日	Group: Data collection / Database references / カテゴリ: citation / citation_author Item: _citation.country / _citation.journal_abbrev / _citation.journal_id_ASTM / _citation.journal_id_CSD / _citation.journal_id_ISSN / _citation.journal_volume / _citation.page_first / _citation.page_last / _citation.pdbx_database_id_DOI / _citation.pdbx_database_id_PubMed / _citation.title / _citation.year
改定 1.2	2023年11月8日	Group: Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / struct_conn / struct_ncs_dom_lim Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_conn.conn_type_id / _struct_conn.id / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_symmetry / _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_seq_id / _struct_ncs_dom_lim.end_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_seq_id
改定 2.0	2023年11月15日	Group: Atomic model / Data collection / Derived calculations カテゴリ: atom_site / chem_comp_atom / chem_comp_bond / pdbx_validate_main_chain_plane / pdbx_validate_rmsd_angle / pdbx_validate_torsion / struct_conn Item: _atom_site.auth_atom_id / _atom_site.label_atom_id / _chem_comp_atom.atom_id / _chem_comp_bond.atom_id_1 / _chem_comp_bond.atom_id_2 / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id

集合体

登録構造単位

A: Fluorescent protein Dronpa

B: Fluorescent protein Dronpa

C: Fluorescent protein Dronpa

D: Fluorescent protein Dronpa

E: Fluorescent protein Dronpa

F: Fluorescent protein Dronpa

G: Fluorescent protein Dronpa

H: Fluorescent protein Dronpa

I: Fluorescent protein Dronpa

J: Fluorescent protein Dronpa

K: Fluorescent protein Dronpa

L: Fluorescent protein Dronpa

ヘテロ分子

概要:

• 297 kDa, 12 ポリマー

構成要素の詳細:

	分子量 (理論値)	分子数
合計 (水以外)	297,383	36
ポリマ－	295,857	12
非ポリマー	1,525	24
水	1,099	61

1

A: Fluorescent protein Dronpa

ヘテロ分子

概要:

• 登録者・ソフトウェアが定義した集合体
• 24.8 kDa, 1 ポリマー

構成要素の詳細:

	分子量 (理論値)	分子数
合計 (水以外)	24,782	3
ポリマ－	24,655	1
非ポリマー	127	2
水	18	1

対称操作:

タイプ	名称	対称操作	数
identity operation	1_555	x,y,z	1

計算値:

Buried area	210 Å2
ΔGint	-14 kcal/mol
Surface area	9620 Å2
手法	PISA

2

B: Fluorescent protein Dronpa

ヘテロ分子

概要:

• 登録者・ソフトウェアが定義した集合体
• 24.8 kDa, 1 ポリマー

構成要素の詳細:

	分子量 (理論値)	分子数
合計 (水以外)	24,782	3
ポリマ－	24,655	1
非ポリマー	127	2
水	18	1

対称操作:

タイプ	名称	対称操作	数
identity operation	1_555	x,y,z	1

計算値:

Buried area	220 Å2
ΔGint	-14 kcal/mol
Surface area	9770 Å2
手法	PISA

3

C: Fluorescent protein Dronpa

ヘテロ分子

概要:

• 登録者・ソフトウェアが定義した集合体
• 24.8 kDa, 1 ポリマー

構成要素の詳細:

	分子量 (理論値)	分子数
合計 (水以外)	24,782	3
ポリマ－	24,655	1
非ポリマー	127	2
水	18	1

対称操作:

タイプ	名称	対称操作	数
identity operation	1_555	x,y,z	1

計算値:

Buried area	220 Å2
ΔGint	-15 kcal/mol
Surface area	9870 Å2
手法	PISA

4

D: Fluorescent protein Dronpa

ヘテロ分子

概要:

• 登録者・ソフトウェアが定義した集合体
• 24.8 kDa, 1 ポリマー

構成要素の詳細:

	分子量 (理論値)	分子数
合計 (水以外)	24,782	3
ポリマ－	24,655	1
非ポリマー	127	2
水	18	1

対称操作:

タイプ	名称	対称操作	数
identity operation	1_555	x,y,z	1

計算値:

Buried area	220 Å2
ΔGint	-14 kcal/mol
Surface area	9890 Å2
手法	PISA

5

E: Fluorescent protein Dronpa

ヘテロ分子

概要:

• 登録者・ソフトウェアが定義した集合体
• 24.8 kDa, 1 ポリマー

構成要素の詳細:

	分子量 (理論値)	分子数
合計 (水以外)	24,782	3
ポリマ－	24,655	1
非ポリマー	127	2
水	18	1

対称操作:

タイプ	名称	対称操作	数
identity operation	1_555	x,y,z	1

計算値:

Buried area	210 Å2
ΔGint	-14 kcal/mol
Surface area	9900 Å2
手法	PISA

6

F: Fluorescent protein Dronpa

ヘテロ分子

概要:

• 登録者・ソフトウェアが定義した集合体
• 24.8 kDa, 1 ポリマー

構成要素の詳細:

	分子量 (理論値)	分子数
合計 (水以外)	24,782	3
ポリマ－	24,655	1
非ポリマー	127	2
水	18	1

対称操作:

タイプ	名称	対称操作	数
identity operation	1_555	x,y,z	1

計算値:

Buried area	220 Å2
ΔGint	-14 kcal/mol
Surface area	9930 Å2
手法	PISA

7

G: Fluorescent protein Dronpa

ヘテロ分子

概要:

• 登録者・ソフトウェアが定義した集合体
• 24.8 kDa, 1 ポリマー

構成要素の詳細:

	分子量 (理論値)	分子数
合計 (水以外)	24,782	3
ポリマ－	24,655	1
非ポリマー	127	2
水	18	1

対称操作:

タイプ	名称	対称操作	数
identity operation	1_555	x,y,z	1

計算値:

Buried area	210 Å2
ΔGint	-13 kcal/mol
Surface area	9910 Å2
手法	PISA

8

H: Fluorescent protein Dronpa

ヘテロ分子

概要:

• 登録者・ソフトウェアが定義した集合体
• 24.8 kDa, 1 ポリマー

構成要素の詳細:

	分子量 (理論値)	分子数
合計 (水以外)	24,782	3
ポリマ－	24,655	1
非ポリマー	127	2
水	18	1

対称操作:

タイプ	名称	対称操作	数
identity operation	1_555	x,y,z	1

計算値:

Buried area	220 Å2
ΔGint	-14 kcal/mol
Surface area	9940 Å2
手法	PISA

9

I: Fluorescent protein Dronpa

ヘテロ分子

概要:

• 登録者・ソフトウェアが定義した集合体
• 24.8 kDa, 1 ポリマー

構成要素の詳細:

	分子量 (理論値)	分子数
合計 (水以外)	24,782	3
ポリマ－	24,655	1
非ポリマー	127	2
水	18	1

対称操作:

タイプ	名称	対称操作	数
identity operation	1_555	x,y,z	1

計算値:

Buried area	210 Å2
ΔGint	-13 kcal/mol
Surface area	9830 Å2
手法	PISA

10

J: Fluorescent protein Dronpa

ヘテロ分子

概要:

• 登録者・ソフトウェアが定義した集合体
• 24.8 kDa, 1 ポリマー

構成要素の詳細:

	分子量 (理論値)	分子数
合計 (水以外)	24,782	3
ポリマ－	24,655	1
非ポリマー	127	2
水	18	1

対称操作:

タイプ	名称	対称操作	数
identity operation	1_555	x,y,z	1

計算値:

Buried area	220 Å2
ΔGint	-14 kcal/mol
Surface area	9780 Å2
手法	PISA

11

K: Fluorescent protein Dronpa

ヘテロ分子

概要:

• 登録者・ソフトウェアが定義した集合体
• 24.8 kDa, 1 ポリマー

構成要素の詳細:

	分子量 (理論値)	分子数
合計 (水以外)	24,782	3
ポリマ－	24,655	1
非ポリマー	127	2
水	18	1

対称操作:

タイプ	名称	対称操作	数
identity operation	1_555	x,y,z	1

計算値:

Buried area	210 Å2
ΔGint	-13 kcal/mol
Surface area	9460 Å2
手法	PISA

12

L: Fluorescent protein Dronpa

ヘテロ分子

概要:

• 登録者・ソフトウェアが定義した集合体
• 24.8 kDa, 1 ポリマー

構成要素の詳細:

	分子量 (理論値)	分子数
合計 (水以外)	24,782	3
ポリマ－	24,655	1
非ポリマー	127	2
水	18	1

対称操作:

タイプ	名称	対称操作	数
identity operation	1_555	x,y,z	1

計算値:

Buried area	220 Å2
ΔGint	-15 kcal/mol
Surface area	9920 Å2
手法	PISA

単位格子

Length a, b, c (Å)	72.268, 105.961, 108.030
Angle α, β, γ (deg.)	115.890, 107.680, 94.120
Int Tables number	1
Space group name H-M	P1

非結晶学的対称性 (NCS)

NCSドメイン:

ID	Ens-ID	詳細
1	1	A
2	1	B
1	2	A
2	2	C
1	3	A
2	3	D
1	4	A
2	4	E
1	5	A
2	5	F
1	6	A
2	6	G
1	7	A
2	7	H
1	8	A
2	8	I
1	9	A
2	9	J
1	10	A
2	10	K
1	11	A
2	11	L
1	12	A
2	12	B
1	13	A
2	13	C
1	14	A
2	14	D
1	15	A
2	15	E
1	16	A
2	16	F
1	17	A
2	17	G
1	18	A
2	18	H
1	19	A
2	19	I
1	20	A
2	20	J
1	21	A
2	21	K
1	22	A
2	22	L
1	23	B
2	23	C
1	24	B
2	24	D
1	25	B
2	25	E
1	26	B
2	26	F
1	27	B
2	27	G
1	28	B
2	28	H
1	29	B
2	29	I
1	30	B
2	30	J
1	31	B
2	31	K
1	32	B
2	32	L
1	33	B
2	33	C
1	34	B
2	34	D
1	35	B
2	35	E
1	36	B
2	36	F
1	37	B
2	37	G
1	38	B
2	38	H
1	39	B
2	39	I
1	40	B
2	40	J
1	41	B
2	41	K
1	42	B
2	42	L
1	43	C
2	43	D
1	44	C
2	44	E
1	45	C
2	45	F
1	46	C
2	46	G
1	47	C
2	47	H
1	48	C
2	48	I
1	49	C
2	49	J
1	50	C
2	50	K
1	51	C
2	51	L
1	52	C
2	52	D
1	53	C
2	53	E
1	54	C
2	54	F
1	55	C
2	55	G
1	56	C
2	56	H
1	57	C
2	57	I
1	58	C
2	58	J
1	59	C
2	59	K
1	60	C
2	60	L
1	61	D
2	61	E
1	62	D
2	62	F
1	63	D
2	63	G
1	64	D
2	64	H
1	65	D
2	65	I
1	66	D
2	66	J
1	67	D
2	67	K
1	68	D
2	68	L
1	69	D
2	69	E
1	70	D
2	70	F
1	71	D
2	71	G
1	72	D
2	72	H
1	73	D
2	73	I
1	74	D
2	74	J
1	75	D
2	75	K
1	76	D
2	76	L
1	77	E
2	77	F
1	78	E
2	78	G
1	79	E
2	79	H
1	80	E
2	80	I
1	81	E
2	81	J
1	82	E
2	82	K
1	83	E
2	83	L
1	84	E
2	84	F
1	85	E
2	85	G
1	86	E
2	86	H
1	87	E
2	87	I
1	88	E
2	88	J
1	89	E
2	89	K
1	90	E
2	90	L
1	91	F
2	91	G
1	92	F
2	92	H
1	93	F
2	93	I
1	94	F
2	94	J
1	95	F
2	95	K
1	96	F
2	96	L
1	97	F
2	97	G
1	98	F
2	98	H
1	99	F
2	99	I
1	100	F
2	100	J
1	101	F
2	101	K
1	102	F
2	102	L
1	103	G
2	103	H
1	104	G
2	104	I
1	105	G
2	105	J
1	106	G
2	106	K
1	107	G
2	107	L
1	108	G
2	108	H
1	109	G
2	109	I
1	110	G
2	110	J
1	111	G
2	111	K
1	112	G
2	112	L
1	113	H
2	113	I
1	114	H
2	114	J
1	115	H
2	115	K
1	116	H
2	116	L
1	117	H
2	117	I
1	118	H
2	118	J
1	119	H
2	119	K
1	120	H
2	120	L
1	121	I
2	121	J
1	122	I
2	122	K
1	123	I
2	123	L
1	124	I
2	124	J
1	125	I
2	125	K
1	126	I
2	126	L
1	127	J
2	127	K
1	128	J
2	128	L
1	129	J
2	129	K
1	130	J
2	130	L
1	131	K
2	131	L
1	132	K
2	132	L

