登録情報 | データベース: PDB / ID: 4df1 |
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タイトル | Crystal structure of orotidine 5'-monophosphate decarboxylase from Thermoproteus neutrophilus complexed with inhibitor BMP |
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要素 | Orotidine 5'-phosphate decarboxylase |
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キーワード | LYASE/LYASE inhibitor / TIM barrel / orotidine 5'-monophosphate decarboxylase / inhibitor BMP / LYASE-LYASE inhibitor complex |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
orotidine-5'-phosphate decarboxylase / orotidine-5'-phosphate decarboxylase activity / 'de novo' UMP biosynthetic process / 'de novo' pyrimidine nucleobase biosynthetic process類似検索 - 分子機能 Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / Orotidine 5'-phosphate decarboxylase domain / Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family / Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family / Ribulose-phosphate binding barrel / Aldolase class I / Aldolase-type TIM barrel / TIM Barrel / Alpha-Beta Barrel / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 6-HYDROXYURIDINE-5'-PHOSPHATE / NICKEL (II) ION / Orotidine 5'-phosphate decarboxylase類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | ![](img/tx_archaea.gif) Thermoproteus neutrophilus (古細菌) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 1.899 Å |
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データ登録者 | Fedorov, A.A. / Fedorov, E.V. / Desai, B. / Gerlt, J.A. / Almo, S.C. |
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引用 | ジャーナル: To be Published タイトル: Crystal structure of orotidine 5'-monophosphate decarboxylase from Thermoproteus neutrophilus complexed with inhibitor BMP 著者: Fedorov, A.A. / Fedorov, E.V. / Desai, B. / Gerlt, J.A. / Almo, S.C. |
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履歴 | 登録 | 2012年1月22日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 2013年1月23日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2023年9月13日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id |
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