PDB-5boz: Ricin A chain bound to camelid nanobody (VHH9)(E1)

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 5boz

タイトル

Ricin A chain bound to camelid nanobody (VHH9)(E1)

要素

Ricin
VHH single chain antibody E1

キーワード

Hydrolase/Immune system / Toxin / VHH antibodies / Hydrolase-Immune system complex

機能・相同性

機能・相同性情報

rRNA N-glycosylase / rRNA N-glycosylase activity / AMP binding / defense response / toxin activity / carbohydrate binding / killing of cells of another organism / negative regulation of translation
類似検索 - 分子機能

生物種

Ricinus communis (トウゴマ)

Vicugna pacos (アルパカ)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 3.1 Å

データ登録者

Rudolph, M.J. / Mantis, N.

資金援助

米国, 1件

引用

ジャーナル: J. Biol. Chem. / 年: 2017
タイトル: Structural Analysis of Single Domain Antibodies Bound to a Second Neutralizing Hot Spot on Ricin Toxin's Enzymatic Subunit.
著者: Rudolph, M.J. / Vance, D.J. / Cassidy, M.S. / Rong, Y. / Mantis, N.J.

履歴

登録	2015年5月27日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.0	2016年12月7日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2016年12月21日	Group: Database references
改定 1.2	2017年2月1日	Group: Database references
改定 1.3	2017年4月12日	Group: Source and taxonomy / Structure summary
改定 1.4	2017年9月13日	Group: Author supporting evidence / カテゴリ: pdbx_audit_support / Item: _pdbx_audit_support.funding_organization
改定 1.5	2019年12月11日	Group: Author supporting evidence / カテゴリ: pdbx_audit_support / Item: _pdbx_audit_support.funding_organization
改定 1.6	2024年11月6日	Group: Data collection / Database references / Structure summary カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_entry_details / pdbx_modification_feature Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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その他	その他のダウンロード

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文書・詳細版	5boz_full_validation.pdf.gz	648.5 KB	表示
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関連構造データ

関連構造データ	5j56C 5j57C 4z9k C: 同じ文献を引用 (文献)
類似構造データ	3zle-2 4ovz-1 3un7-1 3upp-1 3upo-1 3upn-1 2xzd-2 3p69-d 2c1d-4 1dde-d Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

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リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI
「今月の分子」の関連する項目	#161 - 2013年5月リシン (Ricin) 類似性 (15) #69 - 2005年9月コレラ毒素 (Cholera Toxin) 類似性 (15) #21 - 2001年9月抗体 (Antibodies) 類似性 (1) #256 - 2021年4月 SARSコロナウイルス2型のスパイクと抗体 (SARS-CoV-2 Spike and Antibodies) 類似性 (1)

登録構造単位

A: Ricin

G: VHH single chain antibody E1

B: Ricin

H: VHH single chain antibody E1

C: Ricin

I: VHH single chain antibody E1

D: Ricin

J: VHH single chain antibody E1

E: Ricin

K: VHH single chain antibody E1

F: Ricin

L: VHH single chain antibody E1

ヘテロ分子

261 kDa, 12 ポリマー
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1

A: Ricin

G: VHH single chain antibody E1

ヘテロ分子

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43.5 kDa, 2 ポリマー
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2

B: Ricin

H: VHH single chain antibody E1

ヘテロ分子

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43.7 kDa, 2 ポリマー
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3

C: Ricin

I: VHH single chain antibody E1

ヘテロ分子

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43.6 kDa, 2 ポリマー
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4

D: Ricin

J: VHH single chain antibody E1

ヘテロ分子

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43.4 kDa, 2 ポリマー
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5

E: Ricin

K: VHH single chain antibody E1

ヘテロ分子

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6

F: Ricin

L: VHH single chain antibody E1

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
43.5 kDa, 2 ポリマー
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単位格子

Length a, b, c (Å)	239.610, 242.884, 355.693
Angle α, β, γ (deg.)	90.00, 90.00, 90.00
Int Tables number	22
Space group name H-M	F222