NCSドメイン領域:

Component-ID: _ / Refine code: _

Dom-ID	Ens-ID	Beg auth comp-ID	Beg label comp-ID	End auth comp-ID	End label comp-ID	Auth asym-ID	Label asym-ID	Auth seq-ID	Label seq-ID
1	1	VAL	VAL	PHE	PHE	A	A	3 - 61	2 - 60
2	1	VAL	VAL	PHE	PHE	B	B	3 - 61	2 - 60
1	2	VAL	VAL	VAL	VAL	A	A	3 - 60	2 - 59
2	2	VAL	VAL	VAL	VAL	C	C	3 - 60	2 - 59
1	3	VAL	VAL	VAL	VAL	A	A	3 - 60	2 - 59
2	3	VAL	VAL	VAL	VAL	D	D	3 - 60	2 - 59
1	4	VAL	VAL	VAL	VAL	A	A	3 - 60	2 - 59
2	4	VAL	VAL	VAL	VAL	E	E	3 - 60	2 - 59
1	5	VAL	VAL	PHE	PHE	A	A	3 - 61	2 - 60
2	5	VAL	VAL	PHE	PHE	F	F	3 - 61	2 - 60
1	6	VAL	VAL	VAL	VAL	A	A	3 - 60	2 - 59
2	6	VAL	VAL	VAL	VAL	G	G	3 - 60	2 - 59
1	7	VAL	VAL	VAL	VAL	A	A	3 - 60	2 - 59
2	7	VAL	VAL	VAL	VAL	H	H	3 - 60	2 - 59
1	8	VAL	VAL	PHE	PHE	A	A	3 - 61	2 - 60
2	8	VAL	VAL	PHE	PHE	I	I	3 - 61	2 - 60
1	9	VAL	VAL	VAL	VAL	A	A	3 - 60	2 - 59
2	9	VAL	VAL	VAL	VAL	J	J	3 - 60	2 - 59
1	10	VAL	VAL	PHE	PHE	A	A	3 - 61	2 - 60
2	10	VAL	VAL	PHE	PHE	K	K	3 - 61	2 - 60
1	11	VAL	VAL	PHE	PHE	A	A	3 - 61	2 - 60
2	11	VAL	VAL	PHE	PHE	L	L	3 - 61	2 - 60
1	12	ASN	ASN	HIS	HIS	A	A	65 - 216	62 - 213
2	12	ASN	ASN	HIS	HIS	B	B	74 - 216	71 - 213
1	13	ASN	ASN	SER	SER	A	A	65 - 217	62 - 214
2	13	ASN	ASN	SER	SER	C	C	74 - 217	71 - 214
1	14	ASN	ASN	SER	SER	A	A	65 - 217	62 - 214
2	14	ASN	ASN	SER	SER	D	D	74 - 217	71 - 214
1	15	ASN	ASN	SER	SER	A	A	65 - 217	62 - 214
2	15	ASN	ASN	SER	SER	E	E	74 - 217	71 - 214
1	16	ASN	ASN	SER	SER	A	A	65 - 217	62 - 214
2	16	ASN	ASN	SER	SER	F	F	74 - 217	71 - 214
1	17	ASN	ASN	SER	SER	A	A	65 - 217	62 - 214
2	17	ASN	ASN	SER	SER	G	G	74 - 217	71 - 214
1	18	ASN	ASN	SER	SER	A	A	65 - 217	62 - 214
2	18	ASN	ASN	SER	SER	H	H	74 - 217	71 - 214
1	19	ASN	ASN	SER	SER	A	A	65 - 217	62 - 214
2	19	ASN	ASN	SER	SER	I	I	74 - 217	71 - 214
1	20	ASN	ASN	HIS	HIS	A	A	65 - 216	62 - 213
2	20	ASN	ASN	HIS	HIS	J	J	74 - 216	71 - 213
1	21	ASN	ASN	ALA	ALA	A	A	65 - 215	62 - 212
2	21	ASN	ASN	ALA	ALA	K	K	65 - 215	62 - 212
1	22	ASN	ASN	SER	SER	A	A	65 - 217	62 - 214
2	22	ASN	ASN	SER	SER	L	L	74 - 217	71 - 214
1	23	VAL	VAL	VAL	VAL	B	B	3 - 60	2 - 59
2	23	VAL	VAL	VAL	VAL	C	C	3 - 60	2 - 59
1	24	VAL	VAL	VAL	VAL	B	B	3 - 60	2 - 59
2	24	VAL	VAL	VAL	VAL	D	D	3 - 60	2 - 59
1	25	VAL	VAL	VAL	VAL	B	B	3 - 60	2 - 59
2	25	VAL	VAL	VAL	VAL	E	E	3 - 60	2 - 59
1	26	VAL	VAL	PHE	PHE	B	B	3 - 61	2 - 60
2	26	VAL	VAL	PHE	PHE	F	F	3 - 61	2 - 60
1	27	VAL	VAL	VAL	VAL	B	B	3 - 60	2 - 59
2	27	VAL	VAL	VAL	VAL	G	G	3 - 60	2 - 59
1	28	VAL	VAL	VAL	VAL	B	B	3 - 60	2 - 59
2	28	VAL	VAL	VAL	VAL	H	H	3 - 60	2 - 59
1	29	VAL	VAL	PHE	PHE	B	B	3 - 61	2 - 60
2	29	VAL	VAL	PHE	PHE	I	I	3 - 61	2 - 60
1	30	VAL	VAL	VAL	VAL	B	B	3 - 60	2 - 59
2	30	VAL	VAL	VAL	VAL	J	J	3 - 60	2 - 59
1	31	VAL	VAL	PHE	PHE	B	B	3 - 61	2 - 60
2	31	VAL	VAL	PHE	PHE	K	K	3 - 61	2 - 60
1	32	VAL	VAL	PHE	PHE	B	B	3 - 61	2 - 60
2	32	VAL	VAL	PHE	PHE	L	L	3 - 61	2 - 60
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2	33	ASN	ASN	SER	SER	C	C	65 - 217	62 - 214
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2	34	ASN	ASN	SER	SER	D	D	65 - 217	62 - 214
1	35	ASN	ASN	SER	SER	B	B	65 - 217	62 - 214
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2	38	ASN	ASN	SER	SER	H	H	65 - 217	62 - 214
1	39	ASN	ASN	SER	SER	B	B	65 - 217	62 - 214
2	39	ASN	ASN	SER	SER	I	I	65 - 217	62 - 214
1	40	ASN	ASN	SER	SER	B	B	65 - 217	62 - 214
2	40	ASN	ASN	SER	SER	J	J	65 - 217	62 - 214
1	41	ASN	ASN	GLU	GLU	B	B	74 - 214	71 - 211
2	41	ASN	ASN	GLU	GLU	K	K	65 - 214	62 - 211
1	42	ASN	ASN	SER	SER	B	B	65 - 217	62 - 214
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1	43	SER	SER	PHE	PHE	C	C	2 - 61	1 - 60
2	43	SER	SER	PHE	PHE	D	D	2 - 61	1 - 60
1	44	SER	SER	PHE	PHE	C	C	2 - 61	1 - 60
2	44	SER	SER	PHE	PHE	E	E	2 - 61	1 - 60
