登録情報 | データベース: PDB / ID: 4yvg |
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タイトル | Crystal Structure of H. influenzae TrmD in complex with AdoMet |
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要素 | tRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase |
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キーワード | TRANSFERASE / MTase / SPOUT |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
tRNA N1-guanine methylation / tRNA (guanine37-N1)-methyltransferase / tRNA (guanine(37)-N1)-methyltransferase activity / cytosol類似検索 - 分子機能 tRNA(m1g37)methyltransferase, domain 2 / Trp Operon Repressor; Chain A / tRNA (guanine-N1-)-methyltransferase, bacteria / tRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase, C-terminal domain superfamily / tRNA methyltransferase TRMD/TRM10-type domain / tRNA (Guanine-1)-methyltransferase / SPOUT methyltransferase, trefoil knot domain / Alpha/beta knot / tRNA (guanine-N1-)-methyltransferase, N-terminal / Alpha/beta knot methyltransferases ...tRNA(m1g37)methyltransferase, domain 2 / Trp Operon Repressor; Chain A / tRNA (guanine-N1-)-methyltransferase, bacteria / tRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase, C-terminal domain superfamily / tRNA methyltransferase TRMD/TRM10-type domain / tRNA (Guanine-1)-methyltransferase / SPOUT methyltransferase, trefoil knot domain / Alpha/beta knot / tRNA (guanine-N1-)-methyltransferase, N-terminal / Alpha/beta knot methyltransferases / Orthogonal Bundle / 3-Layer(aba) Sandwich / Mainly Alpha / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 S-ADENOSYLMETHIONINE / tRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | Haemophilus influenzae (インフルエンザ菌) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 1.549 Å |
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データ登録者 | Ito, T. / Yokoyama, S. |
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引用 | ジャーナル: Proc.Natl.Acad.Sci.USA / 年: 2015 タイトル: Structural basis for methyl-donor-dependent and sequence-specific binding to tRNA substrates by knotted methyltransferase TrmD. 著者: Ito, T. / Masuda, I. / Yoshida, K. / Goto-Ito, S. / Sekine, S. / Suh, S.W. / Hou, Y.M. / Yokoyama, S. |
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履歴 | 登録 | 2015年3月20日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: PDBJ |
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改定 1.0 | 2015年7月15日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2015年7月29日 | Group: Database references |
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改定 1.2 | 2015年8月19日 | Group: Database references |
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改定 1.3 | 2020年2月19日 | Group: Data collection / Database references / Derived calculations カテゴリ: citation / diffrn_source / pdbx_struct_oper_list Item: _citation.journal_id_CSD / _diffrn_source.pdbx_synchrotron_site / _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation |
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改定 1.4 | 2023年11月8日 | Group: Data collection / Database references / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession |
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