非結晶学的対称性 (NCS)

NCSドメイン:

ID	Ens-ID
1	1
2	1
3	1
4	1
5	1
6	1
1	2
2	2
1	3
2	3
3	3
4	3

NCSドメイン領域:

Dom-ID	Component-ID	Ens-ID	Selection details
1	1	1	chain A and (resseq 5:263 )
2	1	1	chain B and (resseq 5:263 )
3	1	1	chain C and (resseq 5:263 )
4	1	1	chain D and (resseq 5:263 )
5	1	1	chain E and (resseq 5:263 )
6	1	1	chain F and (resseq 5:263 )
1	1	2	chain K and (resseq 0:25 or resseq 27:74 or resseq 77:125 )
2	1	2	chain L and (resseq 0:25 or resseq 27:74 or resseq 77:125 )
1	1	3	chain G and (resseq 3:25 or resseq 27:74 or resseq 77:125 )
2	1	3	chain H and (resseq 3:25 or resseq 27:74 or resseq 77:125 )
3	1	3	chain I and (resseq 3:25 or resseq 27:74 or resseq 77:125 )
4	1	3	chain J and (resseq 3:25 or resseq 27:74 or resseq 77:125 )

NCSアンサンブル:

ID
1
2
3

#1: タンパク質	Ricin 分子量: 29216.932 Da / 分子数: 6 / 断片: UNP residues 39-298 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Ricinus communis (トウゴマ) / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: P02879, rRNA N-glycosylase
#2: 抗体	VHH single chain antibody E1 分子量: 13988.741 Da / 分子数: 6 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Vicugna pacos (アルパカ) / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌)
#3: 化合物	ChemComp-SO4 / SULFATE ION / 硫酸ジアニオン分子量: 96.063 Da / 分子数: 20 / 由来タイプ: 合成 / 式: SO₄
#4: 化合物	ChemComp-CL / CHLORIDE ION / クロリド分子量: 35.453 Da / 分子数: 3 / 由来タイプ: 合成 / 式: Cl
#5: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 26 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O
Has protein modification	Y

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 4.99 Å³/Da / 溶媒含有率: 75.35 %
結晶化	温度: 298 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / pH: 7.5 / 詳細: 1.45 M Ammonium Sulfate, 25% glycerol

-
データ収集

回折

平均測定温度: 100 K

放射光源

由来:

シンクロトロン / サイト:

APS

/ ビームライン: 24-ID-E / 波長: 0.979 Å

検出器

タイプ: ADSC QUANTUM 315 / 検出器: CCD / 日付: 2014年2月15日

放射

プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray

放射波長

波長: 0.979 Å / 相対比: 1

Reflection twin

Operator: -k,-h,-l / Fraction: 0.017

反射

解像度: 2.93→49.681 Å / Num. obs: 109638 / % possible obs: 99.8 % / 冗長度: 5.8 % / R_merge(I) obs: 0.2 / R_pim(I) all: 0.118 / R_rim(I) all: 0.219 / Χ²: 1.233 / Net I/av σ(I): 7.368 / Net I/σ(I): 2.4 / Num. measured all: 640340

