PDB-4egx: Crystal structure of KIF1A CC1-FHA tandem

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 4egx

タイトル

Crystal structure of KIF1A CC1-FHA tandem

要素

Kinesin-like protein KIF1A

キーワード

TRANSPORT PROTEIN / FHA domain

機能・相同性

機能・相同性情報

neuronal dense core vesicle membrane / dense core granule cytoskeletal transport / anterograde neuronal dense core vesicle transport / retrograde neuronal dense core vesicle transport / regulation of dendritic spine development / cytoskeleton-dependent intracellular transport / regulation of dendritic spine morphogenesis / anterograde axonal transport / Kinesins / plus-end-directed microtubule motor activity ...
類似検索 - 分子機能

生物種

Homo sapiens (ヒト)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 2.51 Å

データ登録者

Yu, J. / Huo, L. / Yue, Y. / Xu, T. / Zhang, M. / Feng, W.

引用

ジャーナル: Structure / 年: 2012
タイトル: The CC1-FHA Tandem as a Central Hub for Controlling the Dimerization and Activation of Kinesin-3 KIF1A
著者: Huo, L. / Yue, Y. / Ren, J. / Yu, J. / Liu, J. / Yu, Y. / Ye, F. / Xu, T. / Zhang, M. / Feng, W.

履歴

登録	2012年4月2日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: PDBJ
改定 1.0	2012年10月3日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2023年11月8日	Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / struct_ref_seq_dif / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	4egx.cif.gz	287.4 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb4egx.ent.gz	235.2 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	4egx.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

-
検証レポート

文書・要旨	4egx_validation.pdf.gz	477.7 KB	表示	wwPDB検証レポート
文書・詳細版	4egx_full_validation.pdf.gz	493.5 KB	表示
XML形式データ	4egx_validation.xml.gz	29.8 KB	表示
CIF形式データ	4egx_validation.cif.gz	40.2 KB	表示
アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/eg/4egx ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/eg/4egx	HTTPS FTP

-
関連構造データ

関連構造データ	4ejqC 3fm8S C: 同じ文献を引用 (文献) S: 精密化の開始モデル
類似構造データ	1lnz-1 5iig-d 6ps7-d 6zdr-d 5jtb-d 5iu8-d 4wkz-d 1hyr-d Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

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リンク

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「今月の分子」の関連する項目	#64 - 2005年4月キネシン (Kinesin) 類似性 (9) #175 - 2014年7月微小管 (Microtubules) 類似性 (7) #122 - 2010年2月エンハンセオソーム (Enhanceosome) 類似性 (1) #231 - 2019年3月麻疹ウイルスタンパク質 (Measles Virus Proteins) 類似性 (2) #18 - 2001年6月ミオシン (Myosin) 類似性 (1) #148 - 2012年4月 Rasタンパク質 (Ras Protein) 類似性 (1) #241 - 2020年1月 20年の分子を振り返って (Twenty Years of Molecules) 類似性 (7) #174 - 2014年6月 GFP様タンパク質 (GFP-like Proteins) 類似性 (1)

PDBのページ

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「今月の分子」の関連する項目

#64 - 2005年4月
キネシン (Kinesin)
類似性 (9)
#175 - 2014年7月
微小管 (Microtubules)
類似性 (7)
#122 - 2010年2月
エンハンセオソーム (Enhanceosome)
類似性 (1)
#231 - 2019年3月
麻疹ウイルスタンパク質 (Measles Virus Proteins)
類似性 (2)
#18 - 2001年6月
ミオシン (Myosin)
類似性 (1)
#148 - 2012年4月
Rasタンパク質 (Ras Protein)
類似性 (1)
#241 - 2020年1月
20年の分子を振り返って (Twenty Years of Molecules)
類似性 (7)
#174 - 2014年6月
GFP様タンパク質 (GFP-like Proteins)
類似性 (1)

登録構造単位

A: Kinesin-like protein KIF1A

B: Kinesin-like protein KIF1A

C: Kinesin-like protein KIF1A

D: Kinesin-like protein KIF1A

ヘテロ分子

84.3 kDa, 4 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

1

A: Kinesin-like protein KIF1A

B: Kinesin-like protein KIF1A

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
42.1 kDa, 2 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

