解像度: 3.1→3.26 Å / 冗長度: 22.3 % / Rmerge(I) obs: 0.265 / Mean I/σ(I) obs: 3.3 / Num. unique all: 2427 / Rsym value: 0.265 / % possible all: 100
-
解析
ソフトウェア
名称
バージョン
分類
xaloc
beamline
データ収集
MOLREP
位相決定
REFMAC
5.6.0117
精密化
XDS
データ削減
SCALA
データスケーリング
精密化
構造決定の手法: 単一同系置換・異常分散 / 解像度: 3.1→47.07 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.953 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.941 / SU B: 27.984 / SU ML: 0.243 / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 2 / ESU R: 0.639 / ESU R Free: 0.328 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD / 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN USED IF PRESENT IN THE INPUT
Rfactor
反射数
%反射
Selection details
Rfree
0.22686
1332
7.8 %
RANDOM
Rwork
0.18648
-
-
-
all
0.18962
16969
-
-
obs
0.18648
15637
99.92 %
-
溶媒の処理
イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å / 溶媒モデル: MASK
原子変位パラメータ
Biso mean: 96.074 Å2
精密化ステップ
サイクル: LAST / 解像度: 3.1→47.07 Å
タンパク質
核酸
リガンド
溶媒
全体
原子数
3187
0
0
18
3205
拘束条件
Refine-ID
タイプ
Dev ideal
Dev ideal target
数
X-RAY DIFFRACTION
r_bond_refined_d
0.015
0.02
3263
X-RAY DIFFRACTION
r_angle_refined_deg
1.711
1.963
4378
X-RAY DIFFRACTION
r_dihedral_angle_1_deg
5.744
5
375
X-RAY DIFFRACTION
r_dihedral_angle_2_deg
39.226
24.101
178
X-RAY DIFFRACTION
r_dihedral_angle_3_deg
23.887
15
612
X-RAY DIFFRACTION
r_dihedral_angle_4_deg
18.057
15
18
X-RAY DIFFRACTION
r_chiral_restr
0.108
0.2
442
X-RAY DIFFRACTION
r_gen_planes_refined
0.009
0.02
2500
LS精密化 シェル
解像度: 3.1→3.181 Å / Total num. of bins used: 20
Rfactor
反射数
%反射
Rfree
0.287
78
-
Rwork
0.296
1037
-
obs
-
-
100 %
精密化 TLS
手法: refined / Origin x: 8.129 Å / Origin y: 42.168 Å / Origin z: 2.106 Å