登録情報 | データベース: PDB / ID: 4bol |
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タイトル | Crystal structure of AmpDh2 from Pseudomonas aeruginosa in complex with pentapeptide |
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要素 | AMPDH2 |
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キーワード | HYDROLASE |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase / Gram-negative-bacterium-type cell wall / peptidoglycan turnover / N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase activity / outer membrane / peptidoglycan catabolic process / metal ion binding類似検索 - 分子機能 Muramoyl-pentapeptide Carboxypeptidase; domain 1 / PGBD-like superfamily/PGBD / : / PGBD superfamily / Lysozyme-like / Peptidoglycan recognition protein-like / Ami_2 / N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase / N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase domain / N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase/PGRP domain superfamily ...Muramoyl-pentapeptide Carboxypeptidase; domain 1 / PGBD-like superfamily/PGBD / : / PGBD superfamily / Lysozyme-like / Peptidoglycan recognition protein-like / Ami_2 / N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase / N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase domain / N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase/PGRP domain superfamily / Peptidoglycan binding-like / Putative peptidoglycan binding domain / PGBD-like superfamily / Prokaryotic membrane lipoprotein lipid attachment site profile. / Orthogonal Bundle / 3-Layer(aba) Sandwich / Mainly Alpha / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 Chem-J0J / N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | PSEUDOMONAS AERUGINOSA PAO1 (緑膿菌) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 1.7 Å |
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データ登録者 | Artola-Recolons, C. / Martinez-Caballero, S. / Lee, M. / Carrasco-Lopez, C. / Hesek, D. / Spink, E.E. / Lastochkin, E. / Zhang, W. / Hellman, L.M. / Boggess, B. ...Artola-Recolons, C. / Martinez-Caballero, S. / Lee, M. / Carrasco-Lopez, C. / Hesek, D. / Spink, E.E. / Lastochkin, E. / Zhang, W. / Hellman, L.M. / Boggess, B. / Mobashery, S. / Hermoso, J.A. |
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引用 | ジャーナル: J.Am.Chem.Soc. / 年: 2013 タイトル: Reaction Products and the X-Ray Structure of Ampdh2, a Virulence Determinant of Pseudomonas Aeruginosa. 著者: Martinez-Caballero, S. / Lee, M. / Artola-Recolons, C. / Carrasco-Lopez, C. / Hesek, D. / Spink, E.E. / Lastochkin, E. / Zhang, W. / Hellman, L.M. / Boggess, B. / Mobashery, S. / Hermoso, J.A. |
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履歴 | 登録 | 2013年5月21日 | 登録サイト: PDBE / 処理サイト: PDBE |
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改定 1.0 | 2013年7月17日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2013年7月24日 | Group: Atomic model / Other |
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改定 1.2 | 2013年7月31日 | Group: Database references |
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改定 1.3 | 2024年5月8日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Other カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_database_status / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_database_status.status_code_sf / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_label_seq_id / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id |
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