登録情報 | データベース: PDB / ID: 4tqf |
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タイトル | Crystal Structure of the C-terminal domain of IFRS bound with 2-(5-bromothienyl)-L-Ala and ATP |
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要素 | Pyrrolysine--tRNA ligase |
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キーワード | LIGASE / Amino Acyl-tRNA Synthetases / Archaeal Proteins / Evolution / Molecular / Genetic Code / Substrate Specificity |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
pyrrolysine-tRNAPyl ligase / pyrrolysyl-tRNA synthetase activity / tRNA aminoacylation for protein translation / tRNA binding / ATP binding / cytoplasm類似検索 - 分子機能 Pyrrolysyl-tRNA ligase / Pyrrolysyl-tRNA ligase, N-terminal / Helix hairpin bin / Pyrrolysyl-tRNA ligase, C-terminal / Phenylalanyl-tRNA synthetase / tRNA synthetases class II core domain (F) / Bira Bifunctional Protein; Domain 2 / BirA Bifunctional Protein; domain 2 / Aminoacyl-tRNA synthetase, class II / Aminoacyl-transfer RNA synthetases class-II family profile. ...Pyrrolysyl-tRNA ligase / Pyrrolysyl-tRNA ligase, N-terminal / Helix hairpin bin / Pyrrolysyl-tRNA ligase, C-terminal / Phenylalanyl-tRNA synthetase / tRNA synthetases class II core domain (F) / Bira Bifunctional Protein; Domain 2 / BirA Bifunctional Protein; domain 2 / Aminoacyl-tRNA synthetase, class II / Aminoacyl-transfer RNA synthetases class-II family profile. / Class II Aminoacyl-tRNA synthetase/Biotinyl protein ligase (BPL) and lipoyl protein ligase (LPL) / Helix Hairpins / 2-Layer Sandwich / Orthogonal Bundle / Mainly Alpha / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 3-(5-bromothiophen-2-yl)-L-alanine / ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE / Pyrrolysine--tRNA ligase類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | Methanosarcina mazei (古細菌) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 2.7143 Å |
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データ登録者 | Nakamura, A. / O'Donoghue, P. / Soll, D. |
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引用 | ジャーナル: Proc.Natl.Acad.Sci.USA / 年: 2014 タイトル: Polyspecific pyrrolysyl-tRNA synthetases from directed evolution. 著者: Guo, L.T. / Wang, Y.S. / Nakamura, A. / Eiler, D. / Kavran, J.M. / Wong, M. / Kiessling, L.L. / Steitz, T.A. / O'Donoghue, P. / Soll, D. |
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履歴 | 登録 | 2014年6月11日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 2014年11月12日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2014年11月26日 | Group: Database references |
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改定 1.2 | 2014年12月3日 | Group: Database references |
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改定 1.3 | 2023年9月27日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Other / Refinement description / Source and taxonomy カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / citation / database_2 / entity_src_gen / pdbx_database_status / pdbx_initial_refinement_model / pdbx_struct_assembly / pdbx_struct_assembly_prop / pdbx_struct_conn_angle / pdbx_struct_oper_list / refine_hist / struct_conn Item: _citation.journal_id_CSD / _database_2.pdbx_DOI ..._citation.journal_id_CSD / _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _entity_src_gen.pdbx_alt_source_flag / _pdbx_database_status.pdb_format_compatible / _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details / _pdbx_struct_assembly_prop.type / _pdbx_struct_assembly_prop.value / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id |
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