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- PDB-5fgc: Three dimensional structure of broadly neutralizing human anti - ... -

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基本情報

登録情報
データベース: PDB / ID: 5fgc
タイトルThree dimensional structure of broadly neutralizing human anti - Hepatitis C virus (HCV) glycoprotein E2 Fab fragment HC33.8
要素
  • Anti-HCV E2 Fab HC33.8 heavy chain
  • Anti-HCV E2 Fab HC33.8 light chain
  • Genome polyprotein
キーワードVIRAL PROTEIN / Fab fragment / neutralizing antibody / Hepatitis C virus E2
機能・相同性
機能・相同性情報


酸化還元酵素; 分子状酸素を取り込み一電子供与する; オキシゲナーゼ類; 2分子の酸素を取り込む / oxylipin biosynthetic process / lipid oxidation / oxidoreductase activity, acting on single donors with incorporation of molecular oxygen, incorporation of two atoms of oxygen / fatty acid biosynthetic process / metal ion binding / cytoplasm
類似検索 - 分子機能
Lipoxygenase, plant / Lipoxygenase, domain 3 / Plant lipoxygenase, PLAT/LH2 domain / Lipoxygenase, conserved site / Lipoxygenases iron-binding region signature 2. / Lipoxygenase, iron binding site / Lipoxygenases iron-binding region signature 1. / Lipoxygenase / Lipoxygenase, C-terminal / Lipoxigenase, C-terminal domain superfamily ...Lipoxygenase, plant / Lipoxygenase, domain 3 / Plant lipoxygenase, PLAT/LH2 domain / Lipoxygenase, conserved site / Lipoxygenases iron-binding region signature 2. / Lipoxygenase, iron binding site / Lipoxygenases iron-binding region signature 1. / Lipoxygenase / Lipoxygenase, C-terminal / Lipoxigenase, C-terminal domain superfamily / Lipoxygenase / Lipoxygenase iron-binding catalytic domain profile. / Lipoxygenase homology 2 (beta barrel) domain / PLAT/LH2 domain / PLAT/LH2 domain superfamily / PLAT/LH2 domain / PLAT domain profile. / Immunoglobulins / Immunoglobulin-like / Sandwich / Mainly Beta
類似検索 - ドメイン・相同性
生物種Homo sapiens (ヒト)
Hepatitis C virus genotype 1a (C型肝炎ウイルス)
手法X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 1.9 Å
データ登録者Girard-Blanc, C. / Rey, F.A. / Krey, T.
資金援助 フランス, 1件
組織認可番号
ANRS フランス
引用ジャーナル: J.Virol. / : 2016
タイトル: Antibody Response to Hypervariable Region 1 Interferes with Broadly Neutralizing Antibodies to Hepatitis C Virus.
著者: Keck, Z.Y. / Girard-Blanc, C. / Wang, W. / Lau, P. / Zuiani, A. / Rey, F.A. / Krey, T. / Diamond, M.S. / Foung, S.K.
履歴
登録2015年12月20日登録サイト: RCSB / 処理サイト: PDBE
改定 1.02016年1月20日Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.12016年3月9日Group: Database references

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構造の表示

構造ビューア分子:
MolmilJmol/JSmol

ダウンロードとリンク

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集合体

登録構造単位
A: Genome polyprotein
B: Anti-HCV E2 Fab HC33.8 light chain
E: Anti-HCV E2 Fab HC33.8 heavy chain


分子量 (理論値)分子数
合計 (水以外)54,4453
ポリマ-54,4453
非ポリマー00
2,090116
1


  • 登録構造と同一
  • ソフトウェアが定義した集合体
タイプ名称対称操作
identity operation1_555x,y,z1
Buried area5250 Å2
ΔGint-35 kcal/mol
Surface area20130 Å2
手法PISA
単位格子
Length a, b, c (Å)66.050, 49.570, 66.390
Angle α, β, γ (deg.)90.00, 98.50, 90.00
Int Tables number3
Space group name H-MP121

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要素

#1: タンパク質・ペプチド Genome polyprotein


分子量: 2295.511 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成
由来: (合成) Hepatitis C virus genotype 1a (isolate H) (C型肝炎ウイルス)
参照: UniProt: P27958, 加水分解酵素; プロテアーゼ; ペプチド結合加水分解酵素; システインプロテアーゼ, hepacivirin, nucleoside-triphosphate phosphatase, RNA ...参照: UniProt: P27958, 加水分解酵素; プロテアーゼ; ペプチド結合加水分解酵素; システインプロテアーゼ, hepacivirin, nucleoside-triphosphate phosphatase, RNA helicase, RNA-directed RNA polymerase
#2: 抗体 Anti-HCV E2 Fab HC33.8 light chain


