1,2-ETHANEDIOL (EDO): WAS ADDED AS THE CRYOPROTECTANT.
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実験情報
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実験
実験
手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1
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試料調製
結晶
マシュー密度: 2.06 Å3/Da / 溶媒含有率: 40 % / 解説: NONE
結晶化
温度: 292 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / pH: 5.5 詳細: BY THE SITTING DROP VAPOUR DIFFUSION METHOD BY MIXING EQUAL AMOUNTS OF THE PROTEIN SOLUTION WITH A MOTHER LIQUOR CONSISTING OF 18% (W/V) POLYETHYLENE GLYCOL 3,350 AND 0.1 M SODIUM ACETATE (PH 5.5) AT 292 K.
モノクロメーター: KOHZU DOUBLE CRYSTAL MONOCHROMATOR (DCM), FEATURING INDIRECTLY WATER- COOLED FIRST CRYSTAL AND FLAT, LONG SECOND CRYSTAL プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長
波長: 0.95371 Å / 相対比: 1
反射
解像度: 1.2→35.3 Å / Num. obs: 45456 / % possible obs: 99.4 % / Observed criterion σ(I): 0 / 冗長度: 7.3 % / Rmerge(I) obs: 0.04 / Net I/σ(I): 26.7
反射 シェル
解像度: 1.2→1.26 Å / 冗長度: 6.4 % / Rmerge(I) obs: 0.43 / Mean I/σ(I) obs: 4.5 / % possible all: 96.2
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解析
ソフトウェア
名称
バージョン
分類
REFMAC
5.8.0069
精密化
XDS
データ削減
SCALA
データスケーリング
SHELX
位相決定
精密化
構造決定の手法: 単波長異常分散 開始モデル: NONE 解像度: 1.2→35.31 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.981 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.975 / SU B: 1.452 / SU ML: 0.029 / 交差検証法: THROUGHOUT / ESU R: 0.037 / ESU R Free: 0.037 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS. U VALUES WITH TLS ADDED. TRP 82, A KEY RESIDUE IN THE CARBOHYDRATE RECOGNITION SITE IS SHOWN IN TWO CONFORMATIONS THAT BOTH CORRESPOND TO LOW OCCUPANCIES.
Rfactor
反射数
%反射
Selection details
Rfree
0.15939
2281
5 %
RANDOM
Rwork
0.12715
-
-
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obs
0.12878
42890
99.37 %
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溶媒の処理
イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å / 溶媒モデル: MASK