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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 4sgb | ||||||
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タイトル | STRUCTURE OF THE COMPLEX OF STREPTOMYCES GRISEUS PROTEINASE B AND POLYPEPTIDE CHYMOTRYPSIN INHIBITOR-1 FROM RUSSET BURBANK POTATO TUBERS AT 2.1 ANGSTROMS RESOLUTION | ||||||
要素 |
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キーワード | COMPLEX(SERINE PROTEINASE-INHIBITOR) | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 streptogrisin B / serine-type endopeptidase inhibitor activity / serine-type endopeptidase activity / proteolysis / extracellular region 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | Streptomyces griseus (ストレプトマイシン生産菌) | ||||||
手法 | X線回折 / 解像度: 2.1 Å | ||||||
データ登録者 | James, M. / Greenblatt, H. | ||||||
引用 | ジャーナル: J.Mol.Biol. / 年: 1989 タイトル: Structure of the complex of Streptomyces griseus proteinase B and polypeptide chymotrypsin inhibitor-1 from Russet Burbank potato tubers at 2.1 A resolution. 著者: Greenblatt, H.M. / Ryan, C.A. / James, M.N. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 4sgb.cif.gz | 60.3 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb4sgb.ent.gz | 42.7 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 4sgb.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
文書・要旨 | 4sgb_validation.pdf.gz | 391.2 KB | 表示 | wwPDB検証レポート |
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文書・詳細版 | 4sgb_full_validation.pdf.gz | 396 KB | 表示 | |
XML形式データ | 4sgb_validation.xml.gz | 6.9 KB | 表示 | |
CIF形式データ | 4sgb_validation.cif.gz | 10.7 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/sg/4sgb ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/sg/4sgb | HTTPS FTP |
-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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単位格子 |
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Atom site foot note | 1: RESIDUES PRO E 95 IS A CIS PROLINE. |
-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 18665.285 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) Streptomyces griseus (ストレプトマイシン生産菌) 参照: UniProt: P00777 | ||||||
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#2: タンパク質 | 分子量: 5509.348 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 参照: UniProt: P01080 | ||||||
#3: 化合物 | #4: 化合物 | ChemComp-CA / | #5: 水 | ChemComp-HOH / | 非ポリマーの詳細 | TWO SULFATE IONS HAVE BEEN IDENTIFIED. THERE ARE 180 SOLVENT POSITIONS. AMONG THESE, THE ONE AT ...TWO SULFATE IONS HAVE BEEN IDENTIFIED | |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: X線回折 |
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-試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.27 Å3/Da / 溶媒含有率: 45.93 % | ||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | *PLUS 温度: 292-296 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / PH range low: 7.2 / PH range high: 6.8 | ||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
反射 | *PLUS Num. measured all: 12941 |
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-解析
ソフトウェア | 名称: PROLSQ / 分類: 精密化 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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精密化 | 解像度: 2.1→8 Å /
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.1→8 Å
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拘束条件 |
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精密化 | *PLUS 最高解像度: 2.1 Å / 最低解像度: 8 Å / Num. reflection obs: 12685 / Rfactor obs: 0.142 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS |