PDB-4ezl: Potent and Selective Inhibitors of PI3K-delta: Obtaining Isoform ...

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 4ezl

タイトル

Potent and Selective Inhibitors of PI3K-delta: Obtaining Isoform Selectivity from the Affinity Pocket and Tryptophan Shelf

要素

Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit gamma isoform

キーワード

TRANSFERASE/TRANSFERASE INHIBITOR / kinase p110 / p110-gamma / lipid kinase / cytoplasmic / TRANSFERASE-TRANSFERASE INHIBITOR complex

機能・相同性

機能・相同性情報

secretory granule localization / negative regulation of triglyceride catabolic process / natural killer cell chemotaxis / neutrophil extravasation / phosphatidylinositol-4-phosphate 3-kinase / positive regulation of acute inflammatory response / respiratory burst involved in defense response / negative regulation of cardiac muscle contraction / regulation of calcium ion transmembrane transport / T cell chemotaxis ...secretory granule localization / negative regulation of triglyceride catabolic process / natural killer cell chemotaxis / neutrophil extravasation / phosphatidylinositol-4-phosphate 3-kinase / positive regulation of acute inflammatory response / respiratory burst involved in defense response / negative regulation of cardiac muscle contraction / regulation of calcium ion transmembrane transport / T cell chemotaxis / negative regulation of fibroblast apoptotic process / phosphatidylinositol 3-kinase complex, class IB / sphingosine-1-phosphate receptor signaling pathway / phosphatidylinositol 3-kinase complex, class IA / dendritic cell chemotaxis / 1-phosphatidylinositol-4-phosphate 3-kinase activity / 1-phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase activity / phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase / phosphatidylinositol 3-kinase / phosphatidylinositol-3-phosphate biosynthetic process / 1-phosphatidylinositol-3-kinase activity / mast cell degranulation / Erythropoietin activates Phosphoinositide-3-kinase (PI3K) / hepatocyte apoptotic process / positive regulation of Rac protein signal transduction / regulation of cell adhesion mediated by integrin / Synthesis of PIPs at the plasma membrane / phosphatidylinositol-mediated signaling / phosphatidylinositol phosphate biosynthetic process / regulation of angiogenesis / T cell proliferation / cellular response to cAMP / GPVI-mediated activation cascade / T cell activation / ephrin receptor binding / positive regulation of endothelial cell migration / phosphatidylinositol 3-kinase/protein kinase B signal transduction / neutrophil chemotaxis / positive regulation of cytokine production / positive regulation of MAP kinase activity / platelet aggregation / endocytosis / G beta:gamma signalling through PI3Kgamma / Signaling by CSF1 (M-CSF) in myeloid cells / kinase activity / positive regulation of cytosolic calcium ion concentration / angiogenesis / adaptive immune response / positive regulation of phosphatidylinositol 3-kinase/protein kinase B signal transduction / non-specific serine/threonine protein kinase / protein kinase activity / inflammatory response / phosphorylation / immune response / G protein-coupled receptor signaling pathway / innate immune response / protein serine kinase activity / protein serine/threonine kinase activity / ATP binding / identical protein binding / membrane / plasma membrane / cytoplasm / cytosol
類似検索 - 分子機能

