登録情報 データベース : PDB / ID : 5fkb 構造の表示 ダウンロードとリンクタイトル Structure of D80A-fructofuranosidase from Xanthophyllomyces dendrorhous complexed with 1-Kestose 要素BETA-FRUCTOFURANOSIDASE 詳細 キーワード HYDROLASE / AMINO ACID SEQUENCE / CARBOHYDRATES / CATALYSIS / CATALYTIC DOMAIN / CLONING / DIMERIZATION / QUATERNARY / PICHIA PASTORIS / GLYCOSIDE HYDROLASES / FUNGAL PROTEINS / KINETICS / MOLECULAR / MOLECULAR CONFORMATION / PROTEIN CONFORMATION / PROTEIN STRUCTURE / SECONDARY / SUBSTRATE SPECIFICITY / BETA-FRUCTOFURANOSIDASE / INVERTASE / PREBIOTICS / 1-KESTOSE機能・相同性 機能・相同性情報分子機能 ドメイン・相同性 構成要素
sucrose alpha-glucosidase activity / sucrose catabolic process / cytoplasm 類似検索 - 分子機能 Glycosyl hydrolase family 32, C-terminal / Glycosyl hydrolases family 32 C terminal / Exo-inulinase; domain 1 / Glycoside hydrolase, family 32 / Glycosyl hydrolase family 32, N-terminal / Glycosyl hydrolases family 32 N-terminal domain / Glycosyl hydrolases family 32 / Glycosyl hydrolase domain; family 43 / 5 Propeller / Tachylectin-2; Chain A ... Glycosyl hydrolase family 32, C-terminal / Glycosyl hydrolases family 32 C terminal / Exo-inulinase; domain 1 / Glycoside hydrolase, family 32 / Glycosyl hydrolase family 32, N-terminal / Glycosyl hydrolases family 32 N-terminal domain / Glycosyl hydrolases family 32 / Glycosyl hydrolase domain; family 43 / 5 Propeller / Tachylectin-2; Chain A / Glycosyl hydrolase, five-bladed beta-propellor domain superfamily / Concanavalin A-like lectin/glucanase domain superfamily / Jelly Rolls / Sandwich / Mainly Beta 類似検索 - ドメイン・相同性生物種 XANTHOPHYLLOMYCES DENDRORHOUS (菌類)手法 X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度 : 1.78 Å 詳細データ登録者 Ramirez-Escudero, M. / Sanz-Aparicio, J. 引用ジャーナル : J.Biol.Chem. / 年 : 2016タイトル : Structural Analysis of Beta-Fructofuranosidase from Xanthophyllomyces Dendrorhous Reveals Unique Features and the Crucial Role of N-Glycosylation in Oligomerization and Activity著者 : Ramirez-Escudero, M. / Gimeno-Perez, M. / Gonzalez, B. / Linde, D. / Merdzo, Z. / Fernandez-Lobato, M. / Sanz-Aparicio, J. 履歴 登録 2015年10月15日 登録サイト : PDBE / 処理サイト : PDBE改定 1.0 2016年2月10日 Provider : repository / タイプ : Initial release改定 1.1 2016年4月6日 Group : Database references改定 1.2 2018年1月31日 Group : Data collection / カテゴリ : diffrn_sourceItem : _diffrn_source.pdbx_synchrotron_beamline / _diffrn_source.pdbx_wavelength_list / _diffrn_source.type改定 1.3 2018年2月28日 Group : Data collection / カテゴリ : diffrn_source / Item : _diffrn_source.pdbx_synchrotron_site改定 2.0 2020年7月29日 Group : Advisory / Atomic model ... Advisory / Atomic model / Data collection / Derived calculations / Other / Structure summary カテゴリ : atom_site / chem_comp ... atom_site / chem_comp / database_PDB_caveat / entity / entity_name_com / pdbx_branch_scheme / pdbx_chem_comp_identifier / pdbx_database_status / pdbx_entity_branch / pdbx_entity_branch_descriptor / pdbx_entity_branch_link / pdbx_entity_branch_list / pdbx_entity_nonpoly / pdbx_molecule_features / pdbx_nonpoly_scheme / pdbx_struct_assembly_gen / pdbx_validate_chiral / pdbx_validate_symm_contact / struct_asym / struct_conn / struct_site / struct_site_gen Item : _atom_site.B_iso_or_equiv / _atom_site.Cartn_x ... _atom_site.B_iso_or_equiv / _atom_site.Cartn_x / _atom_site.Cartn_y / _atom_site.Cartn_z / _atom_site.auth_asym_id / _atom_site.auth_atom_id / _atom_site.auth_comp_id / _atom_site.auth_seq_id / _atom_site.label_asym_id / _atom_site.label_atom_id / _atom_site.label_comp_id / _atom_site.label_entity_id / _atom_site.type_symbol / _chem_comp.name / _chem_comp.type / _pdbx_database_status.status_code_sf / _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list / _pdbx_validate_chiral.auth_asym_id / _pdbx_validate_chiral.auth_comp_id / _pdbx_validate_chiral.auth_seq_id / _pdbx_validate_chiral.details / _pdbx_validate_symm_contact.auth_asym_id_1 / _pdbx_validate_symm_contact.auth_asym_id_2 / _pdbx_validate_symm_contact.auth_seq_id_1 / _pdbx_validate_symm_contact.auth_seq_id_2 / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_conn.pdbx_role / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id 解説 : Carbohydrate remediation / Provider : repository / タイプ : Remediation改定 2.1 2024年1月10日 Group : Data collection / Database references ... Data collection / Database references / Refinement description / Structure summary カテゴリ : chem_comp / chem_comp_atom ... chem_comp / chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / struct_ncs_dom_lim Item : _chem_comp.pdbx_synonyms / _database_2.pdbx_DOI ... _chem_comp.pdbx_synonyms / _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_seq_id / _struct_ncs_dom_lim.end_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_seq_id
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