反射シェル

Diffraction-ID: 1 / Rejects: _

解像度 (Å)	冗長度 (%)	Num. unique all	CC_1/2	R_pim(I) all	Χ²	% possible all	R_merge(I) obs	R_rim(I) all
2.98-3.1	5.6	5459	0.562	0.973	0.782	99.9
2.98-3.03	5.2	5418	0.585	0.9	0.808	99.6
3.03-3.09	4.8	5439	0.622	0.854	0.869	99.8
3.09-3.16	5.3	5466	0.744	0.705	0.873	100
3.16-3.22	6.2	5430	0.836	0.568	0.918	100
3.22-3.3	6.4	5458	0.921	0.449	0.932	100
3.3-3.38	6.3	5448	0.925	0.356	0.942	100	0.829	0.904
3.38-3.47	6.3	5480	0.954	0.287	0.99	100	0.671	0.731
3.47-3.58	6	5465	0.964	0.239	1.051	99.9	0.541	0.592
3.58-3.69	5.6	5450	0.968	0.231	1.104	99.9	0.499	0.551
3.69-3.82	6.1	5468	0.986	0.147	1.085	99.9	0.333	0.365
3.82-3.98	6.2	5470	0.987	0.124	1.232	99.9	0.286	0.312
3.98-4.16	5.9	5470	0.99	0.107	1.321	100	0.241	0.264
4.16-4.38	5.4	5475	0.989	0.096	1.573	99.7	0.204	0.226
4.38-4.65	4.8	5465	0.991	0.086	1.776	99.7	0.171	0.192
4.65-5.01	6.3	5511	0.994	0.071	1.758	99.9	0.164	0.179
5.01-5.51	6.6	5514	0.995	0.068	1.632	100	0.161	0.175
5.51-6.31	6.1	5548	0.99	0.071	1.564	100	0.161	0.176
6.31-7.94	6.2	5551	0.996	0.047	1.467	99.9	0.107	0.117
7.94-50	5.6	5653	0.996	0.032	1.897	98.9	0.072	0.079

-
位相決定

位相決定

手法:

分子置換

Phasing MR

Model details: Phaser MODE: MR_AUTO

	最高解像度	最低解像度
Rotation	3.5 Å	29.73 Å
Translation	3.5 Å	29.73 Å

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
PHENIX	1.7.1_743	精密化
SCALEPACK		データスケーリング
PHASER	2.5.6	位相決定
PDB_EXTRACT	3.15	データ抽出
HKL-2000		データ削減
PHASER		位相決定

精密化

構造決定の手法:

分子置換 / 解像度: 3.1→49.681 Å / 交差検証法: FREE R-VALUE / σ(F): 1.97 / 位相誤差: 37.1 / 立体化学のターゲット値: TWIN_LSQ_F

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.2771	4748	5.1 %
R_work	0.2154	-	-
obs	0.2177	93146	99.84 %

溶媒の処理

減衰半径: 0.83 Å / VDWプローブ半径: 1.1 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL / B_sol: 66.662 Å² / k_sol: 0.342 e/Å³

原子変位パラメータ

	B_aniso -1	B_aniso -2	B_aniso -3
1-	23.6244 Å²	-0 Å²	-0 Å²
2-	-	2.0402 Å²	-0 Å²
3-	-	-	-25.6646 Å²

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 3.1→49.681 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	17941	0	103	26	18070

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	数
X-RAY DIFFRACTION	f_bond_d	0.016	18467
X-RAY DIFFRACTION	f_angle_d	1.818	25080
X-RAY DIFFRACTION	f_dihedral_angle_d	18.209	6682
X-RAY DIFFRACTION	f_chiral_restr	0.113	2752
X-RAY DIFFRACTION	f_plane_restr	0.008	3285

Refine LS restraints NCS

Ens-ID	Dom-ID	Auth asym-ID	数	Refine-ID	タイプ	Rms dev position (Å)
1	1	A	2046	X-RAY DIFFRACTION	POSITIONAL
1	2	B	2046	X-RAY DIFFRACTION	POSITIONAL	0.062
1	3	C	2046	X-RAY DIFFRACTION	POSITIONAL	0.108
1	4	D	2046	X-RAY DIFFRACTION	POSITIONAL	0.062
1	5	E	2024	X-RAY DIFFRACTION	POSITIONAL	0.094
1	6	F	2046	X-RAY DIFFRACTION	POSITIONAL	0.071
2	1	K	961	X-RAY DIFFRACTION	POSITIONAL
2	2	L	961	X-RAY DIFFRACTION	POSITIONAL	0.087
3	1	G	907	X-RAY DIFFRACTION	POSITIONAL
3	2	H	907	X-RAY DIFFRACTION	POSITIONAL	0.065
3	3	I	900	X-RAY DIFFRACTION	POSITIONAL	0.064
3	4	J	907	X-RAY DIFFRACTION	POSITIONAL	0.065

