登録情報 | データベース: PDB / ID: 5eq2 |
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タイトル | Crystal Structure of the SrpA Adhesin from Streptococcus sanguinis |
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要素 | Platelet-binding glycoprotein |
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キーワード | SUGAR BINDING PROTEIN / bacterial adhesin / lectin / immunoglobulin fold / serine-rich repeat |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
SrpA-like, SigLec-like domain / GspA/SrpA SigLec-like domain / Ubiquitin-like (UB roll) - #890 / Atypical Rib domain / Atypical Rib domain / Serine-rich repeat adhesion glycoprotein / KxYKxGKxW signal peptide / KxYKxGKxW signal peptide / LPXTG cell wall anchor motif / Gram-positive cocci surface proteins LPxTG motif profile. ...SrpA-like, SigLec-like domain / GspA/SrpA SigLec-like domain / Ubiquitin-like (UB roll) - #890 / Atypical Rib domain / Atypical Rib domain / Serine-rich repeat adhesion glycoprotein / KxYKxGKxW signal peptide / KxYKxGKxW signal peptide / LPXTG cell wall anchor motif / Gram-positive cocci surface proteins LPxTG motif profile. / LPXTG cell wall anchor domain / Ubiquitin-like (UB roll) / Roll / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 |
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生物種 | Streptococcus sanguinis (バクテリア) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 単波長異常分散 / 解像度: 1.8 Å |
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データ登録者 | Loukachevitch, L.V. / McCulloch, K.M. / Vann, K.R. / Wawrzak, Z. / Anderson, S. / Iverson, T.M. |
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資金援助 | 米国, 9件 組織 | 認可番号 | 国 |
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National Institutes of Health/National Institute Of Allergy and Infectious Diseases (NIH/NIAID) | AI106987 | 米国 | National Institutes of Health/National Institute Of Allergy and Infectious Diseases (NIH/NIAID) | AI41513 | 米国 | American Heart Association | 14GRNT20390021 | 米国 | National Institutes of Health/National Institute of General Medical Sciences (NIH/NIGMS) | T32 GM008320 | 米国 | National Institutes of Health/National Heart, Lung, and Blood Institute (NIH/NHLBI) | T32 HL007751 | 米国 | National Institutes of Health/National Center for Research Resources (NIH/NCRR) | S10 RR026915 | 米国 | Department of Energy (DOE, United States) | DE-AC02-06CH11357 | 米国 | Michigan Economic Development Corporation | 085P1000817 | 米国 | Department of Veteran's Affairs | | 米国 |
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引用 | ジャーナル: J.Biol.Chem. / 年: 2016 タイトル: Structural Basis for Sialoglycan Binding by the Streptococcus sanguinis SrpA Adhesin. 著者: Bensing, B.A. / Loukachevitch, L.V. / McCulloch, K.M. / Yu, H. / Vann, K.R. / Wawrzak, Z. / Anderson, S. / Chen, X. / Sullam, P.M. / Iverson, T.M. |
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履歴 | 登録 | 2015年11月12日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 2016年1月27日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2016年2月17日 | Group: Database references |
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改定 1.2 | 2016年4月13日 | Group: Database references |
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改定 1.3 | 2017年9月20日 | Group: Author supporting evidence / Database references / Derived calculations カテゴリ: citation / pdbx_audit_support / pdbx_struct_oper_list Item: _citation.journal_id_CSD / _pdbx_audit_support.funding_organization / _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation |
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改定 1.4 | 2019年12月4日 | Group: Author supporting evidence / カテゴリ: pdbx_audit_support / Item: _pdbx_audit_support.funding_organization |
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改定 1.5 | 2024年3月6日 | Group: Data collection / Database references / Derived calculations カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_label_seq_id |
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