分子量: 23507.953 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / プラスミド: pMT/BiP modified / 細胞株 (発現宿主): Schneider 2 / 発現宿主: Drosophila (ハエ)
#3: 抗体 Anti-HCV E2 Fab HC33.8 heavy chain


分子量: 28641.520 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / プラスミド: pMT/BiP modified / 細胞株 (発現宿主): Schneider 2 / 発現宿主: Drosophila (ハエ)
#4: 水 ChemComp-HOH / water


分子量: 18.015 Da / 分子数: 116 / 由来タイプ: 天然 / : H2O

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実験情報

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実験

実験手法: X線回折

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試料調製

結晶マシュー密度: 1.97 Å3/Da / 溶媒含有率: 37.7 %
結晶化温度: 293 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 8.5
詳細: 32% PEG 4000 100 mM Tris-HCl pH 8.5 800 mM lithium chloride Crystals obtained using heterologous microseeding.

-
データ収集

回折平均測定温度: 110 K
放射光源由来: シンクロトロン / サイト: SLS / ビームライン: X06SA / 波長: 1.00002 Å
検出器タイプ: DECTRIS PILATUS 6M / 検出器: PIXEL / 日付: 2014年6月6日
放射プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長波長: 1.00002 Å / 相対比: 1
反射解像度: 1.9→50 Å / Num. obs: 33283 / % possible obs: 99.7 % / 冗長度: 6.7 % / Biso Wilson estimate: 39.81 Å2 / Net I/σ(I): 16.39
反射 シェル解像度: 1.9→2.02 Å / 冗長度: 6.7 % / Mean I/σ(I) obs: 1.21 / Num. unique all: 33780 / % possible all: 97.8

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解析

ソフトウェア
名称バージョン分類
BUSTER2.11.2精密化
XDSデータ削減
XDSデータスケーリング
PHASER位相決定
精密化構造決定の手法: 分子置換
開始モデル: PDB

解像度: 1.9→49.57 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.9441 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.9283 / SU R Cruickshank DPI: 0.156 / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 0 / SU R Blow DPI: 0.153 / SU Rfree Blow DPI: 0.142 / SU Rfree Cruickshank DPI: 0.145
Rfactor反射数%反射Selection details
Rfree0.2363 1687 5 %RANDOM
Rwork0.194 ---
obs0.1962 33727 99.88 %-
原子変位パラメータBiso mean: 61.65 Å2
Baniso -1Baniso -2Baniso -3
1--10.1055 Å20 Å2-2.6428 Å2
2---5.2892 Å20 Å2
3---15.3946 Å2
Refine analyzeLuzzati coordinate error obs: 0.407 Å
精密化ステップサイクル: 1 / 解像度: 1.9→49.57 Å
タンパク質核酸リガンド溶媒全体
原子数3414 0 0 116 3530
拘束条件
Refine-IDタイプDev idealRestraint functionWeight
X-RAY DIFFRACTIONt_bond_d0.013500HARMONIC2
X-RAY DIFFRACTIONt_angle_deg1.164773HARMONIC2
X-RAY DIFFRACTIONt_dihedral_angle_d1145SINUSOIDAL2
X-RAY DIFFRACTIONt_incorr_chiral_ct
X-RAY DIFFRACTIONt_pseud_angle
X-RAY DIFFRACTIONt_trig_c_planes76HARMONIC2
X-RAY DIFFRACTIONt_gen_planes513HARMONIC5
X-RAY DIFFRACTIONt_it3500HARMONIC20
X-RAY DIFFRACTIONt_nbd
X-RAY DIFFRACTIONt_omega_torsion3.72
X-RAY DIFFRACTIONt_other_torsion16.24
X-RAY DIFFRACTIONt_improper_torsion
X-RAY DIFFRACTIONt_chiral_improper_torsion464SEMIHARMONIC5
X-RAY DIFFRACTIONt_sum_occupancies
X-RAY DIFFRACTIONt_utility_distance
X-RAY DIFFRACTIONt_utility_angle
X-RAY DIFFRACTIONt_utility_torsion
X-RAY DIFFRACTIONt_ideal_dist_contact3876SEMIHARMONIC4
LS精密化 シェル解像度: 1.9→2.01 Å / Total num. of bins used: 17
Rfactor反射数%反射
Rfree0.2652 144 4.99 %
Rwork0.2417 2741 -
all0.2429 5345 -
obs--98.2 %
精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