2

C: Kinesin-like protein KIF1A

D: Kinesin-like protein KIF1A

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
42.1 kDa, 2 ポリマー
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単位格子

Length a, b, c (Å)	83.943, 87.855, 101.694
Angle α, β, γ (deg.)	90.00, 90.00, 90.00
Int Tables number	19
Space group name H-M	P2₁2₁2₁

#1: タンパク質	Kinesin-like protein KIF1A / Axonal transporter of synaptic vesicles / Microtubule-based motor KIF1A / Unc-104- and KIF1A- ...Axonal transporter of synaptic vesicles / Microtubule-based motor KIF1A / Unc-104- and KIF1A-related protein / hUnc-104 分子量: 20964.643 Da / 分子数: 4 / 断片: CC1-FHA tandem, UNP residues 430-607 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: KIF1A, ATSV, C2orf20 / プラスミド: pET32a / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: Q12756
#2: 化合物	ChemComp-PEG / DI(HYDROXYETHYL)ETHER / ジエチレングリコ-ル分子量: 106.120 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₄H₁₀O₃
#3: 化合物	ChemComp-GOL / GLYCEROL / GLYCERIN / PROPANE-1,2,3-TRIOL / グリセロ-ル分子量: 92.094 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₃H₈O₃
#4: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 160 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.24 Å³/Da / 溶媒含有率: 44.99 %
結晶化	温度: 289 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 5.8 詳細: 18% (w/v) PEG 5000 MME, 8% (v/v) Tacsimate (pH 6.0), 0.1 M Bis-Tris, pH 5.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K

-
データ収集

回折	平均測定温度: 100 K
放射光源	由来: シンクロトロン / サイト: SSRF / ビームライン: BL17U / 波長: 0.979 Å
検出器	タイプ: MARMOSAIC 225 mm CCD / 検出器: CCD / 日付: 2010年9月1日
放射	プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 0.979 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 2.5→50 Å / Num. all: 25983 / Num. obs: 24084 / % possible obs: 97.6 % / Observed criterion σ(I): 3 / 冗長度: 2.6 % / R_merge(I) obs: 0.103 / Net I/σ(I): 14.8
反射シェル	解像度: 2.5→2.54 Å / % possible all: 97.7

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
HKL-2000		データ収集
PHASER		位相決定
REFMAC	5.2.0019	精密化
HKL-2000		データ削減
HKL-2000		データスケーリング

精密化

構造決定の手法:

分子置換
開始モデル: PDB ENTRY 3FM8

3fm8

解像度: 2.51→50 Å / Cor.coef. F_o:F_c: 0.892 / Cor.coef. F_o:F_c free: 0.86 / SU B: 24.207 / SU ML: 0.269 / 交差検証法: THROUGHOUT / ESU R: 1.174 / ESU R Free: 0.352 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD / 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS

	R_factor	反射数	%反射	Selection details
R_free	0.28257	1286	5.1 %	RANDOM
R_work	0.25168	-	-	-
obs	0.25325	24084	96.36 %	-

溶媒の処理

イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å / 溶媒モデル: BABINET MODEL WITH MASK

原子変位パラメータ

B_iso mean: 39.229 Å²

	B_aniso -1	B_aniso -2	B_aniso -3
1-	0.48 Å²	0 Å²	0 Å²
2-	-	1.89 Å²	0 Å²
3-	-	-	-2.37 Å²

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 2.51→50 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	5405	0	26	160	5591