1	45	VAL	VAL	VAL	VAL	C	C	3 - 60	2 - 59
2	45	VAL	VAL	VAL	VAL	F	F	3 - 60	2 - 59
1	46	SER	SER	PHE	PHE	C	C	2 - 61	1 - 60
2	46	SER	SER	PHE	PHE	G	G	2 - 61	1 - 60
1	47	SER	SER	PHE	PHE	C	C	2 - 61	1 - 60
2	47	SER	SER	PHE	PHE	H	H	2 - 61	1 - 60
1	48	VAL	VAL	VAL	VAL	C	C	3 - 60	2 - 59
2	48	VAL	VAL	VAL	VAL	I	I	3 - 60	2 - 59
1	49	SER	SER	PHE	PHE	C	C	2 - 61	1 - 60
2	49	SER	SER	PHE	PHE	J	J	2 - 61	1 - 60
1	50	VAL	VAL	VAL	VAL	C	C	3 - 60	2 - 59
2	50	VAL	VAL	VAL	VAL	K	K	3 - 60	2 - 59
1	51	VAL	VAL	VAL	VAL	C	C	3 - 60	2 - 59
2	51	VAL	VAL	VAL	VAL	L	L	3 - 60	2 - 59
1	52	ASN	ASN	HIS	HIS	C	C	65 - 216	62 - 213
2	52	ASN	ASN	HIS	HIS	D	D	65 - 216	62 - 213
1	53	ASN	ASN	HIS	HIS	C	C	65 - 216	62 - 213
2	53	ASN	ASN	HIS	HIS	E	E	65 - 216	62 - 213
1	54	ASN	ASN	HIS	HIS	C	C	65 - 216	62 - 213
2	54	ASN	ASN	HIS	HIS	F	F	65 - 216	62 - 213
1	55	ASN	ASN	SER	SER	C	C	65 - 217	62 - 214
2	55	ASN	ASN	SER	SER	G	G	65 - 217	62 - 214
1	56	ASN	ASN	HIS	HIS	C	C	65 - 216	62 - 213
2	56	ASN	ASN	HIS	HIS	H	H	65 - 216	62 - 213
1	57	ASN	ASN	SER	SER	C	C	65 - 217	62 - 214
2	57	ASN	ASN	SER	SER	I	I	65 - 217	62 - 214
1	58	ASN	ASN	SER	SER	C	C	65 - 217	62 - 214
2	58	ASN	ASN	SER	SER	J	J	65 - 217	62 - 214
1	59	ASN	ASN	ALA	ALA	C	C	74 - 215	71 - 212
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2	60	ASN	ASN	HIS	HIS	L	L	65 - 216	62 - 213
1	61	SER	SER	PHE	PHE	D	D	2 - 61	1 - 60
2	61	SER	SER	PHE	PHE	E	E	2 - 61	1 - 60
1	62	VAL	VAL	VAL	VAL	D	D	3 - 60	2 - 59
2	62	VAL	VAL	VAL	VAL	F	F	3 - 60	2 - 59
1	63	SER	SER	PHE	PHE	D	D	2 - 61	1 - 60
2	63	SER	SER	PHE	PHE	G	G	2 - 61	1 - 60
1	64	SER	SER	PHE	PHE	D	D	2 - 61	1 - 60
2	64	SER	SER	PHE	PHE	H	H	2 - 61	1 - 60
1	65	VAL	VAL	VAL	VAL	D	D	3 - 60	2 - 59
2	65	VAL	VAL	VAL	VAL	I	I	3 - 60	2 - 59
1	66	SER	SER	PHE	PHE	D	D	2 - 61	1 - 60
2	66	SER	SER	PHE	PHE	J	J	2 - 61	1 - 60
1	67	VAL	VAL	VAL	VAL	D	D	3 - 60	2 - 59
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2	68	VAL	VAL	VAL	VAL	L	L	3 - 60	2 - 59
1	69	ASN	ASN	GLU	GLU	D	D	65 - 218	62 - 215
2	69	ASN	ASN	GLU	GLU	E	E	65 - 218	62 - 215
1	70	ASN	ASN	GLU	GLU	D	D	65 - 218	62 - 215
2	70	ASN	ASN	GLU	GLU	F	F	65 - 218	62 - 215
1	71	ASN	ASN	HIS	HIS	D	D	65 - 216	62 - 213
2	71	ASN	ASN	HIS	HIS	G	G	65 - 216	62 - 213
1	72	ASN	ASN	GLU	GLU	D	D	65 - 218	62 - 215
2	72	ASN	ASN	GLU	GLU	H	H	65 - 218	62 - 215
1	73	ASN	ASN	HIS	HIS	D	D	65 - 216	62 - 213
2	73	ASN	ASN	HIS	HIS	I	I	65 - 216	62 - 213
1	74	ASN	ASN	SER	SER	D	D	65 - 217	62 - 214
2	74	ASN	ASN	SER	SER	J	J	65 - 217	62 - 214
1	75	ASN	ASN	ALA	ALA	D	D	74 - 215	71 - 212
2	75	ASN	ASN	ALA	ALA	K	K	65 - 215	62 - 212
1	76	ASN	ASN	GLU	GLU	D	D	65 - 218	62 - 215
2	76	ASN	ASN	GLU	GLU	L	L	65 - 218	62 - 215
1	77	VAL	VAL	VAL	VAL	E	E	3 - 60	2 - 59
2	77	VAL	VAL	VAL	VAL	F	F	3 - 60	2 - 59
1	78	SER	SER	PHE	PHE	E	E	2 - 61	1 - 60
2	78	SER	SER	PHE	PHE	G	G	2 - 61	1 - 60
1	79	SER	SER	PHE	PHE	E	E	2 - 61	1 - 60
2	79	SER	SER	PHE	PHE	H	H	2 - 61	1 - 60
1	80	VAL	VAL	VAL	VAL	E	E	3 - 60	2 - 59
2	80	VAL	VAL	VAL	VAL	I	I	3 - 60	2 - 59
1	81	SER	SER	PHE	PHE	E	E	2 - 61	1 - 60
2	81	SER	SER	PHE	PHE	J	J	2 - 61	1 - 60
1	82	VAL	VAL	VAL	VAL	E	E	3 - 60	2 - 59
2	82	VAL	VAL	VAL	VAL	K	K	3 - 60	2 - 59
1	83	VAL	VAL	VAL	VAL	E	E	3 - 60	2 - 59
2	83	VAL	VAL	VAL	VAL	L	L	3 - 60	2 - 59
1	84	ASN	ASN	GLU	GLU	E	E	65 - 218	62 - 215
2	84	ASN	ASN	GLU	GLU	F	F	65 - 218	62 - 215
1	85	ASN	ASN	HIS	HIS	E	E	65 - 216	62 - 213
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2	86	ASN	ASN	GLU	GLU	H	H	65 - 218	62 - 215
1	87	ASN	ASN	HIS	HIS	E	E	65 - 216	62 - 213
2	87	ASN	ASN	HIS	HIS	I	I	65 - 216	62 - 213
1	88	ASN	ASN	SER	SER	E	E	65 - 217	62 - 214
2	88	ASN	ASN	SER	SER	J	J	65 - 217	62 - 214
1	89	ASN	ASN	ALA	ALA	E	E	74 - 215	71 - 212
2	89	ASN	ASN	ALA	ALA	K	K	65 - 215	62 - 212
