登録情報 データベース : PDB / ID : 5fvf 構造の表示 ダウンロードとリンクタイトル Room temperature structure of IrisFP determined by serial femtosecond crystallography. 要素Green to red photoconvertible GFP-like protein EosFP 詳細 キーワード FLUORESCENT PROTEIN機能・相同性 機能・相同性情報分子機能 ドメイン・相同性 構成要素
bioluminescence / generation of precursor metabolites and energy 類似検索 - 分子機能 Green Fluorescent Protein / Green fluorescent protein / Green fluorescent protein, GFP / Green fluorescent protein-related / Green fluorescent protein / Green fluorescent protein / Beta Barrel / Mainly Beta 類似検索 - ドメイン・相同性 AMMONIUM ION / Green to red photoconvertible GFP-like protein EosFP 類似検索 - 構成要素生物種 Lobophyllia hemprichii (オオハナガタサンゴ)手法 X線回折 / 自由電子レーザー / 分子置換 / 解像度 : 2.75 Å 詳細データ登録者 Colletier, J.P. / Gallat, F.X. / Coquelle, N. / Weik, M. 引用ジャーナル : J.Phys.Chem.Lett. / 年 : 2016タイトル : Serial Femtosecond Crystallography and Ultrafast Absorption Spectroscopy of the Photoswitchable Fluorescent Protein Irisfp.著者: Colletier, J. / Sliwa, M. / Gallat, F. / Sugahara, M. / Guillon, V. / Schiro, G. / Coquelle, N. / Woodhouse, J. / Roux, L. / Gotthard, G. / Royant, A. / Uriarte, L.M. / Ruckebusch, C. / Joti, ... 著者 : Colletier, J. / Sliwa, M. / Gallat, F. / Sugahara, M. / Guillon, V. / Schiro, G. / Coquelle, N. / Woodhouse, J. / Roux, L. / Gotthard, G. / Royant, A. / Uriarte, L.M. / Ruckebusch, C. / Joti, Y. / Byrdin, M. / Mizohata, E. / Nango, E. / Tanaka, T. / Tono, K. / Yabashi, M. / Adam, V. / Cammarata, M. / Schlichting, I. / Bourgeois, D. / Weik, M. 履歴 登録 2016年2月6日 登録サイト : PDBE / 処理サイト : PDBE改定 1.0 2016年4月6日 Provider : repository / タイプ : Initial release改定 1.1 2017年7月26日 Group : Data collection / カテゴリ : diffrn_source / Item : _diffrn_source.source改定 1.2 2018年11月14日 Group : Data collection / カテゴリ : diffrn / diffrn_sourceItem : _diffrn.pdbx_serial_crystal_experiment / _diffrn_source.pdbx_wavelength_list改定 1.3 2019年1月30日 Group : Data collection / Experimental preparation / カテゴリ : exptl_crystal_grow / Item : _exptl_crystal_grow.method改定 1.4 2019年2月6日 Group : Data collection / Experimental preparation / カテゴリ : exptl_crystal_grow / Item : _exptl_crystal_grow.temp改定 1.5 2019年10月23日 Group : Data collection / Database references ... Data collection / Database references / Derived calculations / Other カテゴリ : pdbx_database_status / struct_conn / struct_ref_seq_difItem : _pdbx_database_status.status_code_sf / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_ref_seq_dif.details改定 2.0 2021年9月1日 Group : Advisory / Atomic model ... Advisory / Atomic model / Data collection / Database references / Derived calculations / Non-polymer description / Polymer sequence / Source and taxonomy / Structure summary カテゴリ : atom_site / atom_site_anisotrop ... atom_site / atom_site_anisotrop / chem_comp / database_2 / entity / entity_name_com / entity_poly / entity_poly_seq / entity_src_gen / pdbx_poly_seq_scheme / pdbx_struct_assembly_prop / pdbx_struct_mod_residue / pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms / pdbx_validate_close_contact / pdbx_validate_rmsd_angle / struct_conn / struct_ref / struct_ref_seq_dif / struct_sheet / struct_site Item : _atom_site.B_iso_or_equiv / _atom_site.Cartn_x ... _atom_site.B_iso_or_equiv / _atom_site.Cartn_x / _atom_site.Cartn_y / _atom_site.Cartn_z / _atom_site.auth_atom_id / _atom_site.auth_comp_id / _atom_site.label_atom_id / _atom_site.label_comp_id / _atom_site.type_symbol / _atom_site_anisotrop.U[1][1] / _atom_site_anisotrop.U[1][2] / _atom_site_anisotrop.U[1][3] / _atom_site_anisotrop.U[2][2] / _atom_site_anisotrop.U[2][3] / _atom_site_anisotrop.U[3][3] / _atom_site_anisotrop.pdbx_auth_atom_id / _atom_site_anisotrop.pdbx_auth_comp_id / _atom_site_anisotrop.pdbx_label_atom_id / _atom_site_anisotrop.pdbx_label_comp_id / _atom_site_anisotrop.type_symbol / _chem_comp.formula / _chem_comp.formula_weight / _chem_comp.id / _chem_comp.mon_nstd_flag / _chem_comp.name / _chem_comp.pdbx_synonyms / _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _entity.formula_weight / _entity.pdbx_description / _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code / _entity_poly_seq.mon_id / _entity_src_gen.gene_src_common_name / _entity_src_gen.pdbx_beg_seq_num / _entity_src_gen.pdbx_end_seq_num / _entity_src_gen.pdbx_gene_src_scientific_name / _entity_src_gen.pdbx_seq_type / _pdbx_poly_seq_scheme.mon_id / _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_mon_id / _pdbx_struct_assembly_prop.value / _pdbx_struct_mod_residue.auth_comp_id / _pdbx_struct_mod_residue.details / _pdbx_struct_mod_residue.label_comp_id / _struct_ref.pdbx_align_begin / _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code / _struct_ref_seq_dif.align_id / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_ref_seq_dif.mon_id / _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_strand_id / _struct_sheet.number_strands / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id 改定 3.0 2023年11月15日 Group : Atomic model / Data collection / Derived calculationsカテゴリ : atom_site / atom_site_anisotrop ... atom_site / atom_site_anisotrop / chem_comp_atom / chem_comp_bond / pdbx_validate_rmsd_angle / struct_conn Item : _atom_site.auth_atom_id / _atom_site.label_atom_id ... _atom_site.auth_atom_id / _atom_site.label_atom_id / _atom_site_anisotrop.pdbx_auth_atom_id / _atom_site_anisotrop.pdbx_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id 改定 3.1 2024年1月10日 Group : Refinement description / カテゴリ : pdbx_initial_refinement_model改定 3.2 2024年11月20日 Group : Structure summaryカテゴリ : pdbx_entry_details / pdbx_modification_feature
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