PIK3 catalytic subunit gamma, adaptor-binding domain / PIK3 catalytic subunit gamma adaptor-binding domain / Phosphatidylinositol 3-/4-kinase, catalytic domain / Phosphatidylinositol 3-kinase, accessory domain (PIK) / Phosphatidylinositol 3-kinase Catalytic Subunit; Chain A, domain 4 / Phosphatidylinositol 3-kinase Catalytic Subunit; Chain A, domain 4 / Phosphatidylinositol 3-kinase Catalytic Subunit; Chain A, Domain 5 / C2 domain / Phosphatidylinositol 3-kinase, adaptor-binding domain / Phosphatidylinositol 3-kinase adaptor-binding (PI3K ABD) domain profile. ...PIK3 catalytic subunit gamma, adaptor-binding domain / PIK3 catalytic subunit gamma adaptor-binding domain / Phosphatidylinositol 3-/4-kinase, catalytic domain / Phosphatidylinositol 3-kinase, accessory domain (PIK) / Phosphatidylinositol 3-kinase Catalytic Subunit; Chain A, domain 4 / Phosphatidylinositol 3-kinase Catalytic Subunit; Chain A, domain 4 / Phosphatidylinositol 3-kinase Catalytic Subunit; Chain A, Domain 5 / C2 domain / Phosphatidylinositol 3-kinase, adaptor-binding domain / Phosphatidylinositol 3-kinase adaptor-binding (PI3K ABD) domain profile. / PI3-kinase family, Ras-binding domain / Phosphatidylinositol 3-kinase Ras-binding (PI3K RBD) domain / PI3-kinase family, ras-binding domain / Phosphatidylinositol 3-kinase Ras-binding (PI3K RBD) domain profile. / Phosphoinositide 3-kinase C2 / Phosphoinositide 3-kinase, region postulated to contain C2 domain / C2 phosphatidylinositol 3-kinase-type domain / C2 phosphatidylinositol 3-kinase (PI3K)-type domain profile. / Phosphoinositide 3-kinase, accessory (PIK) domain superfamily / Phosphoinositide 3-kinase family, accessory domain (PIK domain) / Phosphoinositide 3-kinase family, accessory domain (PIK domain) / Phosphoinositide 3-kinase, accessory (PIK) domain / Phosphatidylinositol kinase / PIK helical domain profile. / Phosphatidylinositol 3- and 4-kinases signature 1. / Phosphatidylinositol 3/4-kinase, conserved site / Phosphatidylinositol 3- and 4-kinases signature 2. / Phosphatidylinositol 3-/4-kinase, catalytic domain superfamily / Phosphoinositide 3-kinase, catalytic domain / Phosphatidylinositol 3- and 4-kinase / Phosphatidylinositol 3- and 4-kinases catalytic domain profile. / Phosphatidylinositol 3-/4-kinase, catalytic domain / Phosphatidylinositol 3-kinase Catalytic Subunit; Chain A, domain 1 / C2 domain superfamily / Serine Threonine Protein Phosphatase 5, Tetratricopeptide repeat / Ubiquitin-like (UB roll) / Alpha Horseshoe / Armadillo-type fold / Ubiquitin-like domain superfamily / Roll / Protein kinase-like domain superfamily / Immunoglobulin-like / Sandwich / 2-Layer Sandwich / Orthogonal Bundle / Mainly Beta / Mainly Alpha / Alpha Beta
類似検索 - ドメイン・相同性

生物種

Homo sapiens (ヒト)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 2.94 Å

データ登録者

Murray, J.M.

引用

ジャーナル: Bioorg.Med.Chem.Lett. / 年: 2012
タイトル: Potent and selective inhibitors of PI3K-delta: obtaining isoform selectivity from the affinity pocket and tryptophan shelf
著者: Sutherlin, D.P. / Baker, S. / Bisconte, A. / Blaney, P.M. / Brown, A. / Chan, B.K. / Chantry, D. / Castanedo, G. / DePledge, P. / Goldsmith, P. / Goldstein, D.M. / Hancox, T. / Kaur, J. / ...

履歴

登録	2012年5月2日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.0	2013年4月17日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2023年9月13日	Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / struct_ref_seq_dif / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	4ezl.cif.gz	362.4 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb4ezl.ent.gz	297.1 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	4ezl.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

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検証レポート

文書・要旨	4ezl_validation.pdf.gz	705.7 KB	表示	wwPDB検証レポート
文書・詳細版	4ezl_full_validation.pdf.gz	722.4 KB	表示
XML形式データ	4ezl_validation.xml.gz	31.7 KB	表示
CIF形式データ	4ezl_validation.cif.gz	42.9 KB	表示
アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ez/4ezl ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ez/4ezl	HTTPS FTP