1	90	ASN	ASN	GLU	GLU	E	E	65 - 218	62 - 215
2	90	ASN	ASN	GLU	GLU	L	L	65 - 218	62 - 215
1	91	VAL	VAL	VAL	VAL	F	F	3 - 60	2 - 59
2	91	VAL	VAL	VAL	VAL	G	G	3 - 60	2 - 59
1	92	VAL	VAL	VAL	VAL	F	F	3 - 60	2 - 59
2	92	VAL	VAL	VAL	VAL	H	H	3 - 60	2 - 59
1	93	VAL	VAL	PHE	PHE	F	F	3 - 61	2 - 60
2	93	VAL	VAL	PHE	PHE	I	I	3 - 61	2 - 60
1	94	VAL	VAL	VAL	VAL	F	F	3 - 60	2 - 59
2	94	VAL	VAL	VAL	VAL	J	J	3 - 60	2 - 59
1	95	VAL	VAL	PHE	PHE	F	F	3 - 61	2 - 60
2	95	VAL	VAL	PHE	PHE	K	K	3 - 61	2 - 60
1	96	VAL	VAL	PHE	PHE	F	F	3 - 61	2 - 60
2	96	VAL	VAL	PHE	PHE	L	L	3 - 61	2 - 60
1	97	ASN	ASN	HIS	HIS	F	F	65 - 216	62 - 213
2	97	ASN	ASN	HIS	HIS	G	G	65 - 216	62 - 213
1	98	ASN	ASN	GLU	GLU	F	F	65 - 218	62 - 215
2	98	ASN	ASN	GLU	GLU	H	H	65 - 218	62 - 215
1	99	ASN	ASN	HIS	HIS	F	F	65 - 216	62 - 213
2	99	ASN	ASN	HIS	HIS	I	I	65 - 216	62 - 213
1	100	ASN	ASN	SER	SER	F	F	65 - 217	62 - 214
2	100	ASN	ASN	SER	SER	J	J	65 - 217	62 - 214
1	101	ASN	ASN	ALA	ALA	F	F	74 - 215	71 - 212
2	101	ASN	ASN	ALA	ALA	K	K	65 - 215	62 - 212
1	102	ASN	ASN	GLU	GLU	F	F	65 - 218	62 - 215
2	102	ASN	ASN	GLU	GLU	L	L	65 - 218	62 - 215
1	103	SER	SER	PHE	PHE	G	G	2 - 61	1 - 60
2	103	SER	SER	PHE	PHE	H	H	2 - 61	1 - 60
1	104	VAL	VAL	VAL	VAL	G	G	3 - 60	2 - 59
2	104	VAL	VAL	VAL	VAL	I	I	3 - 60	2 - 59
1	105	SER	SER	PHE	PHE	G	G	2 - 61	1 - 60
2	105	SER	SER	PHE	PHE	J	J	2 - 61	1 - 60
1	106	VAL	VAL	VAL	VAL	G	G	3 - 60	2 - 59
2	106	VAL	VAL	VAL	VAL	K	K	3 - 60	2 - 59
1	107	VAL	VAL	VAL	VAL	G	G	3 - 60	2 - 59
2	107	VAL	VAL	VAL	VAL	L	L	3 - 60	2 - 59
1	108	ASN	ASN	HIS	HIS	G	G	65 - 216	62 - 213
2	108	ASN	ASN	HIS	HIS	H	H	65 - 216	62 - 213
1	109	ASN	ASN	SER	SER	G	G	65 - 217	62 - 214
2	109	ASN	ASN	SER	SER	I	I	65 - 217	62 - 214
1	110	ASN	ASN	SER	SER	G	G	65 - 217	62 - 214
2	110	ASN	ASN	SER	SER	J	J	65 - 217	62 - 214
1	111	ASN	ASN	ALA	ALA	G	G	74 - 215	71 - 212
2	111	ASN	ASN	ALA	ALA	K	K	65 - 215	62 - 212
1	112	ASN	ASN	HIS	HIS	G	G	65 - 216	62 - 213
2	112	ASN	ASN	HIS	HIS	L	L	65 - 216	62 - 213
1	113	VAL	VAL	VAL	VAL	H	H	3 - 60	2 - 59
2	113	VAL	VAL	VAL	VAL	I	I	3 - 60	2 - 59
1	114	SER	SER	PHE	PHE	H	H	2 - 61	1 - 60
2	114	SER	SER	PHE	PHE	J	J	2 - 61	1 - 60
1	115	VAL	VAL	VAL	VAL	H	H	3 - 60	2 - 59
2	115	VAL	VAL	VAL	VAL	K	K	3 - 60	2 - 59
1	116	VAL	VAL	VAL	VAL	H	H	3 - 60	2 - 59
2	116	VAL	VAL	VAL	VAL	L	L	3 - 60	2 - 59
1	117	ASN	ASN	HIS	HIS	H	H	65 - 216	62 - 213
2	117	ASN	ASN	HIS	HIS	I	I	65 - 216	62 - 213
1	118	ASN	ASN	SER	SER	H	H	65 - 217	62 - 214
2	118	ASN	ASN	SER	SER	J	J	65 - 217	62 - 214
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2	119	ASN	ASN	ALA	ALA	K	K	65 - 215	62 - 212
1	120	ASN	ASN	GLU	GLU	H	H	65 - 218	62 - 215
2	120	ASN	ASN	GLU	GLU	L	L	65 - 218	62 - 215
1	121	VAL	VAL	VAL	VAL	I	I	3 - 60	2 - 59
2	121	VAL	VAL	VAL	VAL	J	J	3 - 60	2 - 59
1	122	VAL	VAL	PHE	PHE	I	I	3 - 61	2 - 60
2	122	VAL	VAL	PHE	PHE	K	K	3 - 61	2 - 60
1	123	VAL	VAL	PHE	PHE	I	I	3 - 61	2 - 60
2	123	VAL	VAL	PHE	PHE	L	L	3 - 61	2 - 60
1	124	ASN	ASN	SER	SER	I	I	65 - 217	62 - 214
2	124	ASN	ASN	SER	SER	J	J	65 - 217	62 - 214
1	125	ASN	ASN	ALA	ALA	I	I	74 - 215	71 - 212
2	125	ASN	ASN	ALA	ALA	K	K	65 - 215	62 - 212
1	126	ASN	ASN	HIS	HIS	I	I	65 - 216	62 - 213
2	126	ASN	ASN	HIS	HIS	L	L	65 - 216	62 - 213
1	127	VAL	VAL	VAL	VAL	J	J	3 - 60	2 - 59
2	127	VAL	VAL	VAL	VAL	K	K	3 - 60	2 - 59
1	128	VAL	VAL	VAL	VAL	J	J	3 - 60	2 - 59
2	128	VAL	VAL	VAL	VAL	L	L	3 - 60	2 - 59
1	129	ASN	ASN	GLU	GLU	J	J	74 - 214	71 - 211
2	129	ASN	ASN	GLU	GLU	K	K	65 - 214	62 - 211
1	130	ASN	ASN	SER	SER	J	J	65 - 217	62 - 214
2	130	ASN	ASN	SER	SER	L	L	65 - 217	62 - 214
1	131	VAL	VAL	PHE	PHE	K	K	3 - 61	2 - 60
2	131	VAL	VAL	PHE	PHE	L	L	3 - 61	2 - 60
1	132	ASN	ASN	ALA	ALA	K	K	65 - 215	62 - 212
2	132	ASN	ASN	ALA	ALA	L	L	74 - 215	71 - 212

