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データを開く
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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 5cup | ||||||
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タイトル | Structure of Rhodopseudomonas palustris PduL - phosphate bound form | ||||||
![]() | Phosphate propanoyltransferase | ||||||
![]() | TRANSFERASE / Enzyme | ||||||
機能・相同性 | ![]() phosphate propanoyltransferase / propanediol catabolic process / bacterial microcompartment / acyltransferase activity, transferring groups other than amino-acyl groups / identical protein binding / metal ion binding 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Sutter, M. / Erbilgin, O. / Kerfeld, C.A. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: The Structural Basis of Coenzyme A Recycling in a Bacterial Organelle. 著者: Erbilgin, O. / Sutter, M. / Kerfeld, C.A. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 150.3 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 118.6 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 442.1 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 442.6 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 17.6 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 25.2 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 21907.998 Da / 分子数: 2 / 断片: unp residues 34-226 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() 株: BisB18 / 遺伝子: RPC_1169 / 発現宿主: ![]() ![]() #2: 化合物 | ChemComp-ZN / #3: 化合物 | #4: 水 | ChemComp-HOH / | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.62 Å3/Da / 溶媒含有率: 52.98 % |
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結晶化 | 温度: 295 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / pH: 7.4 / 詳細: 35% MPD |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K |
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
検出器 | タイプ: ADSC QUANTUM 315r / 検出器: CCD / 日付: 2015年5月31日 |
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 2.1→39.23 Å / Num. obs: 27556 / % possible obs: 99.93 % / 冗長度: 6.8 % / Net I/σ(I): 13.78 |
反射 シェル | 解像度: 2.1→2.21 Å / 冗長度: 6.1 % / Rmerge(I) obs: 0.856 / Mean I/σ(I) obs: 2 / % possible all: 99.9 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]()
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溶媒の処理 | 減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.1→39.227 Å
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拘束条件 |
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LS精密化 シェル |
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