+Open data
-Basic information
Entry | Database: PDB / ID: 4qnu | ||||||
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Title | Crystal structure of CmoB bound with Cx-SAM in P21212 | ||||||
Components | tRNA (mo5U34)-methyltransferase | ||||||
Keywords | TRANSFERASE / Structural Genomics / PSI-Biology / New York Structural Genomics Research Consortium / NYSGRC / Rossmannfold | ||||||
Function / homology | Function and homology information tRNA wobble uridine modification / transferase activity, transferring alkyl or aryl (other than methyl) groups / Transferases; Transferring alkyl or aryl groups, other than methyl groups / S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase activity Similarity search - Function | ||||||
Biological species | Escherichia coli (E. coli) | ||||||
Method | X-RAY DIFFRACTION / SYNCHROTRON / MOLECULAR REPLACEMENT / Resolution: 2.6 Å | ||||||
Authors | Kim, J. / Toro, R. / Bhosle, R. / Almo, S.C. / New York Structural Genomics Research Consortium (NYSGRC) | ||||||
Citation | Journal: Nucleic Acids Res. / Year: 2015 Title: Determinants of the CmoB carboxymethyl transferase utilized for selective tRNA wobble modification. Authors: Kim, J. / Xiao, H. / Koh, J. / Wang, Y. / Bonanno, J.B. / Thomas, K. / Babbitt, P.C. / Brown, S. / Lee, Y.S. / Almo, S.C. | ||||||
History |
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-Structure visualization
Structure viewer | Molecule: MolmilJmol/JSmol |
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-Downloads & links
-Download
PDBx/mmCIF format | 4qnu.cif.gz | 520.8 KB | Display | PDBx/mmCIF format |
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PDB format | pdb4qnu.ent.gz | 427.8 KB | Display | PDB format |
PDBx/mmJSON format | 4qnu.json.gz | Tree view | PDBx/mmJSON format | |
Others | Other downloads |
-Validation report
Summary document | 4qnu_validation.pdf.gz | 2.7 MB | Display | wwPDB validaton report |
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Full document | 4qnu_full_validation.pdf.gz | 2.7 MB | Display | |
Data in XML | 4qnu_validation.xml.gz | 92.3 KB | Display | |
Data in CIF | 4qnu_validation.cif.gz | 123.6 KB | Display | |
Arichive directory | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/qn/4qnu ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/qn/4qnu | HTTPS FTP |
-Related structure data
-Links
-Assembly
Deposited unit |
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Unit cell |
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Noncrystallographic symmetry (NCS) | NCS domain:
NCS domain segments: Component-ID: _ / Beg auth comp-ID: MET / Beg label comp-ID: MET / End auth comp-ID: PRO / End label comp-ID: PRO / Refine code: _ / Auth seq-ID: 1 - 323 / Label seq-ID: 1 - 323
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