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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 4mis | ||||||
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タイトル | The structure of Brucella abortus PliC in the orthorombic crystal form | ||||||
![]() | Putative uncharacterized protein | ||||||
![]() | HYDROLASE INHIBITOR / ![]() | ||||||
機能・相同性 | C-type lysozyme inhibitor / Membrane-bound lysozyme-inhibitor of c-type lysozyme / C-type lysozyme inhibitor / C-type lysozyme inhibitor superfamily / ![]() ![]() ![]() ![]() | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Ha, N.C. / Um, S.H. / Kim, J.S. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Structural basis for the inhibition of human lysozyme by PliC from Brucella abortus 著者: Um, S.H. / Kim, J.S. / Kim, K. / Kim, N. / Cho, H.S. / Ha, N.C. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 46.9 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 36.8 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 10646.972 Da / 分子数: 2 / 断片: UNP residues 27-121 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() ![]() 株: 9-941 / 遺伝子: BruAb1_0462 / 発現宿主: ![]() ![]() ![]() #2: 水 | ChemComp-HOH / | ![]() |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 3.29 Å3/Da / 溶媒含有率: 62.56 % |
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結晶化![]() | 温度: 287.15 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 8.5 詳細: 1.9M ammonium sulfate, 0.1M Tris-HCl, 10% glycerol, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 287.15K |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K | |||||||||||||||
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() | |||||||||||||||
検出器 | タイプ: ADSC QUANTUM 315 / 検出器: CCD / 日付: 2012年12月16日 | |||||||||||||||
放射 | モノクロメーター: double mirrors / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray | |||||||||||||||
放射波長 | 波長![]() | |||||||||||||||
反射 | 解像度: 2→50 Å / Num. all: 19081 / Num. obs: 18850 / % possible obs: 96.1 % / Observed criterion σ(F): 0 / Observed criterion σ(I): 0 | |||||||||||||||
反射 シェル |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法![]() ![]()
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溶媒の処理 | 減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2→19.601 Å
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拘束条件 |
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LS精密化 シェル | Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION / Total num. of bins used: 7
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