IDL112)L122)L132)L222)L232)L332)S11 (Å °)S12 (Å °)S13 (Å °)S21 (Å °)S22 (Å °)S23 (Å °)S31 (Å °)S32 (Å °)S33 (Å °)T112)T122)T132)T222)T232)T332)Origin x (Å)Origin y (Å)Origin z (Å)
110.3056.38985.90950-0.86683.95520.2346-0.1032-0.20710.33030.5076-0.9920.34040.3023-0.74220.3254-0.38280.1579-0.2046-0.2657-0.294521.07857.312753.8593
26.9011-2.2244-5.9443.19063.81877.28170.2387-0.30710.2990.02070.29160.1939-0.49180.5428-0.53030.6061-0.25230.2799-0.4164-0.1253-0.32378.711611.198367.2796
32.31832.8577-7.17842.18183.0103-1.3056-0.0908-0.3061.04220.19250.2577-0.527-0.76890.2701-0.16690.7328-0.45840.2573-0.2682-0.0196-0.17615.945115.005848.2354
41.0899-2.06142.05352.12998.55615.8379-0.1818-0.67090.27760.01880.2620.0262-1.10060.1742-0.08020.14740.07980.1552-0.5172-0.0196-0.50384.09011.791859.1757
51.0038-0.4-1.963510.1073-4.1011-0.603-0.1209-0.11830.3041-0.85570.4847-0.1205-1.2462-0.4214-0.36380.44210.09310.1168-0.613-0.0266-0.53592.30176.323952.6808
6-0.2684-5.07190.62926.19583.17123.59820.15810.5931-0.1823-0.2556-0.0220.3989-0.9547-0.3573-0.13610.56640.27350.1383-0.61310.0752-0.2537-2.379211.959451.8284
73.6205-3.5376-6.35428.2911-0.1825-0.16320.1859-0.0038-0.05440.1457-0.15560.2532-0.5404-0.9258-0.03040.5810.17320.3746-0.69010.0601-0.2891-5.471510.514459.71
84.2686-4.76192.90877.32360.35981.89970.31890.12870.07950.6583-0.01310.1973-0.9270.9068-0.30580.8423-0.15540.3568-0.7511-0.1548-0.52088.277615.884657.8304
92.7238-7.6141-5.445810.49497.084315.99180.3217-0.18480.2172-0.37560.21720.3427-0.2674-0.2772-0.53890.2435-0.00010.0543-0.7347-0.0134-0.5439-0.06336.662767.0567
101.51172.1990.92491.62650.75950.2427-0.1448-0.01190.29460.01860.2735-0.082-1.21450.8188-0.12860.1723-0.21930.1569-0.4269-0.0772-0.492314.94924.347351.0815
11-0.32615.59721.05752.2072-0.87630.44850.07230.32930.3485-0.19440.00030.6275-0.6375-0.0219-0.07260.3159-0.02640.1388-0.396-0.0837-0.33824.46365.554374.5962
122.2168-0.603-1.384300.77828.29040.54-0.5009-0.01510.5324-0.47920.4836-0.80350.1761-0.0609-0.335-0.17510.043-0.3227-0.0527-0.47081.4004-9.623887.7622
132.13940.8079-0.83441.53410.55225.02060.1129-0.2207-0.22340.5178-0.190.21540.22130.5390.077-0.3586-0.0602-0.0385-0.27260.0161-0.41444.8536-20.128583.4373
149.4978-5.29122.865813.0375-6.59895.0330.35310.11310.2651-0.5624-0.1981-0.4452-0.61690.8912-0.15490.0389-0.31440.05820.0157-0.0258-0.366611.5821-4.973684.2274
154.4428-4.43366.147103.973510.68-0.0551-0.62970.04020.42320.2796-0.05310.55590.8704-0.2245-0.1624-0.2006-0.09380.26160.0725-0.276714.2868-18.172294.3319
16-1.81791.1845.243301.824611.22520.3708-0.19650.06030.1421-0.3713-0.0626-0.3781.0420.0005-0.2091-0.1649-0.01420.25810.0315-0.275615.576-16.969283.561
172.7781-3.27270.667412.6393-2.75254.20050.3322-0.1897-0.0106-0.2188-0.22880.0595-0.4470.4418-0.1034-0.1235-0.1018-0.0053-0.141-0.018-0.31175.4013-11.392979.6131
