登録情報 | データベース: PDB / ID: 4knw |
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タイトル | The crystal structure of human HDHD4 IN COMPLEX WITH MAGNESIUM AND THE PHOSPHATE MIMETIC VANADATE |
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要素 | N-acylneuraminate-9-phosphatase |
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キーワード | HYDROLASE / N-ACETYLNEURAMINATE / NEU5AC-9-PHOSPHATE / CARBOHYDRATE METABOLISM / N-ACETYLNEURAMINIC ACID PHOSPHATASE / NANP / HDHD4 |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
N-acylneuraminate-9-phosphatase / N-acetylglucosamine biosynthetic process / N-acylneuraminate-9-phosphatase activity / N-acetylneuraminate biosynthetic process / Sialic acid metabolism / cytosol類似検索 - 分子機能 Haloacid dehalogenase hydrolase-like domain / : / HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, CTE7 / Haloacid dehalogenase-like hydrolase / HAD hydrolase, subfamily IA / HAD superfamily/HAD-like / haloacid dehalogenase-like hydrolase / Four Helix Bundle (Hemerythrin (Met), subunit A) / HAD superfamily / HAD-like superfamily ...Haloacid dehalogenase hydrolase-like domain / : / HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, CTE7 / Haloacid dehalogenase-like hydrolase / HAD hydrolase, subfamily IA / HAD superfamily/HAD-like / haloacid dehalogenase-like hydrolase / Four Helix Bundle (Hemerythrin (Met), subunit A) / HAD superfamily / HAD-like superfamily / Up-down Bundle / Rossmann fold / 3-Layer(aba) Sandwich / Mainly Alpha / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 VANADATE ION / N-acylneuraminate-9-phosphatase類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | Homo sapiens (ヒト) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 2.699 Å |
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データ登録者 | Klei, H.E. |
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引用 | ジャーナル: Bioorg.Med.Chem.Lett. / 年: 2013 タイトル: Design, synthesis, functional and structural characterization of an inhibitor of N-acetylneuraminate-9-phosphate phosphatase: Observation of extensive dynamics in an enzyme/inhibitor complex. 著者: Kim, S.H. / Constantine, K.L. / Duke, G.J. / Goldfarb, V. / Hunt, J.T. / Johnson, S. / Kish, K. / Klei, H.E. / McDonnell, P.A. / Metzler, W.J. / Mueller, L. / Poss, M.A. / Fairchild, C.R. / Bhide, R.S. |
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履歴 | 登録 | 2013年5月10日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 2013年6月26日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2013年7月10日 | Group: Database references |
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改定 1.2 | 2019年7月17日 | Group: Data collection / Refinement description / カテゴリ: software Item: _software.contact_author / _software.contact_author_email ..._software.contact_author / _software.contact_author_email / _software.language / _software.location / _software.name / _software.type / _software.version |
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改定 1.3 | 2023年9月20日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn / struct_ref_seq_dif / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id |
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