PDB-4g8t: Crystal structure of a glucarate dehydratase related protein, fro...

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 4g8t

タイトル

Crystal structure of a glucarate dehydratase related protein, from actinobacillus succinogenes, target EFI-502312, with sodium and sulfate bound, ordered loop

要素

Glucarate dehydratase

キーワード

LYASE / ENOLASE / putative glucarate dehydratase / enzyme function initiative / EFI / Structural Genomics

機能・相同性

機能・相同性情報

glucarate dehydratase activity / D-glucarate catabolic process / glucarate dehydratase / magnesium ion binding
類似検索 - 分子機能

生物種

Actinobacillus succinogenes (バクテリア)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 1.7 Å

データ登録者

Vetting, M.W. / Toro, R. / Bhosle, R. / Al Obaidi, N.F. / Morisco, L.L. / Wasserman, S.R. / Sojitra, S. / Washington, E. / Scott Glenn, A. / Chowdhury, S. ...

引用

ジャーナル: TO BE PUBLISHED
タイトル: Crystal structure of a glucarate dehydratase related protein, from actinobacillus succinogenes, target efi-502312, with sodium and sulfate bound, ordered loop
著者: Vetting, M.W. / Toro, R. / Bhosle, R. / Al Obaidi, N.F. / Morisco, L.L. / Wasserman, S.R. / Sojitra, S. / Washington, E. / Scott Glenn, A. / Chowdhury, S. / Evans, B. / Hammonds, J. / ...

履歴

登録	2012年7月23日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.0	2012年8月15日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2023年9月13日	Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn / struct_ref_seq_dif / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

-
ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	4g8t.cif.gz	724.9 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb4g8t.ent.gz	597.4 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	4g8t.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

-
検証レポート

文書・要旨	4g8t_validation.pdf.gz	509.6 KB	表示	wwPDB検証レポート
文書・詳細版	4g8t_full_validation.pdf.gz	517.3 KB	表示
XML形式データ	4g8t_validation.xml.gz	80.5 KB	表示
CIF形式データ	4g8t_validation.cif.gz	121.3 KB	表示
アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/g8/4g8t ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/g8/4g8t	HTTPS FTP

-
関連構造データ

関連構造データ	1ec7S S: 精密化の開始モデル
類似構造データ	3pwi-1 3pwi-2 3nxl-1 3nfu-d 3nxl-2 3pwg-2 4jx2-d 3doc-2 3mzn-d 3pfr-2 Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索
その他のデータベース	TargetTrack: EFI-502312

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リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI
「今月の分子」の関連する項目	#127 - 2010年7月クリスタリン (Crystallins) 類似性 (2) #89 - 2007年5月アコニターゼと鉄調節タンパク質１ (Aconitase and Iron Regulatory Protein 1) 類似性 (2) #92 - 2007年8月タンパク質同化性ステロイド (Anabolic Steroids) 類似性 (1) #50 - 2004年2月解糖系酵素 (Glycolytic Enzymes) 類似性 (2) #174 - 2014年6月 GFP様タンパク質 (GFP-like Proteins) 類似性 (1)

PDBのページ

PDBj /

wwPDB /

NCBI

「今月の分子」の関連する項目

#127 - 2010年7月
クリスタリン (Crystallins)
類似性 (2)
#89 - 2007年5月
アコニターゼと鉄調節タンパク質１ (Aconitase and Iron Regulatory Protein 1)
類似性 (2)
#92 - 2007年8月
タンパク質同化性ステロイド (Anabolic Steroids)
類似性 (1)
#50 - 2004年2月
解糖系酵素 (Glycolytic Enzymes)
類似性 (2)
#174 - 2014年6月
GFP様タンパク質 (GFP-like Proteins)
類似性 (1)

登録構造単位

A: Glucarate dehydratase

B: Glucarate dehydratase

C: Glucarate dehydratase

D: Glucarate dehydratase

ヘテロ分子

208 kDa, 4 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

1

A: Glucarate dehydratase

B: Glucarate dehydratase

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
104 kDa, 2 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