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	Dev ideal target	数
X-RAY DIFFRACTION	r_bond_refined_d	0.01	0.021	5510
X-RAY DIFFRACTION	r_bond_other_d
X-RAY DIFFRACTION	r_angle_refined_deg	1.267	1.97	7416
X-RAY DIFFRACTION	r_angle_other_deg
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_1_deg	6.138	5	699
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_2_deg	34.713	23.574	249
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_3_deg	20.817	15	960
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_4_deg	21.643	15	50
X-RAY DIFFRACTION	r_chiral_restr	0.078	0.2	831
X-RAY DIFFRACTION	r_gen_planes_refined	0.004	0.02	4130
X-RAY DIFFRACTION	r_gen_planes_other
X-RAY DIFFRACTION	r_nbd_refined	0.231	0.2	2292
X-RAY DIFFRACTION	r_nbd_other
X-RAY DIFFRACTION	r_nbtor_refined	0.309	0.2	3615
X-RAY DIFFRACTION	r_nbtor_other
X-RAY DIFFRACTION	r_xyhbond_nbd_refined	0.175	0.2	250
X-RAY DIFFRACTION	r_xyhbond_nbd_other
X-RAY DIFFRACTION	r_metal_ion_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_metal_ion_other
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_vdw_refined	0.243	0.2	167
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_vdw_other
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_hbond_refined	0.222	0.2	15
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_hbond_other
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_metal_ion_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_metal_ion_other
X-RAY DIFFRACTION	r_mcbond_it	0.537	1.5	3579
X-RAY DIFFRACTION	r_mcbond_other
X-RAY DIFFRACTION	r_mcangle_it	0.67	2	5583
X-RAY DIFFRACTION	r_scbond_it	1.076	3	2118
X-RAY DIFFRACTION	r_scangle_it	1.633	4.5	1833
X-RAY DIFFRACTION	r_rigid_bond_restr
X-RAY DIFFRACTION	r_sphericity_free
X-RAY DIFFRACTION	r_sphericity_bonded

LS精密化シェル

解像度: 2.511→2.576 Å / Total num. of bins used: 20

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.402	89	-
R_work	0.305	1500	-
obs	-	-	83.11 %