LS精密化シェル

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	R_factor R_work	Num. reflection R_work	Refine-ID	% reflection obs (%)
3.1003-3.1538	0.4227	239	0.2855	4386	X-RAY DIFFRACTION	95
3.1538-3.2111	0.3712	244	0.2845	4380	X-RAY DIFFRACTION	95
3.2111-3.2728	0.3659	226	0.2807	4388	X-RAY DIFFRACTION	95
3.2728-3.3395	0.3725	192	0.2648	4443	X-RAY DIFFRACTION	96
3.3395-3.4121	0.3552	241	0.2621	4380	X-RAY DIFFRACTION	95
3.4121-3.4914	0.3313	218	0.2519	4413	X-RAY DIFFRACTION	95
3.4914-3.5786	0.3485	259	0.2404	4377	X-RAY DIFFRACTION	94
3.5786-3.6753	0.3132	229	0.2303	4370	X-RAY DIFFRACTION	95
3.6753-3.7833	0.3257	245	0.2224	4406	X-RAY DIFFRACTION	95
3.7833-3.9053	0.291	243	0.2145	4395	X-RAY DIFFRACTION	95
3.9053-4.0447	0.2383	219	0.204	4418	X-RAY DIFFRACTION	95
4.0447-4.2063	0.248	225	0.1996	4423	X-RAY DIFFRACTION	95
4.2063-4.3974	0.2484	247	0.1881	4379	X-RAY DIFFRACTION	94
4.3974-4.6288	0.2154	277	0.1685	4369	X-RAY DIFFRACTION	94
4.6288-4.9181	0.2022	237	0.1775	4395	X-RAY DIFFRACTION	95
4.9181-5.2966	0.2847	224	0.1863	4465	X-RAY DIFFRACTION	95
5.2966-5.8275	0.2231	205	0.1989	4477	X-RAY DIFFRACTION	96
5.8275-6.6657	0.2782	230	0.223	4472	X-RAY DIFFRACTION	95
6.6657-8.3793	0.2797	257	0.1918	4468	X-RAY DIFFRACTION	94
8.3793-35.1342	0.2373	245	0.2077	4561	X-RAY DIFFRACTION	94

