登録情報 | データベース: PDB / ID: 4pn2 |
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タイトル | Crystal structure of GH10 endo-b-1,4-xylanase (XynB) from Xanthomonas axonopodis pv citri complexed with xylotriose |
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要素 | Xylanase |
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キーワード | HYDROLASE / xylanase |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
endo-1,4-beta-xylanase activity / endo-1,4-beta-xylanase / xylan catabolic process / metal ion binding類似検索 - 分子機能 Glycoside hydrolase family 10 / Glycosyl hydrolases family 10 (GH10) domain profile. / Glycoside hydrolase family 10 domain / Glycosyl hydrolase family 10 / Glycosyl hydrolase family 10 / Glycosidases / Glycoside hydrolase superfamily / TIM Barrel / Alpha-Beta Barrel / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 |
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生物種 | Xanthomonas axonopodis pv. citri (バクテリア) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 解像度: 1.42 Å |
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データ登録者 | Santos, C.R. / Martins, V.P.M. / Zanphorlin, L.M. / Ruller, R. / Murakami, M.T. |
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資金援助 | ブラジル, 1件 組織 | 認可番号 | 国 |
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Sao Paulo Research Foundation (FAPESP) | 13/13309-0 | ブラジル |
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引用 | ジャーナル: J.Biol.Chem. / 年: 2014 タイトル: Molecular mechanisms associated with xylan degradation by xanthomonas plant pathogens. 著者: Santos, C.R. / Hoffmam, Z.B. / de Matos Martins, V.P. / Zanphorlin, L.M. / de Paula Assis, L.H. / Honorato, R.V. / Lopes de Oliveira, P.S. / Ruller, R. / Murakami, M.T. |
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履歴 | 登録 | 2014年5月22日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 2014年10月8日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2014年10月15日 | Group: Database references / Structure summary |
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改定 1.2 | 2014年11月26日 | Group: Database references |
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改定 1.3 | 2015年2月4日 | Group: Derived calculations |
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改定 1.4 | 2019年4月17日 | Group: Author supporting evidence / Data collection ...Author supporting evidence / Data collection / Database references / Derived calculations / Other / Source and taxonomy / Structure summary カテゴリ: citation / entity ...citation / entity / entity_src_gen / pdbx_audit_support / pdbx_database_status / pdbx_entity_nonpoly / pdbx_struct_assembly / pdbx_struct_conn_angle / pdbx_struct_oper_list / struct_keywords Item: _citation.journal_id_CSD / _entity.pdbx_description ..._citation.journal_id_CSD / _entity.pdbx_description / _entity_src_gen.pdbx_alt_source_flag / _pdbx_audit_support.funding_organization / _pdbx_database_status.pdb_format_compatible / _pdbx_entity_nonpoly.name / _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details / _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation / _struct_keywords.text |
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改定 1.5 | 2020年1月1日 | Group: Author supporting evidence / カテゴリ: pdbx_audit_support / Item: _pdbx_audit_support.funding_organization |
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改定 2.0 | 2020年7月29日 | Group: Advisory / Atomic model ...Advisory / Atomic model / Data collection / Derived calculations / Refinement description / Structure summary カテゴリ: atom_site / atom_site_anisotrop ...atom_site / atom_site_anisotrop / chem_comp / entity / pdbx_chem_comp_identifier / pdbx_entity_nonpoly / pdbx_struct_conn_angle / pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms / pdbx_validate_close_contact / refine_hist / struct_conn / struct_site / struct_site_gen Item: _atom_site.auth_atom_id / _atom_site.label_atom_id ..._atom_site.auth_atom_id / _atom_site.label_atom_id / _atom_site_anisotrop.pdbx_auth_atom_id / _atom_site_anisotrop.pdbx_label_atom_id / _chem_comp.name / _chem_comp.type / _entity.pdbx_description / _pdbx_entity_nonpoly.name / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.auth_atom_id / _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_atom_id / _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_1 / _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_2 / _refine_hist.number_atoms_total / _refine_hist.pdbx_number_atoms_nucleic_acid / _refine_hist.pdbx_number_atoms_protein / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id 解説: Carbohydrate remediation / Provider: repository / タイプ: Remediation |
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改定 2.1 | 2023年12月27日 | Group: Data collection / Database references / Structure summary カテゴリ: chem_comp / chem_comp_atom ...chem_comp / chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 Item: _chem_comp.pdbx_synonyms / _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession |
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