登録情報 | データベース: PDB / ID: 4f20 |
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タイトル | Crystal structures reveal the multi-ligand binding mechanism of the Staphylococcus aureus ClfB |
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要素 | - Clumping factor B
- peptide from Dermokine
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キーワード | CELL ADHESION/CYTOKINE / Dev-IgG fold / protein-peptide complex / Cell Adhesion / Dermokine / Cell Surface / Cell adhesion-Cytokine complex |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
cornified envelope assembly / cell adhesion / extracellular space / extracellular region類似検索 - 分子機能 Dermokine / Fibrinogen-binding domain 2 / C-terminus of bacterial fibrinogen-binding adhesin / Immunoglobulin-like - #1290 / Immunoglobulin-like - #1280 / SDR-like Ig domain / Bacterial Ig domain / Fibrogen-binding domain 1 / Adhesion domain superfamily / YSIRK type signal peptide ...Dermokine / Fibrinogen-binding domain 2 / C-terminus of bacterial fibrinogen-binding adhesin / Immunoglobulin-like - #1290 / Immunoglobulin-like - #1280 / SDR-like Ig domain / Bacterial Ig domain / Fibrogen-binding domain 1 / Adhesion domain superfamily / YSIRK type signal peptide / YSIRK Gram-positive signal peptide / LPXTG cell wall anchor motif / Gram-positive cocci surface proteins LPxTG motif profile. / LPXTG cell wall anchor domain / Immunoglobulin-like / Sandwich / Mainly Beta類似検索 - ドメイン・相同性 |
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生物種 | ![](img/tx_bacteria.gif) Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
Homo sapiens (ヒト) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 2.502 Å |
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データ登録者 | Yang, M.J. / Xiang, H. / Wang, J.W. / Liu, B. / Chen, Y.G. / Liu, L. / Deng, X.M. / Feng, Y. |
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引用 | ジャーナル: Plos Pathog. / 年: 2012 タイトル: Crystal Structures Reveal the Multi-Ligand Binding Mechanism of Staphylococcus aureus ClfB 著者: Xiang, H. / Feng, Y. / Wang, J.W. / Liu, B. / Chen, Y.G. / Liu, L. / Deng, X.M. / Yang, M.J. |
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履歴 | 登録 | 2012年5月7日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: PDBJ |
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改定 1.0 | 2012年8月8日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2023年11月8日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn / struct_ref_seq_dif / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id |
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