2

C: Glucarate dehydratase

D: Glucarate dehydratase

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
104 kDa, 2 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

単位格子

Length a, b, c (Å)	110.837, 124.854, 139.093
Angle α, β, γ (deg.)	90.00, 90.00, 90.00
Int Tables number	19
Space group name H-M	P2₁2₁2₁

-
タンパク質 , 1種, 4分子 ABCD

#1: タンパク質	Glucarate dehydratase 分子量: 51460.277 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) Actinobacillus succinogenes (バクテリア) 株: 130Z / 遺伝子: Asuc_1847 / プラスミド: pET / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 株 (発現宿主): BL21(DE3) / 参照: UniProt: A6VQF1, glucarate dehydratase

-
非ポリマー , 6種, 1992分子

#2: 化合物	ChemComp-SO4 / SULFATE ION / 硫酸ジアニオン分子量: 96.063 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 合成 / 式: SO₄
#3: 化合物	ChemComp-NA / SODIUM ION / ナトリウムカチオン分子量: 22.990 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 合成 / 式: Na
#4: 化合物	ChemComp-GOL / GLYCEROL / GLYCERIN / PROPANE-1,2,3-TRIOL / グリセロ-ル分子量: 92.094 Da / 分子数: 7 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₃H₈O₃
#5: 化合物	ChemComp-DTU / (2R,3S)-1,4-DIMERCAPTOBUTANE-2,3-DIOL / ジチオエリトリト-ル分子量: 154.251 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₄H₁₀O₂S₂
#6: 化合物	ChemComp-DTT / 2,3-DIHYDROXY-1,4-DITHIOBUTANE / 1,4-DITHIOTHREITOL / L-DTT 分子量: 154.251 Da / 分子数: 3 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₄H₁₀O₂S₂
#7: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 1973 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.34 Å³/Da / 溶媒含有率: 47.39 %
結晶化	温度: 298 K / 手法: sitting drop vapor diffuction / pH: 7.5 詳細: Protein (10 mM Hepes pH 7.5, 150 mM NaCl, 10% glycerol, 1 mM DTT, 5 mM MgCl); Reservoir (0.2 M Lithium Sulfate, 0.1 M Sodium Acetate, 0.1 M HEPES, 25% PEG4000); Cryoprotection (Reservoir, + ...詳細: Protein (10 mM Hepes pH 7.5, 150 mM NaCl, 10% glycerol, 1 mM DTT, 5 mM MgCl); Reservoir (0.2 M Lithium Sulfate, 0.1 M Sodium Acetate, 0.1 M HEPES, 25% PEG4000); Cryoprotection (Reservoir, + 20% glycerol and 50 mM MgCl), sitting drop vapor diffuction, temperature 298K

結晶

マシュー密度: 2.34 Å³/Da / 溶媒含有率: 47.39 %

結晶化

温度: 298 K / 手法: sitting drop vapor diffuction / pH: 7.5
詳細: Protein (10 mM Hepes pH 7.5, 150 mM NaCl, 10% glycerol, 1 mM DTT, 5 mM MgCl); Reservoir (0.2 M Lithium Sulfate, 0.1 M Sodium Acetate, 0.1 M HEPES, 25% PEG4000); Cryoprotection (Reservoir, + ...