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	1.8925	1.0224	-0.156	2.9837	1.1054	9.763	0.2582	0.298	-0.2037	-0.5097	-0.2431	-0.2226	0.6988	0.1337	-0.015	-0.0169	0.0462	0.0561	0.0933	-0.0297	0.0541	-7.823	-17.7202	-70.0754
2	7.2192	3.9049	4.4793	2.1122	2.4229	2.7792	0.1739	-0.3633	0.143	0.1473	-0.1102	-0.1739	0.2278	0.0691	-0.0637	0.0694	-0.0323	0.0299	0.2181	0.0004	0.1502	4.5293	-5.8821	-47.0574
3	4.0857	0.6119	-2.2475	1.8903	3.0179	15.7147	0.1766	-0.2891	-0.3045	0.0359	-0.0828	0.4422	0.3751	0.5308	-0.0938	-0.0383	0.0007	-0.0131	0.1207	-0.1075	0.1175	12.1563	2.7846	-26.8255
4	8.1285	2.7922	4.0087	3.1845	0.2708	3.376	-0.5492	0.1336	-0.5235	-0.5747	0.1708	0.4151	-0.0101	-0.4202	0.3785	0.1	0.0151	-0.0339	0.1527	-0.0611	0.1179	11.7895	2.0333	-18.1848
5	1.3267	0.7366	-0.9856	0.4089	-0.5387	3.984	0.0881	-0.2142	0.1593	-0.1806	-0.0356	0.1158	-0.0961	-0.1892	-0.0525	0.0128	-0.0047	-0.0304	0.0602	-0.0182	0.0989	16.8645	15.7663	-11.8173
6	7.1928	-3.6083	-4.831	22.3866	1.2728	3.309	0.2522	1.0611	0.7524	-0.316	-0.8825	-0.4278	-1.2944	0.2186	0.6303	0.2088	-0.0085	-0.0971	0.1229	0.0096	0.0857	24.9245	28.6197	-14.9749
7	2.7621	-0.9984	-0.1723	1.7515	0.1741	1.3999	0.1543	0.2618	-0.0643	-0.1293	-0.041	-0.081	0.0882	0.3336	-0.1133	0.0422	0.004	0.0127	0.1203	-0.0082	0.0323	27.1651	20.1073	-11.1386
8	2.1121	-2.1473	-0.1309	2.6145	-0.6189	1.3187	-0.056	-0.2802	0.0297	0.1743	0.08	-0.3088	-0.1258	0.2298	-0.0239	0.0161	-0.042	0.0082	0.1069	-0.0135	0.0507	28.8085	17.518	-0.3992
9	4.5689	-7.0378	-1.6448	12.0779	2.4905	0.5937	-0.0261	-0.0572	-0.0807	0.1034	-0.0425	0.3631	0.1054	-0.2382	0.0686	0.0173	-0.0045	0.0073	0.1231	0.042	0.0928	19.4121	15.2787	-3.1777
10	0.6373	2.0454	-0.8659	47.642	-10.4307	2.6019	0.219	-1.0677	-0.5062	0.2099	0.4448	-0.4808	0.2962	-1.5922	-0.6639	0.1588	0.0014	-0.0656	0.126	0.1041	-0.0463	25.3886	-1.5575	-4.5729
11	9.1266	4.9704	4.5392	7.5693	4.2937	7.1977	-0.1007	0.3972	-0.1807	0.0405	0.3442	0.0558	0.0157	0.2569	-0.2435	-0.0358	0.0606	-0.0005	0.0459	0.0436	0.0787	-20.1818	-13.8363	-61.8476
12	10.1107	6.0235	6.6745	8.2487	7.2832	6.7526	-0.4594	-0.5292	1.0227	0.7512	-0.1767	0.5924	-0.69	0.0059	0.6361	0.2177	-0.141	-0.0197	0.0444	0.0499	0.0127	-4.8193	-0.9362	-45.6561
13	1.1841	-1.8063	-0.425	2.7554	0.6483	0.1526	0.0416	0.7738	1.4956	0.4145	-0.123	1.0666	0.5273	0.1682	0.0814	0.2022	-0.1025	-0.1103	0.1746	-0.0818	0.1918	8.6427	10.9335	-29.4609
14	9.7045	4.0002	-4.8685	2.3984	-0.5523	5.2651	0.0119	1.2298	0.7043	-0.1063	0.1225	0.0616	0.1024	-0.4444	-0.1345	-0.0164	0.0208	-0.052	0.0574	-0.0303	0.0694	20.4717	15.8247	-20.4082
15	3.3502	-1.6601	1.2468	6.0218	0.7748	14.0256	0.4515	0.5262	0.2466	-0.4227	-0.5625	0.0106	0.5179	0.8904	0.111	-0.0224	-0.1029	0.0114	0.1293	-0.0409	0.0863	4.9418	11.078	-11.5538
16	5.6662	1.7293	-0.3515	2.8662	-1.488	0.8371	0.0939	-2.1173	-0.8743	0.3393	0.0872	0.0099	0.6397	-0.1462	-0.1811	0.3982	-0.0921	-0.2676	0.2219	-0.1377	0.3332	11.6551	1.0927	-9.032
17	4.981	-0.6723	0.3113	3.8224	-1.4742	4.625	-0.0625	0.331	-0.4994	-0.4279	0.1488	-0.0166	0.4604	-0.1806	-0.0863	0.0125	0.0137	-0.0249	0.0477	-0.1098	0.0018	-2.48	-0.2469	-16.2369
18	2.7789	-0.7978	1.1209	3.9775	-0.3932	3.6086	-0.0851	0.057	-0.1902	-0.0275	0.2792	0.4119	0.0902	-0.4866	-0.1941	-0.0287	-0.0382	-0.0338	0.0885	-0.0279	0.066	-8.4226	4.5311	-10.3941
19	6.8642	1.786	-0.8199	4.8146	0.6348	4.4894	-0.1092	-0.5498	-0.0943	-0.367	0.1291	0.2401	0.3375	0.0572	-0.0199	-0.0418	0.0414	-0.0063	0.0101	-0.0171	0.0875	-8.4872	10.6952	-4.7618
20	4.1215	-1.4844	1.235	8.8977	-5.2337	5.3849	-0.1341	0.1479	0.2314	0.029	0.0818	0.0667	-0.359	-0.0904	0.0523	0.0724	0.0155	-0.0238	0.0997	-0.0394	0.0452	-0.7669	13.6162	-9.4356
21	2.0941	-2.2551	-0.84	5.3569	-1.4258	5.4257	0.1289	0.15	0.3431	-0.428	0.0055	-0.3704	-0.2003	0.1962	-0.1344	-0.0135	0.0479	-0.0109	0.0607	0.0202	0.1325	30.7302	-28.5354	-49.6175
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33	2.534	-2.3511	-2.4219	2.1833	2.2011	3.3787	-0.3123	0.3389	0.0607	0.0195	0.0691	0.2946	0.4327	-0.2267	0.2432	0.144	0.0186	0.0503	0.1416	-0.0641	0.0711	9.4644	-13.1078	-5.3593
34	1.1204	1.4115	0.3805	3.9895	-0.5715	0.6286	0.0699	0.1002	0.0047	-0.412	-0.0198	0.1763	0.1201	-0.1299	-0.0502	0.1446	0.0366	0.0345	0.0636	-0.049	-0.0125	7.8382	-12.2713	9.3367
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39	7.3753	-0.6383	-1.239	2.6374	-0.401	5.2642	-0.1434	0.1094	-0.1564	0.1503	-0.0019	0.1323	0.7825	0.1143	0.1453	0.1613	-0.0427	0.0063	-0.0411	-0.0061	-0.0451	9.688	-29.6487	21.719
40	6.9898	-2.0838	1.4342	4.048	0.342	0.4671	-0.0622	0.3813	-0.4695	-0.2996	0.1523	0.3668	0.0922	-0.1348	-0.0901	0.0297	-0.0977	-0.0396	0.0718	0.034	0.0025	7.3654	-22.065	15.8635

