登録情報 | データベース: PDB / ID: 4y8v |
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タイトル | Ca. Korarchaeum cryptofilum dinucleotide forming Acetyl-coenzyme A synthetase 1 in complex with ADP and additional ADP bound to phosphate binding site |
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要素 | - alpha subunit of acetyl-CoA synthetase (NDP forming)
- beta subunit of acetyl-CoA synthetase (NDP forming)
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キーワード | TRANSFERASE / Dinucleotide forming acetyl-CoA synthetase / complex / ACD |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
acetate-CoA ligase (ADP-forming) activity / nucleotide binding / ATP binding / metal ion binding類似検索 - 分子機能 : / Ligase-CoA domain / ATP-grasp domain / Ligase-CoA domain / Succinyl-CoA synthetase-like, flavodoxin domain / Succinyl-CoA ligase like flavodoxin domain / CoA binding domain / Succinyl-CoA synthetase domains / Succinyl-CoA synthetase-like / CoA binding domain ...: / Ligase-CoA domain / ATP-grasp domain / Ligase-CoA domain / Succinyl-CoA synthetase-like, flavodoxin domain / Succinyl-CoA ligase like flavodoxin domain / CoA binding domain / Succinyl-CoA synthetase domains / Succinyl-CoA synthetase-like / CoA binding domain / CoA-binding / ATP-grasp fold, A domain / ATP-grasp fold, B domain / ATP-grasp fold, subdomain 1 / ATP-grasp fold / ATP-grasp fold profile. / D-amino Acid Aminotransferase; Chain A, domain 1 / Dna Ligase; domain 1 / NAD(P)-binding Rossmann-like Domain / NAD(P)-binding domain superfamily / Rossmann fold / 2-Layer Sandwich / 3-Layer(aba) Sandwich / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE / Acyl-CoA synthetase (NDP forming) / ATP-grasp domain-containing protein類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | Korarchaeum cryptofilum |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 2.099 Å |
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データ登録者 | Weisse, R.H.-J. / Scheidig, A.J. |
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引用 | ジャーナル: Proc.Natl.Acad.Sci.USA / 年: 2016 タイトル: Structure of NDP-forming Acetyl-CoA synthetase ACD1 reveals a large rearrangement for phosphoryl transfer. 著者: Weie, R.H. / Faust, A. / Schmidt, M. / Schonheit, P. / Scheidig, A.J. |
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履歴 | 登録 | 2015年2月16日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: PDBE |
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改定 1.0 | 2016年1月27日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2016年2月3日 | Group: Database references |
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改定 1.2 | 2016年2月10日 | Group: Database references |
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改定 1.3 | 2024年5月8日 | Group: Data collection / Database references / Derived calculations カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id |
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