NCSアンサンブル:

ID
1
2
3
4
5
6
7
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124
125
126
127
128
129
130
131
132

要素

#1: タンパク質

A B C D E F G H I J K L
Fluorescent protein Dronpa

詳細:

分子量: 24654.785 Da / 分子数: 12 / 断片: UNP residues 2-218 / 由来タイプ: 組換発現
由来: (組換発現) Echinophyllia sp. SC22 (無脊椎動物)
遺伝子: Dronpa / 発現宿主: Escherichia coli BL21(DE3) (大腸菌) / 参照: UniProt: Q5TLG6

#2: 化合物

A-301 A-302 B-301 B-302 C-301 C-302 D-301 D-302 E-301 E-302 F-301 F-302 G-301 G-302 H-301 H-302 I-301 I-302 J-301 J-302 ...
ChemComp-CU / COPPER (II) ION

詳細:

分子量: 63.546 Da / 分子数: 24 / 由来タイプ: 合成 / 式: Cu

#3: 水

ChemComp-HOH / water

詳細:

分子量: 18.015 Da / 分子数: 61 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

実験情報

実験

• 実験: 手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

試料調製

• 結晶: マシュー密度: 2.33 ų/Da / 溶媒含有率: 47.15 %
• 結晶化: 温度: 295.5 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 8.5 / 詳細: PEG 4000, Tris-HCl, MgCl2