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	1.9241	-0.3945	-1.39	1.9265	0.1575	1.443	-0.44	-0.8059	0.1748	0.3284	0.448	0.2567	-0.0037	-0.6011	0.003	0.4773	0.2705	0.0072	1.5219	-0.0277	0.4708	-25.5199	-52.3869	-59.744
2	3.4133	-0.6615	-0.6964	2.3591	-0.4425	0.412	-0.2666	-0.0917	0.1648	-0.0855	0.1984	0.239	-0.1731	-0.6255	0.0619	0.429	0.2604	-0.125	1.4416	-0.2058	0.4184	-23.408	-46.861	-70.4737
3	0.05	0.2679	0.2559	1.4797	1.6521	3.2424	0.0032	-0.6754	0.2372	0.272	0.1382	-0.2544	-0.6408	-0.4061	-0.0567	0.8613	0.5305	-0.2285	1.7634	-0.3637	0.6856	-28.3298	-28.6692	-55.9643
4	0.5743	0.8139	-0.9814	2.4255	-1.1518	2.0677	-0.0683	-0.4955	0.2465	0.4193	0.1434	-0.1157	-0.3052	0.0499	-0.0265	0.7702	0.5276	-0.0926	1.9206	-0.3121	0.5725	-27.162	-37.8493	-48.0592
5	5.3015	-2.4514	0.7146	3.0318	0.5361	0.5432	-0.5885	-0.2352	0.0832	0.6285	0.0686	0.1258	-0.747	1.6528	0.5978	0.795	-0.0558	-0.1084	1.3917	0.0159	0.7923	-23.8157	-55.1996	-93.1417
6	3.2281	-1.1533	-1.3421	3.4252	3.3559	3.3039	-0.0809	0.9685	0.3169	-0.7825	-0.0081	0.3738	-1.4439	-1.2491	0.1186	0.8882	-0.3184	-0.2089	1.6594	0.3237	0.6163	-21.3006	-44.0798	-114.436
7	0.1893	0.794	0.0949	3.3289	0.3979	0.0475	-0.2894	-0.0969	-0.309	0.6938	0.6936	0.2043	-0.211	-1.824	-0.3776	1.1336	0.2086	-0.2346	2.2423	-0.119	0.8377	-30.5635	-50.5016	-94.4122
8	5.4188	3.5098	-5.4591	2.273	-3.5357	5.4993	0.1073	-0.3906	-0.1499	0.3745	0.0016	-0.099	-0.305	-0.2907	-0.1096	0.7347	0.2753	-0.1843	1.8322	-0.0833	0.5529	-22.4877	-42.6568	-95.942
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51	3.0593	-1.8298	0.1896	3.8186	-0.5504	2.015	-0.1501	-0.2845	-0.0187	0.0332	0.0579	-0.1094	0.1455	-0.1391	0.067	0.3581	0.2554	-0.0429	0.2299	-0.0741	0.151	49.7532	-50.0169	-70.1384
52	1.7994	-0.1056	0.5901	1.1826	-0.1933	0.3046	0.0447	0.057	0.4986	0.0519	-0.0124	0.0258	-0.0979	-0.1297	-0.0932	0.2893	0.3389	-0.0578	0.3272	-0.0614	0.3065	37.9558	-44.007	-69.0335
53	1.2205	-0.4092	0.3032	1.9079	0.6866	2.6978	-0.2438	-0.3537	0.419	0.0224	0.011	-0.0328	-0.2858	-0.0084	0.1933	0.4514	0.3573	-0.1922	0.5915	-0.2588	0.4118	38.4332	-32.0812	-56.2862
