+Open data
-Basic information
Entry | Database: PDB / ID: 4i52 | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
Title | scMenB im complex with 1-hydroxy-2-naphthoyl-CoA | ||||||
Components | Naphthoate synthase | ||||||
Keywords | LYASE / crotonase / 1 / 4-dihydroxy-2-naphthoyl coenzyme A synthase | ||||||
Function / homology | Function and homology information 1,4-dihydroxy-2-naphthoyl-CoA synthase / 1,4-dihydroxy-2-naphthoyl-CoA synthase activity / phylloquinone biosynthetic process / menaquinone biosynthetic process / cytosol Similarity search - Function | ||||||
Biological species | Synechocystis sp. (bacteria) | ||||||
Method | X-RAY DIFFRACTION / SYNCHROTRON / MOLECULAR REPLACEMENT / Resolution: 2.35 Å | ||||||
Authors | Song, H.G. / Sun, Y.R. / Li, J. / Li, Y. / Jiang, M. / Zhou, J.H. / Guo, Z.H. | ||||||
Citation | Journal: Plos One / Year: 2013 Title: Structural basis of the induced-fit mechanism of 1,4-dihydroxy-2-naphthoyl coenzyme a synthase from the crotonase fold superfamily Authors: Sun, Y. / Song, H. / Li, J. / Li, Y. / Jiang, M. / Zhou, J. / Guo, Z. | ||||||
History |
|
-Structure visualization
Structure viewer | Molecule: MolmilJmol/JSmol |
---|
-Downloads & links
-Download
PDBx/mmCIF format | 4i52.cif.gz | 493.2 KB | Display | PDBx/mmCIF format |
---|---|---|---|---|
PDB format | pdb4i52.ent.gz | 404 KB | Display | PDB format |
PDBx/mmJSON format | 4i52.json.gz | Tree view | PDBx/mmJSON format | |
Others | Other downloads |
-Validation report
Summary document | 4i52_validation.pdf.gz | 2.3 MB | Display | wwPDB validaton report |
---|---|---|---|---|
Full document | 4i52_full_validation.pdf.gz | 2.3 MB | Display | |
Data in XML | 4i52_validation.xml.gz | 99.6 KB | Display | |
Data in CIF | 4i52_validation.cif.gz | 126.5 KB | Display | |
Arichive directory | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/i5/4i52 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/i5/4i52 | HTTPS FTP |
-Related structure data
Related structure data | 4i42C 4i4zC 4emlS S: Starting model for refinement C: citing same article (ref.) |
---|---|
Similar structure data |
-Links
-Assembly
Deposited unit |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2 |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3 |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Unit cell |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Components on special symmetry positions |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Noncrystallographic symmetry (NCS) | NCS domain:
|