登録情報 | データベース: PDB / ID: 4nbd |
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タイトル | Carbazole-bound oxygenase with Phe275 replaced by Trp and ferredoxin complex of carbazole 1,9a-dioxygenase (form2) |
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要素 | - Ferredoxin CarAc
- Terminal oxygenase component of carbazole
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キーワード | OXIDOREDUCTASE / Rieske non-heme iron oxygenase / carbazole 1 / 9a-dioxygenase |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
carbazole catabolic process / ferredoxin hydrogenase activity / dioxygenase activity / 2 iron, 2 sulfur cluster binding / oxidoreductase activity / metal ion binding / cytoplasm類似検索 - 分子機能 N-terminal domain of TfIIb - #680 / Homotrimeric ring hydroxylase, catalytic domain / Homotrimeric ring hydroxylase / : / Naphthalene 1,2-dioxygenase Alpha Subunit; Chain A, domain 1 / Naphthalene 1,2-dioxygenase Alpha Subunit; Chain A, domain 1 / Rieske Iron-sulfur Protein / Rieske [2Fe-2S] iron-sulphur domain / N-terminal domain of TfIIb - #10 / 3-layer Sandwich ...N-terminal domain of TfIIb - #680 / Homotrimeric ring hydroxylase, catalytic domain / Homotrimeric ring hydroxylase / : / Naphthalene 1,2-dioxygenase Alpha Subunit; Chain A, domain 1 / Naphthalene 1,2-dioxygenase Alpha Subunit; Chain A, domain 1 / Rieske Iron-sulfur Protein / Rieske [2Fe-2S] iron-sulphur domain / N-terminal domain of TfIIb - #10 / 3-layer Sandwich / N-terminal domain of TfIIb / Rieske [2Fe-2S] iron-sulphur domain / Rieske [2Fe-2S] domain / Rieske [2Fe-2S] iron-sulfur domain profile. / Rieske [2Fe-2S] iron-sulphur domain superfamily / Single Sheet / Alpha-Beta Complex / Mainly Beta / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 9H-CARBAZOLE / : / FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER / Terminal oxygenase component of carbazole / Ferredoxin CarAc類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | Janthinobacterium (バクテリア)
Pseudomonas resinovorans (バクテリア) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 1.95 Å |
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データ登録者 | Ashikawa, Y. / Usami, Y. / Inoue, K. / Nojiri, H. |
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引用 | ジャーナル: Appl.Environ.Microbiol. / 年: 2014 タイトル: Structural basis of the divergent oxygenation reactions catalyzed by the rieske nonheme iron oxygenase carbazole 1,9a-dioxygenase. 著者: Inoue, K. / Usami, Y. / Ashikawa, Y. / Noguchi, H. / Umeda, T. / Yamagami-Ashikawa, A. / Horisaki, T. / Uchimura, H. / Terada, T. / Nakamura, S. / Shimizu, K. / Habe, H. / Yamane, H. / Fujimoto, Z. / Nojiri, H. |
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履歴 | 登録 | 2013年10月23日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: PDBJ |
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改定 1.0 | 2014年3月26日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2022年8月24日 | Group: Database references / Derived calculations カテゴリ: citation / database_2 ...citation / database_2 / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn / struct_ref_seq_dif / struct_site Item: _citation.journal_volume / _citation.page_first ..._citation.journal_volume / _citation.page_first / _citation.page_last / _citation.title / _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id |
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改定 1.2 | 2023年11月8日 | Group: Data collection / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond / pdbx_initial_refinement_model |
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