54	1.1705	0.8864	0.8397	0.7043	0.4113	2.1011	0.2686	-0.1038	-0.5268	0.0919	0.2116	-0.8228	0.4912	0.2518	-0.3472	0.4383	-0.0322	-0.2274	0.1535	-0.0135	0.5317	44.5828	-55.8729	-92.0495
55	8.8119	-3.2973	3.1665	2.6561	-0.7949	1.2448	-0.2535	0.7994	0.2746	-1.0275	-0.3573	-0.0205	-0.096	-0.3951	0.5381	0.9021	-0.0833	-0.0467	0.8069	0.0096	0.2346	45.2845	-44.1625	-114.095
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60	0.8868	-0.0916	-0.851	0.3343	0.0586	0.819	0.0435	0.2303	0.1309	-0.0718	-0.0863	-0.1483	0.001	0.2362	0.1619	0.0253	0.0284	-0.0578	0.2542	0.0036	0.3	48.0116	-47.3749	-98.1868
61	1.8558	-0.8615	-1.3351	2.9556	1.5016	3.0535	0.2006	0.402	-0.2274	-0.2234	0.1027	0.117	0.8027	-0.2069	-0.1667	0.7004	0.286	-0.2907	0.4768	-0.1197	0.3546	7.9903	-18.0217	-29.1911
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67	3.5134	0.5316	-0.4233	3.4676	-0.8165	0.464	0.5328	0.7252	-0.3747	-1.0599	0.4491	0.5898	1.6663	-0.5161	-0.948	1.5651	0.1817	-0.101	0.626	0.1839	0.5393	9.7072	-23.2203	4.3439
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69	6.0911	-3.7348	-0.5367	6.8147	3.3413	4.3928	-0.4926	-0.7089	0.0141	0.5059	0.78	-0.0735	0.2651	0.7472	-0.0699	1.0379	0.6288	-0.1848	0.9648	-0.1261	0.5187	24.5257	-23.1416	5.4249
70	3.2571	-1.8993	0.1405	3.2512	2.1602	7.1517	0.1728	-0.7379	-0.2727	0.3846	0.1971	-0.3503	1.7645	1.6159	-0.3714	1.282	0.3426	-0.248	1.0035	-0.0856	0.4829	19.6789	-20.4398	14.7643
71	0.646	0.4951	-0.4894	0.3793	-0.3748	0.3709	0.1825	-0.2686	-0.0437	0.0993	0.0497	0.0564	-0.1909	0.186	0.0377	0.6405	0.3637	-0.1594	0.6672	-0.216	0.3124	17.1899	-16.8079	0.8664
72	7.0198	0.449	3.0641	1.7727	-1.705	3.4094	0.3678	0.2801	-0.3853	-0.2597	-0.2206	-0.1246	0.4615	0.7089	-0.1027	0.5644	0.3696	-0.2269	0.9805	-0.3058	0.5209	23.406	-15.2592	-2.6209
73	9.3069	0.5101	7.2229	8.738	-1.02	6.9115	-0.2225	-0.1813	0.4199	0.1938	-0.1413	1.1537	-0.4989	-1.1698	0.3625	0.3946	0.2634	-0.1429	0.5087	-0.1094	0.5141	11.8183	-13.451	1.6591
74	2.0159	1.8919	-2.0843	8.9092	1.7103	4.0394	-0.2936	-0.232	0.3212	0.0686	-0.2379	-0.1359	-0.6606	0.9653	0.4146	0.9654	0.2383	-0.2705	0.6902	-0.1511	0.4323	15.6687	-9.6127	20.6786