183.02671.8124-3.12655.2075-6.64180.86140.2903-0.1505-0.43721.1502-0.5537-0.21430.59171.19520.26350.237-0.0251-0.19510.20790.2035-0.215112.2645-30.56793.2555
192.927-2.069-0.2191.1076-1.58146.44250.2746-0.62330.11710.822-0.02650.0486-0.71230.6016-0.2481-0.0001-0.3396-0.02570.0048-0.0198-0.38577.5421-9.801393.6905
207.067-0.2894-4.66232.7833-4.9673-1.46670.0302-0.7882-0.70760.245-0.06181.1072-0.28190.51260.03160.0178-0.2283-0.1088-0.09370.1748-0.31984.7883-26.857495.155
213.16592.9427-5.739312.14036.42861.8689-0.1089-0.109-0.07430.959-0.56480.681-0.3157-0.48470.6737-0.1102-0.00790.0945-0.1047-0.0105-0.1257-2.2379-11.513248.5388
221.65396.1344-6.08170-5.57677.33730.33980.4741-1.0008-0.1251-0.1447-0.31440.21310.6366-0.1951-0.13330.09990.0021-0.132-0.0251-0.144516.8289-23.781752.1055
2313.1385-8.09124.1578.3493-2.18086.5219-0.4338-0.3924-0.3049-0.11370.60530.5834-0.3301-0.5963-0.1715-0.1344-0.0223-0.0126-0.0741-0.0055-0.13160.1649-10.803242.1055
240.011.7162-0.224301.00992.5563-0.22320.1338-0.1761-0.15170.3190.2256-1.0903-0.2142-0.09580.1093-0.0023-0.0044-0.08170.0239-0.18134.9061-5.284141.6086
252.03796.41725.41377.26554.77541.57270.0012-0.0762-0.22771.10050.1846-0.24120.20570.8411-0.18580.3399-0.01280.04230.0356-0.0553-0.25213.4926-6.325460.2682
262.3524-0.4054-2.69463.82930.72978.0956-0.1040.1181-0.0531-0.15390.3282-0.0995-1.03830.5279-0.22420.021-0.16940.0185-0.1466-0.0208-0.346613.7475-5.145940.6548
271.8415-6.1647-0.89765.1005-1.85787.34840.28060.8094-0.4507-0.2519-0.105-0.04970.00751.1788-0.1756-0.2893-0.06240.0514-0.1709-0.0358-0.39214.3955-12.132341.2782
282.2721.01221.216401.93034.69730.06210.9677-0.3285-0.0556-0.05920.39910.11490.5038-0.0029-0.0561-0.0446-0.0433-0.1242-0.0398-0.10354.0458-14.204938.8787
295.5925-5-1.8179.7180.94856.8701-0.256-0.027-0.01280.52720.1968-0.2304-0.28750.74830.0592-0.0665-0.00210.0534-0.0216-0.0153-0.207214.8059-13.853752.1995
301.8081-6.25934.10822.656-1.65692.18380.17171.0246-0.1749-0.4224-0.128-0.5845-0.9004-0.6701-0.04370.75010.12210.0343-0.12010.0616-0.31986.79597.431738.9337
314.1876-2.1007-2.27394.32990.7027-0.7726-0.3806-0.12331.1879-0.0020.309-0.9553-1.31190.79370.07160.7567-0.26910.2158-0.24260.07540.028511.60829.676942.1247
329.19480.93530.15299.49957.21776.0377-0.0884-0.38010.06710.1165-0.16140.6233-1.0355-0.53320.2498-0.02020.12940.0744-0.28220.0618-0.31961.3428-3.275150.5829
33-0.04193.6624-0.10592.038-3.42533.29440.18830.2119-0.20950.5585-0.151-0.09280.3390.4671-0.03730.10940.11170.0414-0.1774-0.0019-0.249511.7334-23.104460.435
343.878-3.071-2.3896.11321.11983.663-0.0518-0.552-0.2978-0.08170.02160.6490.4690.32720.0302-0.2061-0.0499-0.0848-0.1867-0.0169-0.25641.1444-22.668879.05
351.67423.4568-5.239202.36749.2843-0.28550.02070.958-1.07440.2540.1520.4758-0.08920.03150.20380.1014-0.059-0.29290.0134-0.25973.9688-19.689665.4866