データ収集

• 回折: 平均測定温度: 100 K
• 放射光源: 由来: シンクロトロン / サイト: PAL/PLS / ビームライン: 7A (6B, 6C1) / 波長: 1 Å
• 検出器: タイプ: ADSC QUANTUM 210 / 検出器: CCD / 日付: 2013年12月24日
• 放射: プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
• 放射波長: 波長: 1 Å / 相対比: 1
• 反射: 解像度: 2.84→30 Å / Num. obs: 58449 / % possible obs: 93.6 % / 冗長度: 2.9 % / Net I/σ(I): 19.27

位相決定

• 位相決定: 手法: 分子置換

解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
HKL-2000		データ収集
HKL-2000		データスケーリング
MOLREP		位相決定
REFMAC	5.7.0032	精密化
PDB_EXTRACT	3.2	データ抽出
HKL-2000		データ削減

精密化

構造決定の手法: 分子置換
開始モデル: 2GX2

2gx2

解像度: 2.84→29.94 Å / Cor.coef. F_o:F_c: 0.914 / Cor.coef. F_o:F_c free: 0.889 / SU B: 16.5 / SU ML: 0.321 / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 0 / ESU R Free: 0.44
詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS U VALUES : REFINED INDIVIDUALLY

	Rfactor	反射数	%反射	Selection details
Rfree	0.2451	2936	5 %	RANDOM
Rwork	0.2141	-	-	-
obs	0.2157	55512	93.19 %	-

• 溶媒の処理: イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å

原子変位パラメータ

B_iso max: 165.06 Ų / B_iso mean: 56.616 Ų / B_iso min: 10.41 Ų

	Baniso -1	Baniso -2	Baniso -3
1-	-0.14 Å2	-0.1 Å2	-2.02 Å2
2-	-	-1.11 Å2	0.7 Å2
3-	-	-	0.88 Å2

精密化ステップ

サイクル: final / 解像度: 2.84→29.94 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	20315	0	24	61	20400
Biso mean	-	-	90.78	34.73	-
残基数	-	-	-	-	2517

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	Dev ideal target	数
X-RAY DIFFRACTION	r_bond_refined_d	0.012	0.019	20871
X-RAY DIFFRACTION	r_bond_other_d	0.008	0.02	19231
X-RAY DIFFRACTION	r_angle_refined_deg	1.713	1.96	28120
X-RAY DIFFRACTION	r_angle_other_deg	1.607	3	44459
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_1_deg	6.377	5	2475
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_2_deg	31.123	24.49	1029
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_3_deg	16.907	15	3506
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_4_deg	12.063	15	84
X-RAY DIFFRACTION	r_chiral_restr	0.084	0.2	2851
X-RAY DIFFRACTION	r_gen_planes_refined	0.007	0.021	23541
X-RAY DIFFRACTION	r_gen_planes_other	0.006	0.02	4901
X-RAY DIFFRACTION	r_mcbond_it	4.015	5.354	10026
X-RAY DIFFRACTION	r_mcbond_other	4.014	5.354	10025
X-RAY DIFFRACTION	r_mcangle_it	6.377	8.028	12435

Refine LS restraints NCS

Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION / タイプ: interatomic distance / Weight position: 0.05

