- PDB-4x7l: Co-crystal Structure of PERK bound to 4-{2-amino-4-methyl-3-[2-(m... -
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基本情報
登録情報
データベース: PDB / ID: 4x7l
タイトル
Co-crystal Structure of PERK bound to 4-{2-amino-4-methyl-3-[2-(methylamino)-1,3-benzothiazol-6-yl]benzoyl}-1-methyl-2,5-diphenyl-1,2-dihydro-3H-pyrazol-3-one inhibitor
温度: 277 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 6.5 / 詳細: 0.18M Na/K Tartrate, 0.1M MES pH 6.5
-
データ収集
回折
平均測定温度: 80 K
放射光源
由来: シンクロトロン / サイト: ALS / ビームライン: 5.0.1 / 波長: 1 Å
検出器
タイプ: ADSC QUANTUM 315 / 検出器: CCD / 日付: 2011年6月6日
放射
プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長
波長: 1 Å / 相対比: 1
反射
解像度: 1.9→50 Å / Num. obs: 35287 / % possible obs: 99.7 % / 冗長度: 10 % / Rmerge(I) obs: 0.076 / Χ2: 1.004 / Net I/av σ(I): 28.423 / Net I/σ(I): 11.3 / Num. measured all: 353815
反射 シェル
Diffraction-ID: 1 / Rejects: _
解像度 (Å)
冗長度 (%)
Rmerge(I) obs
Num. unique all
Χ2
% possible all
1.9-1.97
7.6
0.918
3485
0.979
100
1.97-2.05
9.6
0.621
3445
0.975
100
2.05-2.14
10.5
0.427
3479
1.002
100
2.14-2.25
10.5
0.294
3481
1.026
100
2.25-2.39
10.5
0.197
3495
1.025
100
2.39-2.58
10.5
0.144
3523
0.995
100
2.58-2.84
10.5
0.094
3516
0.973
99.9
2.84-3.25
10.4
0.064
3537
0.964
99.7
3.25-4.09
10.3
0.06
3582
1.062
99.4
4.09-50
9.8
0.039
3744
1.025
98.1
-
解析
ソフトウェア
名称
バージョン
分類
HKL-2000
データ削減
REFMAC
5.5.0109
精密化
PDB_EXTRACT
3.15
データ抽出
HKL-2000
データスケーリング
REFMAC
位相決定
精密化
解像度: 1.9→41.02 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.968 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.958 / SU B: 4.652 / SU ML: 0.066 / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 0 / ESU R: 0.107 / ESU R Free: 0.102 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD / 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS
Rfactor
反射数
%反射
Selection details
Rfree
0.1932
1762
5 %
RANDOM
Rwork
0.1705
33352
-
-
obs
0.1716
-
99.39 %
-
溶媒の処理
イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.4 Å / 溶媒モデル: MASK