3610.10038.34262.54140-1.61549.7584-0.25890.44540.3040.33670.17950.214-0.2069-1.12770.0795-0.28250.0258-0.1261-0.0793-0.0549-0.1169-10.2948-16.096273.4636
372.3546-0.29720.59434.123-1.54893.35120.5068-0.45350.1611-0.5397-0.20250.0807-0.19120.3381-0.3043-0.2513-0.0249-0.0717-0.2606-0.0425-0.35583.5994-17.261576.2141
382.7616-2.95893.82274.845-0.94591.08090.0522-0.0018-0.68180.0753-0.10351.07490.6981-1.19270.0513-0.2942-0.1377-0.1279-0.3291-0.0226-0.1699-9.394-22.348876.712
3910.1422-3.7266-6.84481.2094-9.45520.6047-0.1550.6281-0.723-1.0303-0.45390.48760.6101-0.36990.60890.05990.089-0.1279-0.4279-0.1307-0.39280.5576-27.036861.8833
40-1.366-1.08134.089115.5052-4.14716.43550.0724-0.2884-0.61860.18610.02380.44310.1388-0.0996-0.0962-0.5213-0.1074-0.0696-0.5773-0.0509-0.2976-7.124-27.103878.4953
412.1034-6.41014.41047.1334-4.672213.56670.15220.41971.0333-0.82630.2806-0.2287-1.0277-1.0914-0.43280.5095-0.08070.1382-0.22370.103-0.36249.2943.572135.3054
精密化 TLSグループ
IDRefine-IDRefine TLS-IDSelection details
1X-RAY DIFFRACTION1{B|1 - 5}
2X-RAY DIFFRACTION2{B|6 - 24}
3X-RAY DIFFRACTION3{B|25 - 31}
4X-RAY DIFFRACTION4{B|32 - 41}
5X-RAY DIFFRACTION5{B|42 - 50}
6X-RAY DIFFRACTION6{B|51 - 55}
7X-RAY DIFFRACTION7{B|56 - 61}
8X-RAY DIFFRACTION8{B|62 - 74}
9X-RAY DIFFRACTION9{B|75 - 85}
10X-RAY DIFFRACTION10{B|86 - 102}
11X-RAY DIFFRACTION11{B|103 - 108}
12X-RAY DIFFRACTION12{B|109 - 119}
13X-RAY DIFFRACTION13{B|120 - 141}
14X-RAY DIFFRACTION14{B|142 - 146}
15X-RAY DIFFRACTION15{B|147 - 154}
16X-RAY DIFFRACTION16{B|155 - 162}
17X-RAY DIFFRACTION17{B|163 - 184}
18X-RAY DIFFRACTION18{B|185 - 190}
19X-RAY DIFFRACTION19{B|191 - 208}
20X-RAY DIFFRACTION20{B|209 - 212}
21X-RAY DIFFRACTION21{E|1 - 9}
22X-RAY DIFFRACTION22{E|10 - 18}
23X-RAY DIFFRACTION23{E|19 - 29}
24X-RAY DIFFRACTION24{E|30 - 38}
25X-RAY DIFFRACTION25{E|39 - 45}
26X-RAY DIFFRACTION26{E|46 - 63}
27X-RAY DIFFRACTION27{E|64 - 73}
28X-RAY DIFFRACTION28{E|74 - 82}
29X-RAY DIFFRACTION29{E|83 - 97}
30X-RAY DIFFRACTION30{E|98 - 107}
31X-RAY DIFFRACTION31{E|108 - 113}
32X-RAY DIFFRACTION32{E|114 - 119}
33X-RAY DIFFRACTION33{E|120 - 133}
34X-RAY DIFFRACTION34{E|134 - 160}
35X-RAY DIFFRACTION35{E|161 - 166}
36X-RAY DIFFRACTION36{E|167 - 176}
37X-RAY DIFFRACTION37{E|177 - 201}
38X-RAY DIFFRACTION38{E|202 - 214}
39X-RAY DIFFRACTION39{E|215 - 220}
40X-RAY DIFFRACTION40{E|221 - 227}
41X-RAY DIFFRACTION41{A|415 - 423}

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万見について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月:コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか? / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例:em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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