登録情報 | データベース: PDB / ID: 5cyk |
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タイトル | Structure of Ytm1 bound to the C-terminal domain of Erb1-R486E |
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要素 | - Ribosome biogenesis protein ERB1
- Ribosome biogenesis protein YTM1
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キーワード | PROTEIN BINDING / ribosome assembly / WD40 / beta-propeller / ubiquitin-like domain |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
PeBoW complex / maturation of 5.8S rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) / preribosome, large subunit precursor / ribonucleoprotein complex binding / maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) / nucleoplasm類似検索 - 分子機能 WD repeat WDR12/Ytm1 / BOP1, N-terminal domain / WD repeat BOP1/Erb1 / BOP1NT (NUC169) domain / BOP1NT (NUC169) domain / NLE / NLE (NUC135) domain / YVTN repeat-like/Quinoprotein amine dehydrogenase / 7 Propeller / Methylamine Dehydrogenase; Chain H ...WD repeat WDR12/Ytm1 / BOP1, N-terminal domain / WD repeat BOP1/Erb1 / BOP1NT (NUC169) domain / BOP1NT (NUC169) domain / NLE / NLE (NUC135) domain / YVTN repeat-like/Quinoprotein amine dehydrogenase / 7 Propeller / Methylamine Dehydrogenase; Chain H / G-protein beta WD-40 repeat / WD40 repeat, conserved site / Trp-Asp (WD) repeats signature. / Trp-Asp (WD) repeats profile. / Trp-Asp (WD) repeats circular profile. / WD domain, G-beta repeat / WD40 repeats / WD40 repeat / WD40-repeat-containing domain superfamily / WD40/YVTN repeat-like-containing domain superfamily / Mainly Beta類似検索 - ドメイン・相同性 Ribosome biogenesis protein ERB1 / Ribosome biogenesis protein YTM1類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | Chaetomium thermophilum (菌類) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 3 Å |
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データ登録者 | Wegrecki, M. / Bravo, J. |
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引用 | ジャーナル: Nucleic Acids Res. / 年: 2015 タイトル: The structure of Erb1-Ytm1 complex reveals the functional importance of a high-affinity binding between two beta-propellers during the assembly of large ribosomal subunits in eukaryotes. 著者: Wegrecki, M. / Rodriguez-Galan, O. / de la Cruz, J. / Bravo, J. |
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履歴 | 登録 | 2015年7月30日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: PDBE |
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改定 1.0 | 2015年10月28日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2015年12月23日 | Group: Database references |
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改定 1.2 | 2024年1月10日 | Group: Data collection / Database references / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession |
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