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関連構造データ

関連構造データ	4ezjC 4ezkC 1e8xS C: 同じ文献を引用 (文献) S: 精密化の開始モデル
類似構造データ	3r7r-d 2chw-d 3t8m-d 7jwz-d 3csf-d 1e8y-d 4anx-d 3l13-d 2v4l-d 1e8x-d 3dbs-d 4ps8-d 4anw-d 4urk-d 1e7v-d 4ful-d 4hle-d 2a5u-d 6t3c-d 4hvb-d Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

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リンク

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「今月の分子」の関連する項目	#148 - 2012年4月 Rasタンパク質 (Ras Protein) 類似性 (35) #245 - 2020年5月スプライソソーム (Spliceosomes) 類似性 (1) #196 - 2016年4月鉛の毒 (Lead Poisoning) 類似性 (1) #239 - 2019年11月ホスホリパーゼA2 (Phospholipase A2) 類似性 (1)

登録構造単位

A: Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit gamma isoform

ヘテロ分子

111 kDa, 1 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

1

登録構造と同一
登録者・ソフトウェアが定義した集合体

単位格子

Length a, b, c (Å)	141.331, 67.194, 106.558
Angle α, β, γ (deg.)	90.00, 96.10, 90.00
Int Tables number	5
Space group name H-M	C121

#1: タンパク質	Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit gamma isoform / PI3-kinase subunit gamma / PI3K-gamma / PI3Kgamma / PtdIns-3-kinase subunit gamma / ...PI3-kinase subunit gamma / PI3K-gamma / PI3Kgamma / PtdIns-3-kinase subunit gamma / Phosphatidylinositol 4 / 5-bisphosphate 3-kinase 110 kDa catalytic subunit gamma / PtdIns-3-kinase subunit p110-gamma / p110gamma / Phosphoinositide-3-kinase catalytic gamma polypeptide / Serine/threonine protein kinase PIK3CG / p120-PI3K 分子量: 110699.023 Da / 分子数: 1 / 断片: UNP residues 144-1102 / 変異: K802T / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: PIK3CG / 細胞株 (発現宿主): Sf9 発現宿主: Spodoptera frugiperda (ツマジロクサヨトウ) 参照: UniProt: P48736, phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase, non-specific serine/threonine protein kinase
#2: 化合物	ChemComp-0SE / 2-(1-{[2-(2-aminopyrimidin-5-yl)-4-(morpholin-4-yl)pyrido[3,2-d]pyrimidin-6-yl]methyl}piperidin-4-yl)propan-2-ol 分子量: 464.563 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₂₄H₃₂N₈O₂
#3: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.27 Å³/Da / 溶媒含有率: 45.87 %
結晶化	温度: 289 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 8.5 詳細: PEG 3350, 0.2M NH4SO4, 0.1M Tris-HCl 8.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 289K

-
データ収集

放射光源

由来:

シンクロトロン / サイト:

ALS

/ ビームライン: 5.0.1 / 波長: 1 Å

検出器

タイプ: ADSC QUANTUM 210 / 検出器: CCD / 日付: 2011年10月26日

放射

プロトコル: SINGLE / 散乱光タイプ: x-ray

放射波長

波長: 1 Å / 相対比: 1

反射

解像度: 2.935→50 Å / Num. obs: 20407 / % possible obs: 99.5 % / Observed criterion σ(F): 0 / Observed criterion σ(I): 0 / 冗長度: 3.6 % / B_iso Wilson estimate: 80 Å² / R_merge(I) obs: 0.086 / Net I/σ(I): 10.1

反射シェル

解像度 (Å)	冗長度 (%)	R_merge(I) obs	Diffraction-ID	% possible all
2.935-3.11	3.7	0.475	1	99.8
3.11-3.23	3.7	0.365	1	99.9
3.23-3.38	3.7	0.26	1	99.8
3.38-3.56	3.7	0.202	1	99.6
3.56-3.78	3.7	0.138	1	99.7
3.78-4.07	3.6	0.12	1	99.1
4.07-4.48	3.5	0.089	1	99.2
4.48-5.13	3.5	0.072	1	99.1
5.13-6.46	3.5	0.068	1	99.8
6.46-50	3.5	0.05	1	99

-
位相決定

位相決定

手法:

分子置換

Phasing MR

	最高解像度	最低解像度
Rotation	2.93 Å	31.14 Å
Translation	2.93 Å	31.14 Å

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
DENZO		データ削減
SCALEPACK		データスケーリング
PHASER	2.3.0	位相決定
PHENIX	1.7.2_869	精密化
PDB_EXTRACT	3.11	データ抽出

精密化

構造決定の手法:

分子置換
開始モデル: PDB ENTRY 1E8X

1e8x

解像度: 2.94→31.14 Å / Occupancy max: 1 / Occupancy min: 1 / SU ML: 0.74 / σ(F): 1.35 / 位相誤差: 31.03 / 立体化学のターゲット値: ML

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.271	1044	5.12 %
R_work	0.244	-	-
obs	0.245	20402	94.9 %

溶媒の処理

減衰半径: 0.73 Å / VDWプローブ半径: 1 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL / B_sol: 44.23 Å² / k_sol: 0.28 e/Å³

原子変位パラメータ

B_iso mean: 102.31 Å²

	B_aniso -1	B_aniso -2	B_aniso -3
1-	4.827 Å²	-0 Å²	0.6987 Å²
2-	-	4.0965 Å²	0 Å²
3-	-	-	4.6886 Å²

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 2.94→31.14 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	6735	0	34	1	6770

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	数
X-RAY DIFFRACTION	f_bond_d	0.008	6932
X-RAY DIFFRACTION	f_angle_d	1.531	9383
X-RAY DIFFRACTION	f_dihedral_angle_d	13.637	2572
X-RAY DIFFRACTION	f_chiral_restr	0.068	1056
X-RAY DIFFRACTION	f_plane_restr	0.007	1187

LS精密化シェル

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	R_factor R_work	Num. reflection R_work	Refine-ID	% reflection obs (%)
2.935-3.0894	0.3664	111	0.3482	1909	X-RAY DIFFRACTION	67
3.0894-3.2828	0.375	150	0.3302	2897	X-RAY DIFFRACTION	100
3.2828-3.5359	0.3441	160	0.2965	2884	X-RAY DIFFRACTION	100
3.5359-3.8911	0.2802	157	0.2544	2886	X-RAY DIFFRACTION	100
3.8911-4.4528	0.2452	156	0.2306	2879	X-RAY DIFFRACTION	99
4.4528-5.6047	0.2471	156	0.2166	2926	X-RAY DIFFRACTION	99
5.6047-31.1459	0.2445	154	0.2191	2977	X-RAY DIFFRACTION	100

