登録情報 データベース : PDB / ID : 4h2k 構造の表示 ダウンロードとリンクタイトル Crystal structure of the catalytic domain of succinyl-diaminopimelate desuccinylase from Haemophilus influenzae 要素Succinyl-diaminopimelate desuccinylase 詳細 キーワード HYDROLASE / DapE / MCSG / PSI-Biology / Structural Genomics / Midwest Center for Structural Genomics / Zinc-dependent hydrolase機能・相同性 機能・相同性情報分子機能 ドメイン・相同性 構成要素
succinyl-diaminopimelate desuccinylase / succinyl-diaminopimelate desuccinylase activity / diaminopimelate biosynthetic process / lysine biosynthetic process via diaminopimelate / cobalt ion binding / zinc ion binding / cytosol 類似検索 - 分子機能 : / Succinyl-diaminopimelate desuccinylase, proteobacteria / ArgE / dapE / ACY1 / CPG2 / yscS family signature 1. / ArgE / dapE / ACY1 / CPG2 / yscS family signature 2. / ArgE/DapE/ACY1/CPG2/YscS, conserved site / Peptidase M20, dimerisation domain / Bacterial exopeptidase dimerisation domain / Peptidase dimerisation domain / Peptidase M20 / Peptidase family M20/M25/M40 ... : / Succinyl-diaminopimelate desuccinylase, proteobacteria / ArgE / dapE / ACY1 / CPG2 / yscS family signature 1. / ArgE / dapE / ACY1 / CPG2 / yscS family signature 2. / ArgE/DapE/ACY1/CPG2/YscS, conserved site / Peptidase M20, dimerisation domain / Bacterial exopeptidase dimerisation domain / Peptidase dimerisation domain / Peptidase M20 / Peptidase family M20/M25/M40 / Zn peptidases / Aminopeptidase / 3-Layer(aba) Sandwich / Alpha Beta 類似検索 - ドメイン・相同性生物種 Haemophilus influenzae (インフルエンザ菌)手法 X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度 : 1.84 Å 詳細データ登録者 Nocek, B. / Jedrzejczak, R. / Makowska-Grzyska, M. / Starus, A. / Holz, R. / Joachimiak, A. / Midwest Center for Structural Genomics (MCSG) 引用ジャーナル : Plos One / 年 : 2014タイトル : The dimerization domain in DapE enzymes is required for catalysis.著者 : Nocek, B. / Starus, A. / Makowska-Grzyska, M. / Gutierrez, B. / Sanchez, S. / Jedrzejczak, R. / Mack, J.C. / Olsen, K.W. / Joachimiak, A. / Holz, R.C. 履歴 登録 2012年9月12日 登録サイト : RCSB / 処理サイト : RCSB改定 1.0 2012年11月21日 Provider : repository / タイプ : Initial release改定 1.1 2015年8月26日 Group : Database references改定 1.2 2017年8月16日 Group : Refinement description / Source and taxonomy / カテゴリ : entity_src_gen / software改定 1.3 2023年9月20日 Group : Data collection / Database references ... Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ : chem_comp_atom / chem_comp_bond ... chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn / struct_ref_seq_dif / struct_site Item : _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ... _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id
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