-
データ収集

回折

平均測定温度: 100 K

放射光源

由来:

シンクロトロン / サイト:

APS

/ ビームライン: 31-ID / 波長: 0.9793 Å

検出器

タイプ: RAYONIX MX225HE / 検出器: CCD / 日付: 2012年1月1日 / 詳細: MIRRORS

放射

モノクロメーター: GRAPHITE / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray

放射波長

波長: 0.9793 Å / 相対比: 1

反射

解像度: 1.7→139.093 Å / Num. all: 210738 / Num. obs: 210738 / % possible obs: 99.7 % / Observed criterion σ(F): 0 / Observed criterion σ(I): 0 / 冗長度: 6.9 % / R_merge(I) obs: 0.112 / R_sym value: 0.112 / Net I/σ(I): 9.2

反射シェル

Diffraction-ID: 1

解像度 (Å)	冗長度 (%)	R_merge(I) obs	Mean I/σ(I) obs	Num. measured all	Num. unique all	R_sym value	% possible all
1.7-1.79	6.4	0.531	1.4	195168	30329	0.531	99.1
1.79-1.9	6.5	0.374	2	186295	28789	0.374	99.5
1.9-2.03	6.6	0.258	2.8	179412	27234	0.258	99.8
2.03-2.19	6.8	0.19	3.6	172835	25413	0.19	99.9
2.19-2.4	7	0.162	4.1	164855	23423	0.162	99.9
2.4-2.69	7.2	0.156	4	153039	21258	0.156	100
2.69-3.1	7.4	0.139	4.5	139326	18832	0.139	100
3.1-3.8	7.5	0.089	7	119861	15999	0.089	100
3.8-5.38	7.4	0.059	11	92764	12496	0.059	100
5.38-28.477	7	0.043	15	48692	6965	0.043	98.2

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
SCALA	3.3.16	データスケーリング
PHENIX	1.7.3_928	精密化
PDB_EXTRACT	3.11	データ抽出
MOSFLM		データ削減
PHENIX		位相決定

精密化

構造決定の手法:

分子置換
開始モデル: 1EC7

1ec7

解像度: 1.7→28.477 Å / Occupancy max: 1 / Occupancy min: 0.39 / FOM work R set: 0.8816 / SU ML: 0.17 / σ(F): 0 / σ(I): 0 / 位相誤差: 18.34 / 立体化学のターゲット値: ML

	R_factor	反射数	%反射	Selection details
R_free	0.1791	10561	5.03 %	RANDOM
R_work	0.1521	-	-	-
all	0.1535	210083	-	-
obs	0.1535	210083	99.4 %	-

溶媒の処理

減衰半径: 1.11 Å / VDWプローブ半径: 1.3 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL / B_sol: 37.942 Å² / k_sol: 0.351 e/Å³

原子変位パラメータ

B_iso max: 124.53 Å² / B_iso mean: 22.9951 Å² / B_iso min: 8.2 Å²

	B_aniso -1	B_aniso -2	B_aniso -3
1-	9.727 Å²	0 Å²	-0 Å²
2-	-	-2.7479 Å²	-0 Å²
3-	-	-	-6.979 Å²

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 1.7→28.477 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	13696	0	98	1973	15767

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	数
X-RAY DIFFRACTION	f_bond_d	0.011	14296
X-RAY DIFFRACTION	f_angle_d	1.005	19395
X-RAY DIFFRACTION	f_chiral_restr	0.071	2102
X-RAY DIFFRACTION	f_plane_restr	0.004	2539
X-RAY DIFFRACTION	f_dihedral_angle_d	12.929	5248

LS精密化シェル

Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION / Total num. of bins used: 30