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Auth asym-ID	Auth seq-ID
1	X-RAY DIFFRACTION	1	A	424 - 441
2	X-RAY DIFFRACTION	2	A	442 - 463
3	X-RAY DIFFRACTION	3	A	464 - 477
4	X-RAY DIFFRACTION	4	A	478 - 492
5	X-RAY DIFFRACTION	5	A	493 - 516
6	X-RAY DIFFRACTION	6	A	517 - 524
7	X-RAY DIFFRACTION	7	A	525 - 553
8	X-RAY DIFFRACTION	8	A	554 - 581
9	X-RAY DIFFRACTION	9	A	582 - 597
10	X-RAY DIFFRACTION	10	A	598 - 603
11	X-RAY DIFFRACTION	11	B	426 - 442
12	X-RAY DIFFRACTION	12	B	443 - 460
13	X-RAY DIFFRACTION	13	B	461 - 475
14	X-RAY DIFFRACTION	14	B	476 - 488
15	X-RAY DIFFRACTION	15	B	489 - 499
16	X-RAY DIFFRACTION	16	B	500 - 507
17	X-RAY DIFFRACTION	17	B	508 - 532
18	X-RAY DIFFRACTION	18	B	533 - 568
19	X-RAY DIFFRACTION	19	B	569 - 584
20	X-RAY DIFFRACTION	20	B	585 - 605
21	X-RAY DIFFRACTION	21	C	424 - 441
22	X-RAY DIFFRACTION	22	C	442 - 464
23	X-RAY DIFFRACTION	23	C	465 - 480
24	X-RAY DIFFRACTION	24	C	481 - 490
25	X-RAY DIFFRACTION	25	C	491 - 505
26	X-RAY DIFFRACTION	26	C	506 - 519
27	X-RAY DIFFRACTION	27	C	520 - 544
28	X-RAY DIFFRACTION	28	C	545 - 567
29	X-RAY DIFFRACTION	29	C	568 - 591
30	X-RAY DIFFRACTION	30	C	592 - 602
31	X-RAY DIFFRACTION	31	D	425 - 435
32	X-RAY DIFFRACTION	32	D	436 - 454
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36	X-RAY DIFFRACTION	36	D	508 - 520
37	X-RAY DIFFRACTION	37	D	526 - 542
38	X-RAY DIFFRACTION	38	D	543 - 563
39	X-RAY DIFFRACTION	39	D	564 - 583
40	X-RAY DIFFRACTION	40	D	584 - 604

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

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万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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