Ens-ID	Dom-ID	Auth asym-ID	数	Rms dev position (Å)
1	1	A	3090	0.13
1	2	B	3090	0.13
2	1	A	2990	0.09
2	2	C	2990	0.09
3	1	A	2986	0.09
3	2	D	2986	0.09
4	1	A	2967	0.1
4	2	E	2967	0.1
5	1	A	3059	0.11
5	2	F	3059	0.11
6	1	A	2944	0.11
6	2	G	2944	0.11
7	1	A	2983	0.11
7	2	H	2983	0.11
8	1	A	3111	0.11
8	2	I	3111	0.11
9	1	A	2965	0.11
9	2	J	2965	0.11
10	1	A	3071	0.12
10	2	K	3071	0.12
11	1	A	3083	0.12
11	2	L	3083	0.12
12	1	A	6531	0.1
12	2	B	6531	0.1
13	1	A	6538	0.1
13	2	C	6538	0.1
14	1	A	6584	0.09
14	2	D	6584	0.09
15	1	A	6599	0.09
15	2	E	6599	0.09
16	1	A	6589	0.09
16	2	F	6589	0.09
17	1	A	6571	0.1
17	2	G	6571	0.1
18	1	A	6530	0.1
18	2	H	6530	0.1
19	1	A	6525	0.09
19	2	I	6525	0.09
20	1	A	6598	0.09
20	2	J	6598	0.09
21	1	A	6509	0.11
21	2	K	6509	0.11
22	1	A	6562	0.09
22	2	L	6562	0.09
23	1	B	2949	0.13
23	2	C	2949	0.13
24	1	B	2958	0.13
24	2	D	2958	0.13
25	1	B	2972	0.12
25	2	E	2972	0.12
26	1	B	3088	0.13
26	2	F	3088	0.13
27	1	B	2955	0.13
27	2	G	2955	0.13
28	1	B	2934	0.11
28	2	H	2934	0.11
29	1	B	3080	0.13
29	2	I	3080	0.13
30	1	B	2916	0.12
30	2	J	2916	0.12
31	1	B	3090	0.13
31	2	K	3090	0.13
32	1	B	3036	0.13
32	2	L	3036	0.13
33	1	B	8075	0.08
33	2	C	8075	0.08
34	1	B	8145	0.08
34	2	D	8145	0.08
35	1	B	8278	0.07
35	2	E	8278	0.07
36	1	B	8202	0.08
36	2	F	8202	0.08
37	1	B	8204	0.07
37	2	G	8204	0.07
38	1	B	8164	0.08
38	2	H	8164	0.08
39	1	B	8137	0.09
39	2	I	8137	0.09
40	1	B	8174	0.08
40	2	J	8174	0.08
41	1	B	6173	0.11
41	2	K	6173	0.11
42	1	B	8098	0.09
42	2	L	8098	0.09
43	1	C	3232	0.09
43	2	D	3232	0.09
44	1	C	3207	0.1
44	2	E	3207	0.1
45	1	C	3030	0.1
45	2	F	3030	0.1
46	1	C	3182	0.12
46	2	G	3182	0.12
47	1	C	3182	0.1
47	2	H	3182	0.1
48	1	C	3040	0.1
48	2	I	3040	0.1
49	1	C	3161	0.1
49	2	J	3161	0.1
50	1	C	3016	0.11
50	2	K	3016	0.11
51	1	C	2998	0.11
51	2	L	2998	0.11
52	1	C	8327	0.08
52	2	D	8327	0.08
53	1	C	8433	0.08
53	2	E	8433	0.08
54	1	C	8347	0.09
54	2	F	8347	0.09
55	1	C	8478	0.08
55	2	G	8478	0.08
56	1	C	8440	0.08
56	2	H	8440	0.08
57	1	C	8276	0.09
57	2	I	8276	0.09
58	1	C	8116	0.08
58	2	J	8116	0.08
59	1	C	6272	0.1
59	2	K	6272	0.1
60	1	C	8225	0.1
60	2	L	8225	0.1
61	1	D	3235	0.1
61	2	E	3235	0.1
62	1	D	3027	0.1
62	2	F	3027	0.1
63	1	D	3215	0.1
63	2	G	3215	0.1
64	1	D	3196	0.11
64	2	H	3196	0.11
65	1	D	3046	0.1
65	2	I	3046	0.1
66	1	D	3151	0.1
66	2	J	3151	0.1
67	1	D	3028	0.11
67	2	K	3028	0.11
68	1	D	3009	0.11
68	2	L	3009	0.11
69	1	D	8652	0.07
69	2	E	8652	0.07
70	1	D	8404	0.1
70	2	F	8404	0.1
71	1	D	8449	0.08
71	2	G	8449	0.08
72	1	D	8587	0.08
72	2	H	8587	0.08
73	1	D	8456	0.07
73	2	I	8456	0.07
74	1	D	8042	0.09
74	2	J	8042	0.09
75	1	D	6212	0.11
75	2	K	6212	0.11
76	1	D	8389	0.09
76	2	L	8389	0.09
77	1	E	3042	0.09
77	2	F	3042	0.09
78	1	E	3181	0.12
78	2	G	3181	0.12
79	1	E	3187	0.1
79	2	H	3187	0.1
80	1	E	3034	0.1
80	2	I	3034	0.1
81	1	E	3147	0.11
81	2	J	3147	0.11
82	1	E	3036	0.11
82	2	K	3036	0.11
83	1	E	2972	0.11
83	2	L	2972	0.11
84	1	E	8556	0.08
84	2	F	8556	0.08
85	1	E	8580	0.07
85	2	G	8580	0.07
86	1	E	8646	0.07
86	2	H	8646	0.07
87	1	E	8475	0.08
87	2	I	8475	0.08
88	1	E	8166	0.08
88	2	J	8166	0.08
89	1	E	6288	0.09
89	2	K	6288	0.09
90	1	E	8465	0.09
90	2	L	8465	0.09
91	1	F	3042	0.09
91	2	G	3042	0.09
92	1	F	3002	0.1
92	2	H	3002	0.1
93	1	F	3141	0.11
93	2	I	3141	0.11
94	1	F	3000	0.1
94	2	J	3000	0.1
95	1	F	3147	0.12
95	2	K	3147	0.12
96	1	F	3099	0.12
96	2	L	3099	0.12
97	1	F	8447	0.09
97	2	G	8447	0.09
98	1	F	8457	0.09
98	2	H	8457	0.09
99	1	F	8283	0.09
99	2	I	8283	0.09
100	1	F	8169	0.08
100	2	J	8169	0.08
101	1	F	6271	0.1
101	2	K	6271	0.1
102	1	F	8393	0.1
102	2	L	8393	0.1
103	1	G	3183	0.11
103	2	H	3183	0.11
104	1	G	3026	0.1
104	2	I	3026	0.1
105	1	G	3193	0.1
105	2	J	3193	0.1
106	1	G	3038	0.11
106	2	K	3038	0.11
107	1	G	3005	0.11
107	2	L	3005	0.11
108	1	G	8531	0.07
108	2	H	8531	0.07
109	1	G	8418	0.08
109	2	I	8418	0.08
110	1	G	8184	0.08
110	2	J	8184	0.08
111	1	G	6264	0.1
111	2	K	6264	0.1
112	1	G	8332	0.09
112	2	L	8332	0.09
113	1	H	3014	0.09
113	2	I	3014	0.09
114	1	H	3196	0.11
114	2	J	3196	0.11
115	1	H	3004	0.1
115	2	K	3004	0.1
116	1	H	3030	0.1
116	2	L	3030	0.1
117	1	H	8398	0.08
117	2	I	8398	0.08
118	1	H	8180	0.08
118	2	J	8180	0.08
119	1	H	6319	0.1
119	2	K	6319	0.1
120	1	H	8375	0.1
120	2	L	8375	0.1
121	1	I	3014	0.09
121	2	J	3014	0.09
122	1	I	3193	0.1
122	2	K	3193	0.1
123	1	I	3165	0.09
123	2	L	3165	0.09
124	1	I	8098	0.08
124	2	J	8098	0.08
125	1	I	6165	0.11
125	2	K	6165	0.11
126	1	I	8392	0.08
126	2	L	8392	0.08
127	1	J	3004	0.11
127	2	K	3004	0.11
128	1	J	3031	0.09
128	2	L	3031	0.09
129	1	J	6312	0.09
129	2	K	6312	0.09
130	1	J	8136	0.08
130	2	L	8136	0.08
131	1	K	3113	0.11
131	2	L	3113	0.11
132	1	K	6267	0.1
132	2	L	6267	0.1

LS精密化 シェル

解像度: 2.844→2.917 Å / Total num. of bins used: 20

	Rfactor	反射数	%反射
Rfree	0.365	186	-
Rwork	0.309	3500	-
all	-	3686	-
obs	-	-	79.22 %