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	R_factor R_work	Num. reflection R_work	Num. reflection all	% reflection obs (%)
1.7-1.7193	0.2432	343	0.2127	6499	6842	99
1.7193-1.7395	0.2623	352	0.208	6578	6930	99
1.7395-1.7607	0.2466	332	0.1993	6568	6900	99
1.7607-1.783	0.232	359	0.1988	6554	6913	99
1.783-1.8065	0.2402	348	0.1886	6530	6878	99
1.8065-1.8312	0.2126	352	0.1773	6564	6916	99
1.8312-1.8574	0.2315	365	0.1759	6608	6973	99
1.8574-1.8851	0.2055	361	0.1693	6534	6895	99
1.8851-1.9146	0.2206	339	0.1701	6577	6916	99
1.9146-1.9459	0.2034	332	0.1618	6637	6969	99
1.9459-1.9795	0.2112	359	0.1615	6614	6973	99
1.9795-2.0155	0.204	347	0.1563	6635	6982	100
2.0155-2.0542	0.1994	348	0.1521	6610	6958	100
2.0542-2.0961	0.1959	330	0.1552	6655	6985	100
2.0961-2.1417	0.1796	382	0.1547	6612	6994	100
2.1417-2.1915	0.1875	357	0.1543	6637	6994	100
2.1915-2.2463	0.1891	349	0.153	6610	6959	100
2.2463-2.307	0.1897	362	0.1498	6652	7014	100
2.307-2.3749	0.1745	356	0.1489	6629	6985	100
2.3749-2.4515	0.1808	322	0.1484	6685	7007	100
2.4515-2.539	0.1781	351	0.156	6673	7024	100
2.539-2.6406	0.1976	341	0.1545	6682	7023	100
2.6406-2.7607	0.1929	363	0.1524	6663	7026	100
2.7607-2.9061	0.1816	338	0.1566	6707	7045	100
2.9061-3.088	0.1773	374	0.1566	6704	7078	100
3.088-3.3261	0.1531	352	0.1421	6718	7070	100
3.3261-3.6602	0.163	368	0.139	6755	7123	100
3.6602-4.1884	0.1332	382	0.123	6762	7144	100
4.1884-5.2715	0.1458	343	0.1289	6871	7214	100
5.2715-28.4809	0.1685	354	0.1649	6999	7353	99

