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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 4fua | |||||||||
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タイトル | L-FUCULOSE-1-PHOSPHATE ALDOLASE COMPLEX WITH PGH | |||||||||
![]() | L-FUCULOSE-1-PHOSPHATE ALDOLASE | |||||||||
![]() | LYASE (ALDEHYDE) / CLASS II ALDOLASE / ZINC ENZYME / HYDROLASE | |||||||||
機能・相同性 | ![]() L-fuculose-phosphate aldolase / L-fuculose-phosphate aldolase activity / D-arabinose catabolic process / L-fucose catabolic process / pentose catabolic process / aldehyde-lyase activity / zinc ion binding / cytosol 類似検索 - 分子機能 | |||||||||
生物種 | ![]() ![]() | |||||||||
手法 | ![]() | |||||||||
![]() | Dreyer, M.K. / Schulz, G.E. | |||||||||
![]() | ![]() タイトル: Catalytic mechanism of the metal-dependent fuculose aldolase from Escherichia coli as derived from the structure. 著者: Dreyer, M.K. / Schulz, G.E. #1: ![]() タイトル: The Refined High Resolution Structure of the Metal Ion Dependent L-Fuculose-1-Phosphate Aldolase (Class II) from Escherichia Coli 著者: Dreyer, M.K. / Schulz, G.E. #2: ![]() タイトル: The Spatial Structure of the Class II L-Fuculose-1-Phosphate Aldolase from Escherichia Coli 著者: Dreyer, M.K. / Schulz, G.E. #3: ![]() タイトル: Diastereoselective Enzymatic Aldol Additions: L-Rhamnulose and L-Fuculose 1-Phosphate Aldolases from E.Coli 著者: Fessner, W.-D. / Sinerius, G. / Schneider, A. / Dreyer, M. / Schulz, G.E. / Badia, J. / Aguilar, J. | |||||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 55 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 41.5 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 440.4 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 443.5 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 10.7 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 14.2 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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2 | ![]()
| x 24|||||||||
単位格子 |
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Components on special symmetry positions |
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要素
-タンパク質 , 1種, 1分子 A
#1: タンパク質 | 分子量: 23805.318 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 詳細: PGH IS A TRANSITION STATE ANALOGUE INHIBITOR / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() ![]() |
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-非ポリマー , 5種, 70分子 ![](data/chem/img/ZN.gif)
![](data/chem/img/SO4.gif)
![](data/chem/img/BME.gif)
![](data/chem/img/PGH.gif)
![](data/chem/img/HOH.gif)
![](data/chem/img/SO4.gif)
![](data/chem/img/BME.gif)
![](data/chem/img/PGH.gif)
![](data/chem/img/HOH.gif)
#2: 化合物 | ChemComp-ZN / |
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#3: 化合物 | ChemComp-SO4 / |
#4: 化合物 | ChemComp-BME / |
#5: 化合物 | ChemComp-PGH / |
#6: 水 | ChemComp-HOH / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.71 Å3/Da / 溶媒含有率: 54 % | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | *PLUS pH: 7.6 / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
放射光源 | 波長: 1.5418 |
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検出器 | タイプ: SIEMENS / 検出器: AREA DETECTOR / 日付: 1994 |
放射 | 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1.5418 Å / 相対比: 1 |
反射 | 最高解像度: 2.13 Å / Num. obs: 10101 / Observed criterion σ(I): 0 / 冗長度: 5.1 % / Rmerge(I) obs: 0.073 |
反射 | *PLUS 最高解像度: 2.43 Å / Num. obs: 8744 / % possible obs: 85 % / Num. measured all: 50904 |
反射 シェル | *PLUS % possible obs: 47 % |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 解像度: 2.43→10 Å / σ(F): 0 /
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原子変位パラメータ | Biso mean: 18 Å2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Refine analyze | Luzzati coordinate error obs: 0.3 Å / Luzzati sigma a obs: 0.28 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.43→10 Å
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拘束条件 |
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