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データを開く
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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 4gm5 | ||||||
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タイトル | Carboxypeptidase T with Sulphamoil Arginine | ||||||
![]() | Carboxypeptidase T | ||||||
![]() | HYDROLASE/HYDROLASE inhibitor / Zinc carboxypeptidase / HYDROLASE-HYDROLASE inhibitor complex | ||||||
機能・相同性 | ![]() carboxypeptidase T / metallocarboxypeptidase activity / proteolysis / extracellular space / zinc ion binding 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Kuznetsov, S.A. / Timofeev, V.I. / Akparov, V.K. / Kuranova, I.P. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Carboxypeptidase T with Sulphamoil Arginine 著者: Kuznetsov, S.A. / Timofeev, V.I. / Akparov, V.K. / Kuranova, I.P. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 175.5 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 148.3 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 796.1 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 802.2 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 21.2 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 31.8 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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2 | ![]()
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単位格子 |
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Components on special symmetry positions |
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要素
-タンパク質 , 1種, 1分子 A
#1: タンパク質 | 分子量: 36641.277 Da / 分子数: 1 / 断片: unp residues 99-421 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() 遺伝子: cpt / 発現宿主: ![]() ![]() |
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-非ポリマー , 6種, 435分子 ![](data/chem/img/ZN.gif)
![](data/chem/img/CA.gif)
![](data/chem/img/SO4.gif)
![](data/chem/img/0X9.gif)
![](data/chem/img/GOL.gif)
![](data/chem/img/HOH.gif)
![](data/chem/img/CA.gif)
![](data/chem/img/SO4.gif)
![](data/chem/img/0X9.gif)
![](data/chem/img/GOL.gif)
![](data/chem/img/HOH.gif)
#2: 化合物 | ChemComp-ZN / | ||||||||
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#3: 化合物 | ChemComp-CA / #4: 化合物 | ChemComp-SO4 / #5: 化合物 | ChemComp-0X9 / | #6: 化合物 | ChemComp-GOL / #7: 水 | ChemComp-HOH / | |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 5.17 Å3/Da / 溶媒含有率: 76.19 % |
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-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K |
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
検出器 | タイプ: MARMOSAIC 225 mm CCD / 検出器: CCD |
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 0.8 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 1.388→26.95 Å / Num. all: 152576 / Num. obs: 151202 / % possible obs: 99.1 % / 冗長度: 4.97 % / Rmerge(I) obs: 0.067 / Net I/σ(I): 15.7916 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]()
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溶媒の処理 | イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å / 溶媒モデル: MASK | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | Biso mean: 17.129 Å2
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 1.39→20 Å
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拘束条件 |
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LS精密化 シェル | 解像度: 1.388→1.424 Å / Total num. of bins used: 20
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