1.9 Angstrom resolution crystal structure of Se-methionine hypothetical protein SAOUHSC_02783 from Staphylococcus aureus
要素
Uncharacterized protein SAOUHSC_02783
キーワード
UNKNOWN FUNCTION / Structural Genomics / NIAID / National Institute of Allergy and Infectious Diseases / Center for Structural Genomics of Infectious Diseases / CSGID
機能・相同性
outer membrane lipoprotein receptor (LolB), chain A - #40 / Csa family / Csa superfamily / Csa1 family / outer membrane lipoprotein receptor (LolB), chain A / Clam / Mainly Beta / plasma membrane / Uncharacterized protein SAOUHSC_02783
モノクロメーター: Diamond(111) / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長
波長: 0.97856 Å / 相対比: 1
反射
解像度: 1.9→30 Å / Num. all: 20233 / Num. obs: 19583 / % possible obs: 96.3 % / Observed criterion σ(I): -3 / 冗長度: 4.3 % / Biso Wilson estimate: 23.2 Å2 / Rmerge(I) obs: 0.084 / Net I/σ(I): 16.4
反射 シェル
解像度: 1.9→1.93 Å / 冗長度: 4.1 % / Rmerge(I) obs: 0.438 / Mean I/σ(I) obs: 3.1 / Num. unique all: 1485 / % possible all: 80.3
-
解析
ソフトウェア
名称
バージョン
分類
Blu-Ice
Max
データ収集
PHENIX
モデル構築
REFMAC
5.5.0109
精密化
HKL-3000
データ削減
HKL-3000
データスケーリング
PHENIX
位相決定
精密化
構造決定の手法: 単波長異常分散 / 解像度: 1.9→28.89 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.949 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.924 / SU B: 7.746 / SU ML: 0.1 Isotropic thermal model: THERMAL FACTORS INDIVIDUALLY REFINED 交差検証法: THROUGHOUT / ESU R: 0.191 / ESU R Free: 0.178 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS U VALUES : WITH TLS ADDED
Rfactor
反射数
%反射
Selection details
Rfree
0.27143
1007
5.1 %
RANDOM
Rwork
0.21533
-
-
-
all
0.21801
18575
-
-
obs
0.21801
18575
96.8 %
-
溶媒の処理
イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å / 溶媒モデル: MASK