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Selection details
1	X-RAY DIFFRACTION	1	chain 'A' and (resseq 5:97)
2	X-RAY DIFFRACTION	2	chain 'A' and (resseq 98:201)
3	X-RAY DIFFRACTION	3	chain 'A' and (resseq 202:247)
4	X-RAY DIFFRACTION	4	chain 'A' and (resseq 248:263)
5	X-RAY DIFFRACTION	5	chain 'G' and (resseq 0:7)
6	X-RAY DIFFRACTION	6	chain 'G' and (resseq 8:16)
7	X-RAY DIFFRACTION	7	chain 'G' and (resseq 17:32)
8	X-RAY DIFFRACTION	8	chain 'G' and (resseq 33:39)
9	X-RAY DIFFRACTION	9	chain 'G' and (resseq 40:51)
10	X-RAY DIFFRACTION	10	chain 'G' and (resseq 52:64)
11	X-RAY DIFFRACTION	11	chain 'G' and (resseq 65:77)
12	X-RAY DIFFRACTION	12	chain 'G' and (resseq 78:84)
13	X-RAY DIFFRACTION	13	chain 'G' and (resseq 85:103)
14	X-RAY DIFFRACTION	14	chain 'G' and (resseq 104:112)
15	X-RAY DIFFRACTION	15	chain 'G' and (resseq 113:125)
16	X-RAY DIFFRACTION	16	chain 'B' and (resseq 5:122)
17	X-RAY DIFFRACTION	17	chain 'B' and (resseq 123:193)
18	X-RAY DIFFRACTION	18	chain 'B' and (resseq 194:219)
19	X-RAY DIFFRACTION	19	chain 'B' and (resseq 220:264)
20	X-RAY DIFFRACTION	20	chain 'H' and (resseq -1:23)
21	X-RAY DIFFRACTION	21	chain 'H' and (resseq 24:32)
22	X-RAY DIFFRACTION	22	chain 'H' and (resseq 33:51)
23	X-RAY DIFFRACTION	23	chain 'H' and (resseq 52:64)
24	X-RAY DIFFRACTION	24	chain 'H' and (resseq 65:77)
25	X-RAY DIFFRACTION	25	chain 'H' and (resseq 78:84)
26	X-RAY DIFFRACTION	26	chain 'H' and (resseq 85:125)
27	X-RAY DIFFRACTION	27	chain 'C' and (resseq 5:97)
28	X-RAY DIFFRACTION	28	chain 'C' and (resseq 98:193)
29	X-RAY DIFFRACTION	29	chain 'C' and (resseq 194:263)
30	X-RAY DIFFRACTION	30	chain 'I' and (resseq 3:23)
31	X-RAY DIFFRACTION	31	chain 'I' and (resseq 24:39)
32	X-RAY DIFFRACTION	32	chain 'I' and (resseq 40:51)
33	X-RAY DIFFRACTION	33	chain 'I' and (resseq 52:64)
34	X-RAY DIFFRACTION	34	chain 'I' and (resseq 65:77)
35	X-RAY DIFFRACTION	35	chain 'I' and (resseq 78:84)
36	X-RAY DIFFRACTION	36	chain 'I' and (resseq 85:103)
37	X-RAY DIFFRACTION	37	chain 'I' and (resseq 104:112)
38	X-RAY DIFFRACTION	38	chain 'I' and (resseq 113:125)
39	X-RAY DIFFRACTION	39	chain 'D' and (resseq 5:193)
40	X-RAY DIFFRACTION	40	chain 'D' and (resseq 194:263)
41	X-RAY DIFFRACTION	41	chain 'J' and (resseq 3:23)
42	X-RAY DIFFRACTION	42	chain 'J' and (resseq 24:32)
43	X-RAY DIFFRACTION	43	chain 'J' and (resseq 33:51)
44	X-RAY DIFFRACTION	44	chain 'J' and (resseq 52:69)
45	X-RAY DIFFRACTION	45	chain 'J' and (resseq 70:84)
46	X-RAY DIFFRACTION	46	chain 'J' and (resseq 85:99)
47	X-RAY DIFFRACTION	47	chain 'J' and (resseq 100:109)
48	X-RAY DIFFRACTION	48	chain 'J' and (resseq 110:119)
49	X-RAY DIFFRACTION	49	chain 'J' and (resseq 120:125)
50	X-RAY DIFFRACTION	50	chain 'E' and (resseq 5:97)
51	X-RAY DIFFRACTION	51	chain 'E' and (resseq 98:156)
52	X-RAY DIFFRACTION	52	chain 'E' and (resseq 157:193)
53	X-RAY DIFFRACTION	53	chain 'E' and (resseq 194:263)
54	X-RAY DIFFRACTION	54	chain 'K' and (resseq -1:7)
55	X-RAY DIFFRACTION	55	chain 'K' and (resseq 8:17)
56	X-RAY DIFFRACTION	56	chain 'K' and (resseq 18:32)
57	X-RAY DIFFRACTION	57	chain 'K' and (resseq 33:51)
58	X-RAY DIFFRACTION	58	chain 'K' and (resseq 52:103)
59	X-RAY DIFFRACTION	59	chain 'K' and (resseq 104:112)
60	X-RAY DIFFRACTION	60	chain 'K' and (resseq 113:125)
61	X-RAY DIFFRACTION	61	chain 'F' and (resseq 5:97)
62	X-RAY DIFFRACTION	62	chain 'F' and (resseq 98:193)
63	X-RAY DIFFRACTION	63	chain 'F' and (resseq 194:219)
64	X-RAY DIFFRACTION	64	chain 'F' and (resseq 220:264)
65	X-RAY DIFFRACTION	65	chain 'L' and (resseq 0:7)
66	X-RAY DIFFRACTION	66	chain 'L' and (resseq 8:17)
67	X-RAY DIFFRACTION	67	chain 'L' and (resseq 18:32)
68	X-RAY DIFFRACTION	68	chain 'L' and (resseq 33:51)
69	X-RAY DIFFRACTION	69	chain 'L' and (resseq 52:64)
70	X-RAY DIFFRACTION	70	chain 'L' and (resseq 65:91)
71	X-RAY DIFFRACTION	71	chain 'L' and (resseq 92:103)
72	X-RAY DIFFRACTION	72	chain 'L' and (resseq 104:112)
73	X-RAY DIFFRACTION	73	chain 'L' and (resseq 113:119)
74	X-RAY DIFFRACTION	74	chain 'L' and (resseq 120:125)

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

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関連情報:EMDBヘッダ

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新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

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万見 (Yorodumi)