[English] 日本語
Yorodumi- PDB-5daj: Crystal structure of NalD, the secondary repressor of MexAB-OprM ... -
+Open data
-Basic information
Entry | Database: PDB / ID: 5daj | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
Title | Crystal structure of NalD, the secondary repressor of MexAB-OprM multidrug efflux pump in Pseudomonas aeruginosa | ||||||
Components | NalD | ||||||
Keywords | TRANSCRIPTION REGULATOR / Repressor / Transcriptional regulator / TetR family | ||||||
Function / homology | Function and homology information negative regulation of transport / negative regulation of transmembrane transport / negative regulation of transporter activity / transcription cis-regulatory region binding / DNA-binding transcription factor activity / negative regulation of DNA-templated transcription / regulation of DNA-templated transcription / DNA binding Similarity search - Function | ||||||
Biological species | Pseudomonas aeruginosa PAO1 (bacteria) | ||||||
Method | X-RAY DIFFRACTION / SYNCHROTRON / SAD / Resolution: 2.65 Å | ||||||
Authors | Chen, W.Z. / Wang, D. / Huang, S.Q. / Hu, Q.Y. / Liu, X.C. / Gan, J.H. / Chen, H. | ||||||
Funding support | China, 1items
| ||||||
Citation | Journal: Mol.Microbiol. / Year: 2016 Title: Novobiocin binding to NalD induces the expression of the MexAB-OprM pump in Pseudomonas aeruginosa Authors: Chen, W.Z. / Wang, D. / Zhou, W. / Sang, H. / Liu, X.C. / Ge, Z. / Zhang, J. / Lan, L. / Yang, C.G. / Chen, H. | ||||||
History |
|
-Structure visualization
Structure viewer | Molecule: MolmilJmol/JSmol |
---|
-Downloads & links
-Download
PDBx/mmCIF format | 5daj.cif.gz | 642.6 KB | Display | PDBx/mmCIF format |
---|---|---|---|---|
PDB format | pdb5daj.ent.gz | 541.9 KB | Display | PDB format |
PDBx/mmJSON format | 5daj.json.gz | Tree view | PDBx/mmJSON format | |
Others | Other downloads |
-Validation report
Summary document | 5daj_validation.pdf.gz | 483.9 KB | Display | wwPDB validaton report |
---|---|---|---|---|
Full document | 5daj_full_validation.pdf.gz | 500.5 KB | Display | |
Data in XML | 5daj_validation.xml.gz | 50.4 KB | Display | |
Data in CIF | 5daj_validation.cif.gz | 68 KB | Display | |
Arichive directory | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/da/5daj ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/da/5daj | HTTPS FTP |
-Related structure data
-Links
-Assembly
Deposited unit |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2 |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3 |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
4 |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Unit cell |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Noncrystallographic symmetry (NCS) | NCS domain:
NCS domain segments: Component-ID: _ / Refine code: _
|