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	0.706	-0.1544	0.0097	1.0359	-0.2062	0.6421	-0.0317	-0.0927	-0.021	0.1487	0.0659	0.2463	0.0747	-0.2825	-0.0364	0.1569	-0.0752	0.0376	0.2318	-0.0241	0.1684	5.072	-12.547	41.0493
2	0.7556	-0.1416	0.1406	1.1794	-0.428	1.2981	-0.059	-0.0939	0.0775	0.2199	0.0279	0.0724	-0.0028	-0.1481	0.0176	0.1382	-0.0304	0.0407	0.1969	-0.0545	0.1328	7.3415	2.3848	40.6632
3	0.5315	-0.4216	0.1833	0.6854	-0.2402	0.684	-0.027	-0.0375	0.0274	0.0516	0.0235	0.0579	0.0795	-0.1177	0.0006	0.1221	-0.0775	0.0089	0.1547	-0.0211	0.1198	12.8096	-11.416	33.947
4	0.8674	0.1361	-0.1572	0.1054	0.1317	0.6145	-0.0566	-0.0723	-0.3878	-0.1589	0.026	0.0224	0.6662	-0.0507	-0.2193	0.3495	-0.1941	-0.0127	0.0575	-0.0406	0.1681	17.9173	-35.0796	33.9352
5	1.0543	0.2948	0.0647	1.1476	0.3136	1.2856	0.0055	0.1148	-0.1268	-0.1659	-0.0334	-0.1403	0.2562	0.0868	0.0451	0.2283	-0.0053	0.0219	0.1243	-0.0026	0.1659	33.3645	-26.1263	29.9523
6	0.5929	0.2396	0.0788	0.4862	0.0295	0.3536	-0.0156	0.0221	-0.0099	-0.008	0.0031	0.0061	0.1257	-0.0673	0.0098	0.12	-0.0328	-0.0033	0.1125	-0.0191	0.1043	25.7953	-12.0651	28.8309
7	0.3527	0.1246	-0.3129	0.4635	-0.0548	0.291	0.0039	0.0884	-0.1125	-0.1187	0.009	0.2386	0.2195	-0.3091	0.1152	0.1775	-0.1667	-0.0216	0.1993	-0.0335	0.1514	7.8046	-21.9609	28.5037
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9	0.4241	0.0532	-0.1634	0.7574	-0.2933	0.8238	0.0446	-0.1726	-0.0393	0.2128	-0.0234	0.0114	0.1812	-0.0555	-0.0215	0.2439	-0.041	-0.005	0.1754	-0.0105	0.1265	24.5745	-25.3464	50.3015
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11	0.5754	0.2967	-0.0854	0.7977	-0.1849	0.2723	-0.1023	0.0888	0.101	-0.1871	0.0943	0.2589	0.0622	-0.2516	-0.0338	0.1105	-0.0162	-0.0583	0.2265	-0.0143	0.1637	6.1245	12.7641	5.0273
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14	0.5084	0.0539	-0.1539	0.6263	-0.0064	1.2638	-0.0319	0.0202	0.194	0.0077	-0.0057	0.0086	-0.3444	-0.0037	0.029	0.2283	-0.003	-0.0358	0.1098	-0.0115	0.1983	29.133	36.1161	13.3271
15	0.6764	0.0051	0.0976	1.1273	0.3903	1.3715	-0.025	-0.0404	0.0903	0.0613	-0.0214	-0.1937	-0.1126	0.1487	0.0169	0.0964	-0.0134	-0.0385	0.0874	0.0009	0.1396	40.9285	22.6349	17.0534
16	0.2971	-0.1448	-0.0168	0.5685	-0.0056	0.4327	-0.014	-0.0046	0.0195	-0.0134	0.0022	-0.0109	0.0116	-0.0135	0.012	0.0742	-0.0006	-0.0125	0.0979	-0.0176	0.1083	29.5834	11.6386	17.9736
17	0.5179	0.0476	0.3018	0.7255	-0.1926	0.606	-0.0296	-0.1344	0.0948	0.1046	0.029	0.2314	-0.1549	-0.2543	-0.0472	0.0997	0.0348	-0.0078	0.1584	-0.0317	0.1776	15.6916	26.8104	18.826
18	0.4893	0.1263	-0.4176	0.5866	-0.4988	2.2554	-0.0307	0.0723	0.146	-0.0641	0.1202	0.3553	-0.2581	-0.5505	0.0115	0.1214	0.0366	-0.0728	0.2772	-0.0023	0.2537	4.309	24.5351	9.4131
19	0.9545	0.1755	-0.008	1.1261	-0.3387	1.2643	-0.0242	0.1538	0.0656	-0.3224	-0.0222	-0.0107	-0.1296	-0.0158	0.0295	0.1679	-0.0061	-0.0128	0.1257	-0.0009	0.1135	32.1862	24.9537	-3.3647
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21	0.5608	0.142	0.3539	0.7816	-0.0091	1.7947	-0.0146	0.1453	0.1823	-0.2773	-0.0048	-0.1042	-0.4019	0.2563	-0.0519	0.2746	0.0022	0.1334	0.2109	0.0381	0.2302	73.7653	1.4672	7.992
22	0.7381	0.2749	0.5128	0.4392	0.3709	0.8933	0.0032	0.0764	0.1144	-0.3625	-0.0105	-0.1393	-0.0572	0.1035	-0.0305	0.2162	0.0696	0.0533	0.1282	0.0039	0.1343	63.5774	-11.4866	6.7107
23	0.1042	0.0844	0.1642	0.6921	0.0437	0.6201	0.1067	0.0785	-0.1578	-0.5307	0.0214	0.1315	0.4458	-0.1424	0.1968	0.371	0.1112	0.0368	0.018	-0.0852	0.054	48.6657	-26.1489	-3.4154
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25	0.7274	0.13	-0.2775	0.3805	0.3359	0.5159	0.0756	-0.0742	-0.1969	-0.1035	-0.032	-0.24	0.3316	0.2811	0.0175	0.2805	0.1584	0.0585	0.2133	0.0046	0.1992	64.6848	-24.1943	4.8151
26	0.5466	-0.0227	0.3106	0.7497	0.1061	0.7188	-0.0057	0.1191	-0.0048	-0.4027	0.0068	-0.1698	0.0812	0.2379	-0.0735	0.2932	0.0995	0.0879	0.2008	0.0178	0.1524	62.0029	-13.0848	-7.7829
27	0.4057	-0.4796	-0.1044	1.1188	0.7453	1.3173	0.0472	-0.0234	-0.0739	0.122	0.0129	-0.0915	0.2448	0.1035	-0.0411	0.0824	0.0039	-0.0353	0.1014	0.0236	0.1529	69.2316	-5.9556	41.1655
28	0.7706	0.0772	0.3047	0.8143	0.301	0.8477	0.0247	-0.0582	0.0347	0.0537	-0.0409	-0.0762	-0.0207	0.0178	0.0238	0.0468	-0.0052	-0.0054	0.0533	0.0122	0.0796	58.6254	7.6903	43.7183

