登録情報 | データベース: PDB / ID: 4jjh |
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タイトル | Crystal structure of the D1 domain from human Nectin-4 extracellular fragment [PSI-NYSGRC-005624] |
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要素 | Poliovirus receptor-related protein 4 |
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キーワード | CELL ADHESION / Nectin-4 / Ig-like D1 domain / Ig superfamily / IMMUNE SYSTEM / Structural genomics / PSI-Biology / New York Structural Genomics Research Consortium / NYSGRC / Atoms-to-Animals: The Immune Function Network / IFN |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
Nectin/Necl trans heterodimerization / Adherens junctions interactions / heterophilic cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules / homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules / adherens junction / virus receptor activity / extracellular exosome / identical protein binding / plasma membrane類似検索 - 分子機能 : / Nectin-4 / CD80-like, immunoglobulin C2-set / CD80-like C2-set immunoglobulin domain / Immunoglobulin domain / Immunoglobulin subtype 2 / Immunoglobulin C-2 Type / Immunoglobulin V-set domain / Immunoglobulin V-set domain / Immunoglobulin subtype ...: / Nectin-4 / CD80-like, immunoglobulin C2-set / CD80-like C2-set immunoglobulin domain / Immunoglobulin domain / Immunoglobulin subtype 2 / Immunoglobulin C-2 Type / Immunoglobulin V-set domain / Immunoglobulin V-set domain / Immunoglobulin subtype / Immunoglobulin / Ig-like domain profile. / Immunoglobulin-like domain / Immunoglobulin-like domain superfamily / Immunoglobulins / Immunoglobulin-like fold / Immunoglobulin-like / Sandwich / Mainly Beta類似検索 - ドメイン・相同性 |
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生物種 | Homo sapiens (ヒト) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 2.25 Å |
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データ登録者 | Kumar, P.R. / Bonanno, J. / Ahmed, M. / Banu, R. / Bhosle, R. / Calarese, D. / Celikigil, A. / Chamala, S. / Chan, M.K. / Chowdhury, S. ...Kumar, P.R. / Bonanno, J. / Ahmed, M. / Banu, R. / Bhosle, R. / Calarese, D. / Celikigil, A. / Chamala, S. / Chan, M.K. / Chowdhury, S. / Fiser, A. / Garforth, S. / Glenn, A.S. / Hillerich, B. / Khafizov, K. / Love, J. / Patel, H. / Seidel, R. / Stead, M. / Toro, R. / Nathenson, S.G. / Almo, S.C. / New York Structural Genomics Research Consortium (NYSGRC) / Atoms-to-Animals: The Immune Function Network (IFN) |
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引用 | ジャーナル: to be published タイトル: Crystal structure of the D1 domain of human Nectin-4 extracellular fragment [NYSGRC-005624] 著者: Kumar, P.R. / Nathenson, S.G. / Almo, S.C. / New York Structural Genomics Research Consortium (NYSGRC) / Atoms-to-Animals: The Immune Function Network (IFN) |
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履歴 | 登録 | 2013年3月7日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 2013年3月27日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2013年11月27日 | Group: Structure summary |
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改定 1.2 | 2017年11月15日 | Group: Refinement description / カテゴリ: software Item: _software.classification / _software.contact_author ..._software.classification / _software.contact_author / _software.contact_author_email / _software.date / _software.language / _software.location / _software.name / _software.type / _software.version |
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改定 1.3 | 2023年9月20日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / struct_ref_seq_dif / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id |
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