登録情報 | データベース: PDB / ID: 5b43 |
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タイトル | Crystal structure of Acidaminococcus sp. Cpf1 in complex with crRNA and target DNA |
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要素 | - CRISPR-associated endonuclease Cpf1
- DNA (34-MER)
- DNA (5'-D(*CP*AP*GP*TP*CP*CP*TP*TP*TP*A)-3')
- RNA (43-MER)
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キーワード | HYDROLASE/RNA/DNA / nuclease / HYDROLASE-RNA-DNA complex |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
Bacillus subtilis ribonuclease / : / deoxyribonuclease I / deoxyribonuclease I activity / defense response to virus / lyase activity / DNA binding / RNA binding類似検索 - 分子機能 CRISPR-associated endonuclease Cas12a / Cas12a, REC1 domain / Cas12a, RuvC nuclease domain / Cas12a, nuclease domain / Alpha helical recognition lobe domain / Nuclease domain / RuvC nuclease domain類似検索 - ドメイン・相同性 DNA / DNA (> 10) / RNA / RNA (> 10) / CRISPR-associated endonuclease Cas12a類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | Acidaminococcus sp. BV3L6 (バクテリア) Acidaminococcus (バクテリア) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 単波長異常分散 / 解像度: 2.8 Å |
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データ登録者 | Yamano, T. / Nishimasu, H. / Hirano, H. / Nakane, T. / Ishitani, R. / Nureki, O. |
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引用 | ジャーナル: Cell / 年: 2016 タイトル: Crystal Structure of Cpf1 in Complex with Guide RNA and Target DNA 著者: Yamano, T. / Nishimasu, H. / Zetsche, B. / Hirano, H. / Slaymaker, I.M. / Li, Y. / Fedorova, I. / Nakane, T. / Makarova, K.S. / Koonin, E.V. / Ishitani, R. / Zhang, F. / Nureki, O. |
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履歴 | 登録 | 2016年3月30日 | 登録サイト: PDBJ / 処理サイト: PDBJ |
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改定 1.0 | 2016年5月4日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2016年5月18日 | Group: Database references |
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改定 1.2 | 2017年10月4日 | Group: Data collection / Derived calculations / カテゴリ: diffrn_detector / pdbx_struct_oper_list Item: _diffrn_detector.detector / _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation |
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改定 1.3 | 2024年3月20日 | Group: Data collection / Database references / カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession |
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