登録情報 | データベース: PDB / ID: 4q9r |
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タイトル | Crystal structure of an RNA aptamer bound to trifluoroethyl-ligand analog in complex with Fab |
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要素 | - Fab BL3-6, HEAVY CHAIN
- Fab BL3-6, LIGHT CHAIN
- Spinach RNA aptamer
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キーワード | RNA/immune system / G-quadruplex / Fluorescence / Fluorophore / RNA-immune system complex |
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機能・相同性 | Immunoglobulins / Immunoglobulin-like / Sandwich / Mainly Beta / Chem-2ZY / : / RNA / RNA (> 10)機能・相同性情報 |
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生物種 | Mus musculus (ハツカネズミ) synthetic construct (人工物) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 3.12 Å |
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データ登録者 | Huang, H. / Suslov, N.B. / Li, N.-S. / Shelke, S.A. / Evans, M.E. / Koldobskaya, Y. / Rice, P.A. / Piccirilli, J.A. |
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引用 | ジャーナル: Nat.Chem.Biol. / 年: 2014 タイトル: A G-quadruplex-containing RNA activates fluorescence in a GFP-like fluorophore. 著者: Huang, H. / Suslov, N.B. / Li, N.S. / Shelke, S.A. / Evans, M.E. / Koldobskaya, Y. / Rice, P.A. / Piccirilli, J.A. |
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履歴 | 登録 | 2014年5月1日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 2014年6月18日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2014年7月9日 | Group: Database references |
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改定 1.2 | 2014年7月30日 | Group: Database references |
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改定 1.3 | 2014年10月15日 | Group: Structure summary |
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改定 2.0 | 2017年7月26日 | Group: Advisory / Atomic model ...Advisory / Atomic model / Database references / Derived calculations / Other / Polymer sequence / Source and taxonomy / Structure summary カテゴリ: atom_site / cell ...atom_site / cell / entity / entity_poly / entity_poly_seq / entity_src_gen / pdbx_entity_src_syn / pdbx_struct_assembly / pdbx_struct_assembly_gen / pdbx_struct_assembly_prop / pdbx_struct_oper_list / pdbx_struct_sheet_hbond / pdbx_unobs_or_zero_occ_residues / struct_conf / struct_conn / struct_ref / struct_ref_seq / struct_sheet_range Item: _atom_site.B_iso_or_equiv / _atom_site.Cartn_x ..._atom_site.B_iso_or_equiv / _atom_site.Cartn_x / _atom_site.Cartn_y / _atom_site.Cartn_z / _atom_site.auth_seq_id / _atom_site.label_entity_id / _atom_site.label_seq_id / _cell.Z_PDB / _entity_poly_seq.entity_id / _entity_poly_seq.num / _pdbx_entity_src_syn.entity_id / _pdbx_entity_src_syn.ncbi_taxonomy_id / _pdbx_entity_src_syn.organism_scientific / _pdbx_entity_src_syn.pdbx_beg_seq_num / _pdbx_entity_src_syn.pdbx_end_seq_num / _pdbx_struct_assembly_prop.biol_id / _pdbx_struct_assembly_prop.value / _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_seq_id / _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_seq_id / _struct_conf.beg_label_seq_id / _struct_conf.end_label_seq_id / _struct_ref_seq.db_align_beg / _struct_ref_seq.db_align_end / _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg / _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end / _struct_ref_seq.ref_id / _struct_ref_seq.seq_align_end / _struct_sheet_range.beg_label_seq_id / _struct_sheet_range.end_label_seq_id |
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