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	0.1267	-0.2759	-0.4725	3.1233	1.6064	1.8289	-0.2785	0.7004	-0.6852	-0.5578	-0.2245	0.6142	1.0089	-0.7705	0.2697	0.7016	-0.0259	-0.0672	1.1187	-0.3777	0.7312	27.2979	-37.679	4.4442
2	1.132	-0.2571	-0.5985	0.4433	0.3468	0.4371	0.2482	0.5113	-0.2314	-0.5214	0.1274	-0.2329	-0.2101	0.3719	-0.3637	0.9088	0.0504	-0.1979	0.719	-0.3828	0.6772	42.8478	-32.6658	6.7393
3	0.5316	0.2628	-0.0559	1.0905	-0.1072	0.4647	0.1538	0.3235	-0.9593	0.4534	0.2933	0.0785	0.6093	0.2809	1.1352	0.9199	0.5204	-0.309	-0.3634	-0.5402	1.2773	36.7844	-41.624	17.8436
4	1.5309	-0.8692	-0.5716	0.5087	0.5217	2.3268	0.1526	-0.3413	-0.3734	0.3085	0.2097	-0.0219	0.6247	-0.6282	0.081	0.9149	-0.0597	0.0135	0.7624	0.4154	1.0905	18.2939	-34.5291	33.2758
5	1.1651	-0.568	0.154	1.3174	1.0464	2.6773	0.0455	-0.4224	0.308	0.4616	0.0182	-0.28	-0.0763	-0.1271	-0.0401	1.9595	-0.0407	0.5082	1.8225	-0.0306	1.0378	13.7318	-18.0492	49.1572
6	2.3597	0.1055	0.559	2.3017	-0.286	1.633	-0.0989	-1.1758	-0.1163	0.2875	-0.3165	0.5172	0.5967	-0.5072	0.1511	0.8381	0.1051	0.4571	1.7084	0.541	1.086	-0.2078	-30.3388	40.9243
7	3.6063	-0.0029	0.7778	0.3877	0.9649	2.5857	-0.1917	-0.1181	-0.972	-0.0251	-0.1967	0.3804	0.8005	-0.1118	0.1192	1.0164	-0.3845	-0.038	1.1321	-0.015	1.3058	2.1114	-37.0316	30.7728
8	0.8201	1.2159	1.3033	1.7906	1.9205	2.0604	0.7462	-0.3717	0.2094	0.2772	0.285	0.297	0.4147	-0.2509	0.1473	0.9726	-0.3349	0.3457	1.3529	0.3307	0.9326	10.3742	-31.0211	32.3144
9	2.1205	-1.18	1.297	4.3	-1.174	3.4349	-0.1322	0.0258	-0.582	-0.5257	0.3577	-0.1097	-0.2957	0.1468	-0.2082	0.7586	0.3307	0.1858	1.3196	0.35	1.1305	12.633	-23.7472	39.2442
10	6.5147	6.1201	5.664	5.7659	5.3615	5.0045	-0.0751	0.2146	0.5683	-0.3865	0.3766	0.4284	-0.7193	-0.5109	-0.1153	1.4454	0.1791	0.4416	1.011	0.2914	1.4381	4.9442	-18.4615	36.5248
11	0.3675	-0.9922	-0.2784	2.7752	0.6358	0.3484	-0.2639	0.1281	-0.4706	-0.4144	-0.0967	0.1462	0.7751	-0.6464	0.38	0.4867	-0.1354	0.0431	1.3563	-0.0287	1.2877	4.0298	-35.4755	26.7486
12	0.3429	0.4085	-0.1484	0.5945	-0.4744	0.9241	-0.1788	0.4544	-0.3167	-0.5537	-0.0781	-0.0429	0.146	-0.4632	0.2918	0.9455	0.0168	-0.3546	0.7458	-0.2435	1.1697	18.7058	-43.4008	15.8641
13	1.5619	-0.0368	0.6819	4.4191	-1.3326	2.8189	-0.0677	0.1363	-0.6511	-0.5852	0.1944	0.0845	0.1175	0.6533	-0.0943	0.3396	0.2466	0.0826	1.3868	-0.1296	0.5215	67.9879	-30.7533	12.9507
14	0.0441	0.0134	0.0336	0.0353	0.0637	0.1291	-0.9104	0.5877	1.5975	-0.7571	-0.8186	0.5804	-1.3894	0.2422	0.8755	1.321	-0.4986	-0.2194	1.274	0.2024	1.0863	60.7371	-8.2101	0.6569
15	1.4083	0.3132	-1.1185	2.6742	-1.6268	3.8512	0.3244	1.0437	0.1257	-0.2605	-0.2268	0.1137	-0.173	1.3854	-0.0677	0.5417	-0.0079	-0.0199	1.1708	0.0298	0.4606	65.3984	-23.9466	16.3818
16	4.6509	-0.166	0.0363	0.9529	1.0086	2.8407	-0.4056	0.1112	0.8371	0.2203	-0.3003	0.1265	0.0332	0.4375	0.4078	0.5228	-0.2051	-0.065	0.8051	-0.1953	0.4957	59.9271	-19.1195	14.9847
