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Yorodumi- PDB-5fmo: Crystal structure and proteomics analysis of empty virus like par... -
+Open data
-Basic information
Entry | Database: PDB / ID: 5fmo | ||||||
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Title | Crystal structure and proteomics analysis of empty virus like particles of Cowpea mosaic virus | ||||||
Components | (EMPTY VIRUS LIKE PARTICLES OF COWPEA MOSAIC VIRUS) x 2 | ||||||
Keywords | VIRUS / CPMV / EVLPS | ||||||
Function / homology | Function and homology information transport of virus in host, cell to cell / host cell plasmodesma / T=3 icosahedral viral capsid / host cell nucleus / GTP binding / structural molecule activity / DNA binding / RNA binding Similarity search - Function | ||||||
Biological species | COWPEA MOSAIC VIRUS | ||||||
Method | X-RAY DIFFRACTION / SYNCHROTRON / MOLECULAR REPLACEMENT / Resolution: 2.3 Å | ||||||
Authors | Huynh, N. / Hesketh, E.L. / Saxena, P. / Meshcheriakova, Y. / Ku, Y.C. / Hoang, L. / Johnson, J.E. / Ranson, N.A. / Lomonossoff, G.P. / Reddy, V.S. | ||||||
Citation | Journal: Structure / Year: 2016 Title: Crystal Structure and Proteomics Analysis of Empty Virus-Like Particles of Cowpea Mosaic Virus. Authors: Huynh, N.T. / Hesketh, E.L. / Saxena, P. / Meshcheriakova, Y. / Ku, Y. / Hoang, L.T. / Johnson, J.E. / Ranson, N.A. / Lomonossoff, G.P. / Reddy, V.S. | ||||||
History |
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-Structure visualization
Structure viewer | Molecule: MolmilJmol/JSmol |
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-Downloads & links
-Download
PDBx/mmCIF format | 5fmo.cif.gz | 122.6 KB | Display | PDBx/mmCIF format |
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PDB format | pdb5fmo.ent.gz | 97.1 KB | Display | PDB format |
PDBx/mmJSON format | 5fmo.json.gz | Tree view | PDBx/mmJSON format | |
Others | Other downloads |
-Validation report
Arichive directory | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/fm/5fmo ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/fm/5fmo | HTTPS FTP |
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-Related structure data
Related structure data | 1ny7S S: Starting model for refinement |
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Similar structure data |
-Links
-Assembly
Deposited unit |
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1 |
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3 |
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5 |
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6 | x 60
| x 60|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Unit cell |
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Symmetry | Point symmetry: (Schoenflies symbol: I (icosahedral)) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Noncrystallographic symmetry (NCS) | NCS oper:
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