登録情報 | データベース: PDB / ID: 5ev3 |
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タイトル | Structure III of Intact U2AF65 Recognizing the 3' Splice Site Signal |
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要素 | - DNA/RNA (5'-R(P*UP*U)-D(P*U)-R(P*UP*U)-D(P*(BRU)P*UP*U)-3')
- Splicing factor U2AF 65 kDa subunit
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キーワード | RNA BINDING PROTEIN/RNA / PROTEIN-RNA COMPLEX / RNA SPLICING FACTOR / RNA RECOGNITION MOTIF / POLYPYRIMIDINE TRACT / RNA BINDING PROTEIN-RNA complex |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
U2AF complex / poly-pyrimidine tract binding / pre-mRNA 3'-splice site binding / mRNA 3'-end processing / C2H2 zinc finger domain binding / commitment complex / Transport of Mature mRNA derived from an Intron-Containing Transcript / RNA Polymerase II Transcription Termination / U2-type prespliceosome / molecular function inhibitor activity ...U2AF complex / poly-pyrimidine tract binding / pre-mRNA 3'-splice site binding / mRNA 3'-end processing / C2H2 zinc finger domain binding / commitment complex / Transport of Mature mRNA derived from an Intron-Containing Transcript / RNA Polymerase II Transcription Termination / U2-type prespliceosome / molecular function inhibitor activity / spliceosomal complex assembly / Protein hydroxylation / negative regulation of mRNA splicing, via spliceosome / negative regulation of protein ubiquitination / mRNA Splicing - Major Pathway / positive regulation of RNA splicing / spliceosomal complex / mRNA processing / mRNA splicing, via spliceosome / nuclear speck / enzyme binding / RNA binding / nucleoplasm / nucleus類似検索 - 分子機能 U2 snRNP auxilliary factor, large subunit, splicing factor / RNA recognition motif / RNA recognition motif / Eukaryotic RNA Recognition Motif (RRM) profile. / RNA recognition motif domain / RNA-binding domain superfamily / Nucleotide-binding alpha-beta plait domain superfamily類似検索 - ドメイン・相同性 DNA/RNA hybrid / Splicing factor U2AF 65 kDa subunit類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | Homo sapiens (ヒト) synthetic construct (人工物) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / フーリエ合成 / 解像度: 1.5 Å |
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データ登録者 | Agrawal, A.A. / Jenkins, J.L. / Kielkopf, C.L. |
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資金援助 | 米国, 1件 組織 | 認可番号 | 国 |
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National Institutes of Health/National Institute of General Medical Sciences (NIH/NIGMS) | GM070503 | 米国 |
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引用 | ジャーナル: Nat Commun / 年: 2016 タイトル: An extended U2AF(65)-RNA-binding domain recognizes the 3' splice site signal. 著者: Agrawal, A.A. / Salsi, E. / Chatrikhi, R. / Henderson, S. / Jenkins, J.L. / Green, M.R. / Ermolenko, D.N. / Kielkopf, C.L. |
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履歴 | 登録 | 2015年11月19日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 2016年2月24日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2016年3月23日 | Group: Database references |
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改定 1.2 | 2017年9月27日 | Group: Author supporting evidence / Derived calculations / カテゴリ: pdbx_audit_support / pdbx_struct_oper_list Item: _pdbx_audit_support.funding_organization / _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation |
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改定 1.3 | 2019年12月25日 | Group: Author supporting evidence / カテゴリ: pdbx_audit_support / Item: _pdbx_audit_support.funding_organization |
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改定 1.4 | 2024年3月6日 | Group: Data collection / Database references カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / diffrn_radiation_wavelength Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession |
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