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18	5.6439	-0.835	-2.8262	5.3708	0.646	2.1469	0.0913	-0.1972	-0.2462	0.2987	-0.1538	0.1971	0.2308	-0.4069	-0.0041	0.912	0.4887	0.1222	0.5297	0.0248	0.8666	52.8194	-41.2679	18.3223
19	2.0025	1.0996	0.1829	0.8814	-0.8423	3.2541	-0.1273	0.5258	-0.5913	-0.1589	-0.4622	0.1322	0.5243	0.173	0.0633	0.7812	0.1501	-0.0979	1.2612	-0.2703	0.3806	58.2056	-31.4274	8.8664
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24	1.6249	0.2643	-1.6686	3.4568	0.7612	2.026	-0.0201	0.3873	0.2149	-0.1765	-0.5196	0.2303	0.1294	-0.3223	0.1198	0.2652	-0.0289	0.2842	1.2651	-0.2894	0.6337	57.4653	-21.4391	4.5311
25	1.7376	0.4226	-0.6399	2.294	-1.8349	4.126	-0.1161	-0.0666	-0.2444	0.0288	0.0092	-0.335	0.512	0.5904	0.199	0.8663	0.3868	0.5981	1.3305	-0.2982	0.6741	65.3855	-34.2905	10.8435
26	2.8109	-0.0309	1.2247	3.6381	0.1572	5.2034	-0.3613	-1.2247	-0.7473	-0.1199	-0.1591	-0.4652	-0.419	-0.1567	0.2246	0.4972	0.0755	0.1884	0.8503	0.004	0.6463	57.3736	-25.3952	55.0992
27	4.4617	0.1515	-1.0114	3.2338	-0.1986	3.4314	0.2204	0.3014	0.9074	0.4868	-0.0004	-0.169	0.2353	-0.1165	-0.3488	0.6925	0.051	0.0032	0.9494	-0.1571	0.4636	56.6869	-25.3044	45.4524
28	3.7571	0.4054	-1.3961	2.7156	-0.3868	3.8853	-0.04	0.1267	-0.4156	-0.121	-0.1674	-0.7304	0.1254	0.3675	0.2129	0.3179	0.1173	-0.0958	0.5515	0.129	0.3369	56.2351	-32.8185	38.5998
29	2.2847	0.6045	-1.0583	1.0772	0.1842	3.5229	-0.2716	-0.666	-0.7631	0.3921	-0.0862	-0.2448	0.7363	0.2479	0.074	0.4961	0.007	-0.0424	0.4624	0.1463	0.5696	44.3365	-30.5444	39.4884
30	5.3288	2.6222	0.1681	2.1711	-1.5909	3.2223	0.2674	-0.4687	-0.883	0.1821	0.0712	0.556	0.3243	-0.1608	-0.1596	0.539	0.0732	-0.1496	0.482	0.2357	0.7834	39.9707	-34.0924	35.277
31	3.2346	-0.1159	0.7673	1.7809	0.0245	1.5998	0.2198	0.1593	-0.4911	0.1342	-0.1128	0.4606	0.1893	0.0004	-0.1349	0.3395	0.0149	-0.0289	0.2043	-0.0597	0.3998	33.4241	-29.044	22.2595
32	2.9999	-0.8168	-1.015	4.4895	-1.6473	2.728	0.083	0.9655	-0.6157	-0.914	-0.2802	0.4987	0.0193	-0.935	0.0211	0.4108	0.0397	-0.0966	0.8006	-0.1037	0.3855	20.9929	-19.4907	8.812
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34	2.033	-0.5046	0.2256	1.7761	0.3787	1.0065	-0.7366	-0.1332	0.6409	0.6759	-0.0193	0.3778	-0.9486	-0.7334	0.2954	0.9813	0.5508	-0.1081	0.3522	-0.1817	0.6193	21.0195	-3.632	31.8544
35	3.3533	-0.4793	-1.5107	1.6757	0.1469	2.5906	-0.1745	-0.4291	0.771	0.4452	-0.3442	0.2286	-0.5287	-0.3205	-0.2843	1.9731	0.5647	-0.3722	0.6076	-0.5318	1.3317	25.0401	8.1567	41.1776
36	1.3159	-0.615	-0.9899	2.2701	0.9658	0.8688	-0.4166	-0.752	0.5226	0.758	-0.0563	-0.4911	-0.8142	-0.4773	0.1709	1.1768	0.3758	-0.1289	0.7723	-0.1214	0.3649	32.8114	-9.503	42.2107
37	3.7424	2.5373	2.8363	1.775	1.869	2.193	-0.0284	0.5857	0.3221	-0.3192	0.334	-0.3397	-0.2418	1.0054	-0.0302	1.143	-0.1025	0.1882	1.683	-0.1479	0.9073	47.4587	-9.8812	25.7781
38	1.3597	-0.4806	-0.1706	1.6295	-0.7739	1.598	-0.5179	-0.3929	1.0643	-0.6907	-0.0823	0.6009	-1.6226	-0.4341	0.0783	1.4295	0.0491	-0.7363	0.4308	-0.3593	0.9568	36.1745	2.6796	38.7534