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Selection details	Auth asym-ID	Auth seq-ID
1	X-RAY DIFFRACTION	1	chain 'B' and (resseq 2:54)	B	2 - 54
2	X-RAY DIFFRACTION	2	chain 'B' and (resseq 55:86)	B	55 - 86
3	X-RAY DIFFRACTION	3	chain 'B' and (resseq 87:155)	B	87 - 155
4	X-RAY DIFFRACTION	4	chain 'B' and (resseq 156:222)	B	156 - 222
5	X-RAY DIFFRACTION	5	chain 'B' and (resseq 223:247)	B	223 - 247
6	X-RAY DIFFRACTION	6	chain 'B' and (resseq 248:353)	B	248 - 353
7	X-RAY DIFFRACTION	7	chain 'B' and (resseq 354:387)	B	354 - 387
8	X-RAY DIFFRACTION	8	chain 'B' and (resseq 388:412)	B	388 - 412
9	X-RAY DIFFRACTION	9	chain 'B' and (resseq 413:442)	B	413 - 442
10	X-RAY DIFFRACTION	10	chain 'A' and (resseq 2:30)	A	2 - 30
11	X-RAY DIFFRACTION	11	chain 'A' and (resseq 31:72)	A	31 - 72
12	X-RAY DIFFRACTION	12	chain 'A' and (resseq 73:104)	A	73 - 104
13	X-RAY DIFFRACTION	13	chain 'A' and (resseq 105:155)	A	105 - 155
14	X-RAY DIFFRACTION	14	chain 'A' and (resseq 156:222)	A	156 - 222
15	X-RAY DIFFRACTION	15	chain 'A' and (resseq 223:247)	A	223 - 247
16	X-RAY DIFFRACTION	16	chain 'A' and (resseq 248:353)	A	248 - 353
17	X-RAY DIFFRACTION	17	chain 'A' and (resseq 354:387)	A	354 - 387
18	X-RAY DIFFRACTION	18	chain 'A' and (resseq 388:412)	A	388 - 412
19	X-RAY DIFFRACTION	19	chain 'A' and (resseq 413:442)	A	413 - 442
20	X-RAY DIFFRACTION	20	chain 'C' and (resseq 2:54)	C	2 - 54
21	X-RAY DIFFRACTION	21	chain 'C' and (resseq 55:86)	C	55 - 86
22	X-RAY DIFFRACTION	22	chain 'C' and (resseq 87:155)	C	87 - 155
23	X-RAY DIFFRACTION	23	chain 'C' and (resseq 156:247)	C	156 - 247
24	X-RAY DIFFRACTION	24	chain 'C' and (resseq 248:353)	C	248 - 353
25	X-RAY DIFFRACTION	25	chain 'C' and (resseq 354:387)	C	354 - 387
26	X-RAY DIFFRACTION	26	chain 'C' and (resseq 388:442)	C	388 - 442
27	X-RAY DIFFRACTION	27	chain 'D' and (resseq 2:155)	D	2 - 155
28	X-RAY DIFFRACTION	28	chain 'D' and (resseq 156:442)	D	156 - 442

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