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Selection details
1	X-RAY DIFFRACTION	1	(CHAIN A AND RESID 143:158 )
2	X-RAY DIFFRACTION	2	(CHAIN A AND RESID 159:171 )
3	X-RAY DIFFRACTION	3	(CHAIN A AND RESID 172:188 )
4	X-RAY DIFFRACTION	4	(CHAIN A AND RESID 189:208 )
5	X-RAY DIFFRACTION	5	(CHAIN A AND RESID 209:214 )
6	X-RAY DIFFRACTION	6	(CHAIN A AND RESID 215:251 )
7	X-RAY DIFFRACTION	7	(CHAIN A AND RESID 267:274 )
8	X-RAY DIFFRACTION	8	(CHAIN A AND RESID 275:286 )
9	X-RAY DIFFRACTION	9	(CHAIN A AND RESID 287:298 )
10	X-RAY DIFFRACTION	10	(CHAIN A AND RESID 299:304 )
11	X-RAY DIFFRACTION	11	(CHAIN A AND RESID 305:312 )
12	X-RAY DIFFRACTION	12	(CHAIN A AND RESID 313:320 )
13	X-RAY DIFFRACTION	13	(CHAIN A AND RESID 357:369 )
14	X-RAY DIFFRACTION	14	(CHAIN A AND RESID 370:381 )
15	X-RAY DIFFRACTION	15	(CHAIN A AND RESID 382:427 )
16	X-RAY DIFFRACTION	16	(CHAIN A AND RESID 428:435 )
17	X-RAY DIFFRACTION	17	(CHAIN A AND RESID 460:469 )
18	X-RAY DIFFRACTION	18	(CHAIN A AND RESID 470:474 )
19	X-RAY DIFFRACTION	19	(CHAIN A AND RESID 475:484 )
20	X-RAY DIFFRACTION	20	(CHAIN A AND RESID 485:489 )
21	X-RAY DIFFRACTION	21	(CHAIN A AND RESID 497:502 )
22	X-RAY DIFFRACTION	22	(CHAIN A AND RESID 503:507 )
23	X-RAY DIFFRACTION	23	(CHAIN A AND RESID 508:512 )
24	X-RAY DIFFRACTION	24	(CHAIN A AND RESID 513:517 )
25	X-RAY DIFFRACTION	25	(CHAIN A AND RESID 518:522 )
26	X-RAY DIFFRACTION	26	(CHAIN A AND RESID 544:560 )
27	X-RAY DIFFRACTION	27	(CHAIN A AND RESID 561:585 )
28	X-RAY DIFFRACTION	28	(CHAIN A AND RESID 586:612 )
29	X-RAY DIFFRACTION	29	(CHAIN A AND RESID 613:637 )
30	X-RAY DIFFRACTION	30	(CHAIN A AND RESID 638:652 )
31	X-RAY DIFFRACTION	31	(CHAIN A AND RESID 653:725 )
32	X-RAY DIFFRACTION	32	(CHAIN A AND RESID 726:753 )
33	X-RAY DIFFRACTION	33	(CHAIN A AND RESID 760:837 )
34	X-RAY DIFFRACTION	34	(CHAIN A AND RESID 838:966 )
35	X-RAY DIFFRACTION	35	(CHAIN A AND RESID 981:1003 )
36	X-RAY DIFFRACTION	36	(CHAIN A AND RESID 1004:1038 )
37	X-RAY DIFFRACTION	37	(CHAIN A AND RESID 1039:1045 )
38	X-RAY DIFFRACTION	38	(CHAIN A AND RESID 1046:1093 )

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関連情報:EMDBヘッダ

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新型コロナ情報

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